世間有五顆神秘靈珠，分別為風、火、水、雷、土。靈珠之間，來曆也互不相同……
天地初開，盤古蘇醒，看天地一片混沌。隨著盤古身體不斷成長，看天地間一片渾濁，隨即用開天神器——盤古斧開辟天地，於是“清氣”上升為天，“濁氣”沉降為地；天地距離九萬裏。天地間靈力已經全部被盤古吸納進體內，盤古失去了生存的能量來源，逐漸委頓而死，其身體崩解，原本蘊藏在盤古身體內的“靈力”逸散，結合天地間光、色、型變幻成不同的形體，成為“神”，居於天。
而盤古骨肉沉降於地，形成山川。剩餘沒有成型的靈力則分解為水火雷風土“五靈”，散於天地之間。而盤古之心懸於天地之間成為連接天地的紐帶。
神不老不死，天地間又不斷有靈力聚合形成新神，因神為清氣所種，天地間清氣勝而濁氣衰，維持天地距離的清濁平衡被打破，因此天距離地越來越遠，並且有脫離大地而飛升之勢，這樣天將無法吸收地之靈力，天界的能量供給產生危機，神界將重蹈盤古的覆轍。
於是，神界因靈力最強被稱為“三皇”的伏羲、女媧、神農合三人之力，將大地上的五種靈力凝結成五靈珠，用靈珠的能量束縛天，令其不能遠離大地。使神界能夠繼續從大地獲得靈力的供給，而結果卻是靈力都被靈珠吸納，大地本身因靈力過度消耗而趨於崩解。三皇隻得還靈珠於地脈，令其維持住大地的形態。但是，由於靈力已經被聚集，大地原本的麵貌失衡，原本是處處山明水秀的大地，因受到靈珠地脈的影響，有些地方嚴寒而有些地方酷暑，水、火之災常常發生。五靈環環相克，生生不息，構成天地間力的源泉。
隨之時間的推移，千年之後的蚩尤開始叛亂，率獸等對付女媧所造的人，神族派神將軒轅氏和招喚五靈神對付蚩尤,後五靈神不願返回靈珠內,神界派女媧將其封印。靈珠擁有著世間最強大的五種靈力.倘若五靈連珠其力可吞日月,逆乾坤.然五靈久聚一起反而會破壞世間原有的生態秩序,引起大地原本的麵貌失衡，原本是處處山明水秀的大地，因受到靈珠地脈的影響，有些地方嚴寒而有些地方酷暑，水、火之災常常發生。
所以女媧在封印五靈神後施法將其分散在世間各地,以維持天地陰陽之平衡.五靈連珠隻是利用了五靈合一那種吞日月,逆乾坤的力量罷了,並不是把五靈珠永遠的聚在一起.當五靈珠的力量被利用後,為維持天地陰陽之平衡.五靈珠內被女媧所施的咒語再次啟動將五靈珠送往各地。
然而，女媧後人傳到巫後那一代時，發生了一些變故，五顆靈珠遺落各地，被一些妖怪給拾去占有了。曆史上曾出現過，但自從到了元朝，便不知所蹤。