在佛教問世後，佛教徒也采取了以蓮花為佛教的主要象征。據說後來成為佛祖的悉達多太子出世後，立刻下地走了七步，步步生蓮。所以蓮就成了他誕生的象征。從公元一世紀左右開始，佛祖的塑像便已常常是在蓮台上的坐像了，他的坐姿，或為蓮花坐或為吉祥坐，成為佛教僧人打坐時的典型坐法。按照大日經的解釋，“左足先著右上，右足次著左上，名為蓮花坐；單足著右上，名為吉祥坐。”佛教徒相信蓮能反應修行程度，認為高僧誠心念佛，則西方七寶池中即生蓮花一朵，若能精進，則其花漸大，倘或退惰，則其花萎落。又相信：“諸天人民以至蜎飛蠕動之類，往生阿彌陀佛刹者，皆於七寶池蓮花中化生。”
蓮隨著佛教，流傳到亞洲的每個角落。在爪哇的婆羅浮圖佛壇上，在緬甸的蒲日古城，泰國的素可泰市和高棉的吳哥窟等地的大廟裏，在斯裏蘭卡的鍾形塔裏，巴厘島的葬藍上和西藏的符籙上，都可以看到蓮的圖畫，西藏的喇嘛教佛教著名的六字真言：“唵嘛呢叭彌吽”中，其中的“叭彌”的意思便是蓮花。
蓮花在中國有深邃的文化淵藪。唐代將佛教立為國教後，蓮花備受人們敬愛。佛祖釋迦牟尼的家鄉盛產荷花，因此佛教常以蓮花自喻。在佛教中借用了印度教的象征意義，在佛教符號體係中，蓮花代表漂浮在欲望的汙水上，身體、言語和心靈的純潔。佛通常被描寫為坐在巨大的蓮花和蓮葉上。《本草綱目》載：“釋氏用為引譬，妙理俱存”。佛國也指蓮花所居之處。也稱“蓮界”。佛經稱“蓮經”，佛座稱“蓮座”或“蓮台”，佛寺稱“蓮宇”，僧舍稱“蓮房”，袈裟稱“蓮衣”等等。蓮花圖案也成為佛教的標誌。佛教的建築、裝修、器物也都有蓮花圖案。
蓮花與佛教的密切關係，還表現在佛教將許多美好聖潔的事物，以蓮花作比喻，以蓮花為代表。在佛教故事中，佛祖釋迦牟尼的母親，長著一雙蓮花般的美麗清亮的大眼睛。佛祖降生時，皇宮禦苑中出現了八種瑞相，其中最主要的一種瑞相，便是池中突然長出大如車輪的白蓮花。佛祖降生時，在他的舌根上放射出千道金光，每一道金光化作一朵千葉白蓮，每朵蓮花之中坐著一位盤足交叉，足心向上的小菩薩。
佛教以蓮為喻的詞語，更是數不勝數。佛座稱為“蓮花座”或“蓮台”；結跏跌坐的姿勢，即兩腿交叉、雙腳放在相對的大腿上，足心向上的姿勢，稱為蓮花坐勢；佛教宣傳的西方極樂世界，比作清淨不染的蓮花境界，故稱“蓮邦”；《阿彌陀經》描寫的西方極樂世界的情景是：“極樂國土有七寶池，八功德水……池中蓮花大如車輪。”故稱佛國為“蓮花國”；佛教廟宇稱為“蓮刹”。“刹”為梵語，即西方淨土，以蓮花為往生之所托，故稱“蓮刹”；念佛之人稱“蓮胎”，比喻住在蓮花之內，如在母胎之中；佛眼稱為“蓮眼”，以青蓮花比喻佛眼之好妙；胸中之八葉心蓮花稱為“蓮宮”，即心中的蓮花般的境界；釋迦牟尼的手稱為“蓮花手”；僧尼受戒稱“蓮花戒”；僧尼之袈裟稱“蓮花衣”，謂清淨無雜之義；五智中的妙觀察智稱為“蓮花智”；稱善於說法者為“舌上生蓮”；謂苦行而得樂為“歸宅生蓮”；佛經《妙法蓮花經》簡稱《法華經》，都是以蓮花為喻，象征教義的純潔高雅；東晉東林寺慧遠大師創立的我國最早的佛教結社稱為“蓮社”；佛教淨土宗主張以修行來達到西方的蓮花淨土，故又稱“蓮宗”。總之，蓮與佛教結了不解之緣，佛教在很多地方都是以蓮為代表，可以說蓮即是佛，佛即是蓮。
佛教為什麼如此推崇蓮花呢？這主要有兩方麵的原因：一、佛教產生於印度，印度這個地方氣候炎熱。荷花盛開於夏，給人們帶來涼爽和美的享受。人們對於這種夏季暑熱時盛開的美豔之花，自然十分喜愛，因此在印度的文學作品特別是民間流傳的民間文學作品中，蓮花都是美好、善良、聖潔、寬容大度的象征。這類故事非常之多，影響很深，如《蓮花王子的故事》，便將道德高尚、善良、正直、奉行為王十法（布施、持戒、慷慨、正直、和藹、自製、忌怒、忌殺、寬容和大度）的好國花比作蓮花。《蓮花王的故事》說蓮花王為了拯救百姓的饑荒，他跳進恒河之中，變成一條大赤魚，告訴百姓割他的肉吃，他的肉割了以後又生起來，這樣堅持了十二年，他用自己的肉供養全國百姓，度過長達十二年之久的災荒。《鹿母蓮花夫人》的故事，說鹿母蓮花夫人每走一步，腳後立即現出一朵美麗的蓮花，她一胎生下五百個童男，個個都是俊美的大力士，均是保衛國家的英雄，因此鹿母蓮花夫人成了能多生美男的象征。