抗戰過後，嚴濟慈投入反內戰、爭取國內和平的民主運動之中。在國民黨的白色恐怖統治背景下，1948年，嚴濟慈出任北平科學工作者理事會長，加入九三學社，3月29日，嚴濟慈發表演講稱：“當前的情形實在令人恐慌，科學家已經到了寸步難行、寢食難安的地步了。”9月8日，嚴濟慈在北平研究院第二屆全國學術會議上又發表了題為“科學工作者的憤慨”的演說，稱“如今的形勢一天不如一天了，研究環境比十年前還要差”。
全國百姓對國民黨反動統治十分失望，國民黨在內戰中迅速失利，八百萬美械軍隊不到三年兵敗如山倒，為此，蔣介石政府準備遷往台灣。為抵製國民黨當局威逼利誘科學學者隨“國民政府”舉家遷往台灣的陰謀，嚴濟慈聯係了一大批科學家南下昆明。直到1948年底，北平獲得解放，嚴濟慈才回到北京城，開始了他的科學研究工作。
視教育為生命
嚴濟慈熱愛科學研究，熱愛祖國，同時，他對中國國民的教育問題也十分的關注。早年在讀大學期間，嚴濟慈就編著過多部教學教材，在四所高校任教期間，學生們很喜歡這位教授。
1932年至1937年，嚴濟慈任北平物理研究所所長時，為了能夠培養年青一代的科研人才，他每年都挑選兩到三名畢業大學生做弟子，對他們進行嚴格的要求。等到這些弟子具備獨立工作的能力時，嚴濟慈又大力推薦他們到英、法、美等發達國家深造。嚴濟慈先後培養的人才有陸學善、鍾盛標、錢臨照、翁文波、吳學藺等十餘人，這些人後來都成為中國著名的科學家。
40年代後期，因為抗戰和內戰的緣故，嚴濟慈沒有研究工作可做，於是編寫了一些教科書，先後出版了《普通物理學》、《高中物理學》、《初中物理學》和《初中理化課本》等書，哺育了中國幾代青年學生。即使到後來，他專心從事科研方麵的工作，也依然關心中國教育的發展。
1958年6月2日，中央通過了關於中國科學院創辦科技大學的請求，並在同年9月20日正式開學。那時，嚴濟慈已經年近花甲，盡管如此，他還是參與了學校的創建工作，從少年到老年，始終懷著推動中國教育向前發展的熱忱之心。學校創建完成後，嚴濟慈又回到了闊別三十年的講台，為學生們講授普通物理學和電動力學的課程。嚴濟慈學識淵博，講課生動精辟，他講的課程像磁石一樣吸引著學校無數學子，每逢嚴濟慈講課，學校最大的難題就是找不到足夠大的教室，因為聽課的學生眾多，教室容納人數有限，往往學校最大的階梯教室門外還站滿了學生。
1961年，嚴濟慈升任中國科技大學副校長，他打破理工分家的學科建設模式，著重培養既有堅實的理論基礎、又有實踐技能、科學創新意識和外語能力的綜合素質的人才，短短數年，嚴濟慈就讓剛剛成立不久的科大成為全國排名第四的重點大學。
1980年2月，嚴濟慈出任第二任科大校長，著手進行科大南遷和恢複的工作，為此嘔心瀝血，做出了卓著的貢獻。改革開放後，他又著手培養出一批真才實學的博士，學校各方麵的工作迅速恢複和發展，在國內外贏得了一片良好聲譽。1984年5月，嚴濟慈成為中國科技大學的名譽校長。1996年11月2日，嚴濟慈因病逝世，享年96歲。科大學子得知校長的去世，都是十分的悲痛。
嚴濟慈有這樣一句話，他說：“要教好書，除要有真學問外，一要大膽，二要少而精，三要啟發學生，識別人才。”嚴濟慈一生都在為國家培育人才，他的存在，意味著中國人自立自強，自強不息的精神。嚴濟慈將理論和實踐相結合，打破了傳統的教學方式，讓學子們可以多元化的發展，為國家做出了不可磨滅的貢獻。