妖書案
明神宗長子朱常洛的生母王氏原本是一普通宮女，在慈寧宮侍奉慈聖太後（明神宗生母）。有一天，明神宗來到慈寧宮向母親請安，剛好太後不在，神宗正要離開時，發現了清秀可人的王氏，於是私下臨幸。按照宮中規矩，皇帝臨幸宮女，應該賜一物件給對方，作為臨幸的憑證。但明神宗認為王氏是母親宮中的宮女，私下臨幸是一件不光彩的事情，所以沒有給王氏任何信物，自顧自地去了。誰知道這片刻風流後，王氏竟然懷上了龍種。慈安太後本人也是宮女出身，知道此事後不但沒有為難王氏，還十分高興地召來明神宗詢問究竟。但出人意料的是，明神宗竟然矢口否認曾經私幸過王氏。隻是這否認沒有什麼效果，皇帝的日常起居包括性生活都有專人記錄，明神宗臨幸王氏的事早就被記錄在《內起居注》中。實在無可抵賴了，明神宗才紅著臉默認了。
明神宗對王宮女的臨幸隻是一時興起，並不當真，新鮮勁兒一過，便不想負責任，因此他對王氏都沒有什麼感情。慈安太後卻是一位賢後，讓兒子立王氏為恭妃，並且告訴兒子說：“我已經年紀大了，但還沒有嚐過抱孫子的滋味，如果王恭妃生個男孩，這是宗社的福氣，母以子貴，可不能計較原先的貴賤啊！”
十月懷胎後，王氏生下了明神宗的第一個兒子——朱常洛。王宮人雖然被立為恭妃，但皇長子朱常洛一直沒有被立為太子。
萬曆十四年正月，寵冠後宮的鄭妃生下一子，取名朱常洵。鄭妃聰明機靈，明神宗與她情深意篤，一直保持終生。由於皇帝對鄭妃言聽計從，在很長的一段時間內，她一直是一個朝野注目的人物，並招致了幾乎所有人的唾罵。
因為鄭妃是皇帝的心尖，生了兒子後，明神宗立即晉封鄭妃為貴妃。大學士申時行等，認為皇長子朱常洛年已五歲，生母恭妃一直未聞加封，但鄭妃甫生皇子，即晉封冊，顯見得是鄭妃專寵。大學士們擔心將來定有廢長立幼的事情，於是上疏請冊立東宮，有“祖宗朝立皇太子，英宗以二歲，孝宗以六歲，武宗以一歲，成憲具在”之語。但明神宗在鄭貴妃的慫恿下，總想借機立朱常洵為太子，於是就想出了種種辦法拖延，但遭到大臣們的極力反對。當時太子又叫國本，因此，皇帝與大臣間的這次鬥爭又稱為“國本之爭”。大臣力爭，要立朱常洛為太子，明神宗一拖再拖，大臣再爭，爭了十五年，使得宮廷鬥爭變得錯綜複雜。
第一次“妖書案”便是在這期間發生的。
萬曆十八年（1590年），著名大儒呂坤擔任山西按察使，在職期間，他采輯了曆史上賢婦烈女的事跡，著成《閨範圖說》一書。宦官陳矩（後來執掌東廠，參與審理第二次“妖書案”）出宮時看到了這本書，買了一本帶回宮中。鄭貴妃看到之後，想借此書來抬高自己的地位，於是命人增補了十二人，以漢明德皇後開篇，鄭貴妃本人終篇，並親自加作了一篇序文。之後，鄭貴妃指使伯父鄭承恩及兄弟鄭國泰重新刊刻了新版的《閨範圖說》。
實際上，盡管第二版的《閨範圖說》與第一版有許多相同之處，但出書人的初衷卻有本質的區別，但逐漸有人開始將兩版書混為一談。
萬曆二十六年（1598年）五月，擔任刑部侍郎的呂坤上《天下安危疏》（《憂危疏》），請明神宗節省費用，停止橫征暴斂，以安定天下。吏科給事中戴士衡借此事大作文章，上疏彈劾呂坤，說他先寫了一本《閨範圖說》，然後又上《安危疏》，是“機深誌險，包藏禍心”，“潛進《閨範圖說》，結納宮闈”，逢迎鄭貴妃。呂坤平白無故地蒙受了不白之冤，立即上疏為自己辯護，說：“先是，萬曆十八年臣為按察使時，刻《閨範》四冊，明女教也。後來翻刻漸多，流布漸廣，臣安敢逆知其傳之所必至哉？……伏乞皇上洞察緣因《閨範圖說》之刻果否由臣假托，仍乞敕下九卿科道將臣所刻《閨範》與（鄭）承恩所刻《閨範圖說》一一檢查，有無包藏禍心？”