神奇寶貝鑽石與珍珠：對戰開拓區篇結束後，小遙為了獨自挑戰城都地區的華麗大賽和小智告別，小勝回到了橙華道館。小智則受到了小茂的鼓勵，獨自帶著皮卡丘和偷渡的長尾怪手前往神奧地區開始新的挑戰。
小智、小光和小剛3人的旅程並非一帆風順，他們在路途上遇上很多人和事，小智曾慘敗給真司，小光也曾在2次華麗大賽的第一次審查慘遭淘汰出局。幾經辛苦，小光終於集齊5枚緞帶徽章，她在神奧華麗大型慶典表示出色，首次參加便晉級至決賽，但在決賽以稍微差距敗於好友小望；小智亦集齊8枚徽章，他在神奧聯盟有好開始，在第1回戰打敗尚誌，第2回戰打敗某女路人，第3回戰(16強)打敗考平，8強更打敗真司，可是他無法勢如破竹而在準決賽慘敗於達克多，4強出局。
神奧之旅隨著神奧聯盟結束而來到尾聲，小智及小剛曾邀請小光一同前往關都地方，但小光因卷卷耳被邀請而不能前來，當天日落，小智在碼頭上和小光以最後一次擊掌道別，與皮卡丘及小剛乘船返回關都地方。翌日日出後，小智和小剛回到關都地方，在往真新鎮及尼比市的分叉路口，小智和小剛握手及互相祝福對方後正式告別。小智和皮卡丘終於看見真新鎮，他們跑進返回真新鎮前的最後一段路，神奧之旅正式劃上句號。
神奇寶貝：超級願望：講述小智和皮卡丘踏入新的冒險舞台——合眾地區，\x{00a0}這裏居住著許多他們所不知道神奇寶貝。當小智知道合眾地區神奇寶貝後，便馬上報名和踏上新的旅程，途中更遇上艾莉絲、牙牙與天桐，新的冒險就這樣開始了。而冒險隨之而來的是脫胎換骨的火箭隊，另外在尋找新的神奇寶貝以及新的邂逅的道路上，有更多的考驗在等著他們。
神奇寶貝XY：立誌成為神奇寶貝大師的小智帶著皮卡丘來到了卡洛斯地區，心中懷著新的理想告別了合眾地區的同伴天桐和艾莉絲，在卡洛斯地區與新認識的旅行夥莎莉娜、希特隆、柚莉嘉三人和新的神奇寶貝相遇的冒險故事。
2015年10月29日開始播出《神奇寶貝XY&Z》。2016年8月18日放送的「卡洛斯聯盟優勝小智的巔峰決戰」中，小智使用（粘美露龍、音波龍、甲賀忍蛙、戰鬥飛鳥、烈箭鶲、皮卡丘）在最後一戰超級甲賀忍蛙VS超級噴火龍中敗北，獲得亞軍。在比賽之後，閃焰隊對基格爾德實驗並暴走結束。
小智：《神奇寶貝》動畫全係列主角，年齡約10歲，出身於真新鎮，是個朝氣蓬勃、熱愛神奇寶貝的少年。在旅途中，通過夥伴神奇寶貝的幫助，小智逐漸成長，不斷磨練自己，挑戰道館，戰勝困難前往下一個城鎮，最終獲得石英大會的參賽權，雖然取得了16強的好成績，但小智並未就此滿足。他繼續前往新的地區旅行，與新的神奇寶貝邂逅，與新的夥伴們並肩作戰、共同朝自己的目標前進，接受新的挑戰。
神奇寶貝鑽石與珍珠：對戰開拓區篇結束後，小遙為了獨自挑戰城都地區的華麗大賽和小智告別，小勝回到了橙華道館。小智則受到了小茂的鼓勵，獨自帶著皮卡丘和偷渡的長尾怪手前往神奧地區開始新的挑戰。
小智、小光和小剛3人的旅程並非一帆風順，他們在路途上遇上很多人和事，小智曾慘敗給真司，小光也曾在2次華麗大賽的第一次審查慘遭淘汰出局。幾經辛苦，小光終於集齊5枚緞帶徽章，她在神奧華麗大型慶典表示出色，首次參加便晉級至決賽，但在決賽以稍微差距敗於好友小望；小智亦集齊8枚徽章，他在神奧聯盟有好開始，在第1回戰打敗尚誌，第2回戰打敗某女路人，第3回戰(16強)打敗考平，8強更打敗真司，可是他無法勢如破竹而在準決賽慘敗於達克多，4強出局。
神奧之旅隨著神奧聯盟結束而來到尾聲，小智及小剛曾邀請小光一同前往關都地方，但小光因卷卷耳被邀請而不能前來，當天日落，小智在碼頭上和小光以最後一次擊掌道別，與皮卡丘及小剛乘船返回關都地方。翌日日出後，小智和小剛回到關都地方，在往真新鎮及尼比市的分叉路口，小智和小剛握手及互相祝福對方後正式告別。小智和皮卡丘終於看見真新鎮，他們跑進返回真新鎮前的最後一段路，神奧之旅正式劃上句號。