（2）光照管理番茄是喜光作物，而冬季低溫期育苗時，光照時間短，且光照強度低，對秧苗生產極為不利。因此，在溫度允許的情況下，盡量早揭晚蓋草苫，以延長受光時間。要經常擦拭玻璃、塑料等透明覆蓋物以增加光照。有條件的可在溫室後牆張掛反光幕或其他方法補光。另外，要間拔過密的幼苗，加大秧苗間的距離，改善群體受光狀況。日光溫室育苗，還要經常調換南側與北側的秧苗，以保證其受光一致、生長一致。
（3）肥水管理在育苗過程中，為了控製徒長，可適宜控水“墫苗”，但水分不要過於控製，當子葉顏色變濃時，選晴天上午噴透水，以防產生老化苗。保持育苗基質或營養土濕潤，但不積水，每次灌水應盡量做到均勻，濕而不漏，防止養分淋失。秧苗心葉淡綠色標誌水分正常。苗期一般不進行追肥，如果出現缺肥或脫肥現象，以根外追肥最方便，葉麵噴施尿素、磷酸二氫鉀混合液對番茄有明顯壯苗作用。無土育苗時出苗前隻澆清水即可，出苗後開始施用營養液，苗期的營養液濃度通常為標準濃度的1br4～1br2單位，每天供液1次，每次全部浸濕苗盤基質，以底部開始滲漏液滴為宜。在溫度低日照時間短的情況下，以少供液為宜。如果是在高溫幹燥的環境下，每天可增噴1～2次清水，供液供水可根據天氣陰晴、溫度高低、通風大小和基質幹濕為依據，要勤供少供，既要避免低溫水多漚根，也要防止高溫缺水幹旱。
2.分苗
采用營養土育苗的，要在2～3片真葉花芽開始分化前分苗。出苗較密和已有猝倒病發生的秧苗，應當早分苗。以容器分苗最好。分苗的營養麵積要大些。至少應保證8～10厘米×8～10厘米。番茄分苗後要適當地提高氣溫與地溫2～3℃，以促進緩苗、生新根。白天氣溫24～26℃，夜間16～17℃，2～3天秧苗生出新根，並開始地上部生長。
分苗一方麵可以擴大秧苗的營養麵積，另一方麵由於莖上容易生出不定根，擴大幼苗的根群，增強苗根對水分與營養的吸收能力，對培育壯苗有利，因此番茄分苗中可適當深栽苗。一般適宜的栽苗深度是稍高於苗子的原土印，最大栽苗深度要求不埋沒子葉。而對於大苗可適當深栽，而低矮苗要適當淺栽。
3.苗期常出現的問題
播後土麵板結：播種後苗床表麵幹硬結皮，不利種子的發芽。已發芽的種子，由於土麵板結，不能順利出土，使幼苗彎曲變細，子葉發黃，成為畸形苗。造成原因：一是土質不好，土質黏重，缺乏腐殖質，結構不良，易發生板結現象；二是澆水方法不當。為此，播前配製床土，要多用疏鬆肥沃的腐熟土，覆土也要用這種培養土，或摻適量細沙及腐熟圈肥，播後至出苗前不澆水。
播後不出苗：一是種子質量太差，如失去發芽力的種子、染有病菌的種子都不能正常出苗；二是苗床不良的環境條件，在早春育苗時，溫度太低、濕度太大都會阻礙種子發芽，甚至使已發芽種子死亡。所以播種要選用優質良種，不用陳種，改善苗床環境。
播後出苗不整齊：種子質量不好，成熟度不夠，新陳種子混合，播種技術和苗床管理不好，如覆土厚薄不均、整地不平造成床土幹濕不均等均能導致播後出苗不齊。
幼苗帶殼出土：幼苗出土、種殼不脫落、夾住子葉，稱“戴帽出土”。由於子葉夾住不能展平，影響了光合作用，使幼苗營養不良，成為弱苗，原因是種子成熟度不夠，陳舊種子，床土幹燥，覆土過薄，種子上部的壓力太小，幼苗出土時子葉連同種殼一起出土，沒有從種殼中脫出等。所以播種時覆土應適當，而在發現有“戴帽出土”現象時應適時除去種殼，使子葉伸展，但摘除種殼時應小心操作，防止損傷子葉，影響秧苗正常的生長發育。