灰原哀和增山雪根據柯南的基因製作APTX4869的解藥，柯南服用解藥之後變回了工藤新一。
工藤新一無比興奮的去找小蘭分享這個好消息，現在他已經不用瞞著小蘭了，可以把一切都告訴她了。
然而，得知了一切真相的小蘭並沒有顯得多開心，反而一拳轟碎了電線杆。
這天，工藤新一的慘叫聲直衝雲霄，繞梁三日，不絕於耳。
柯南變回工藤新一後，灰原哀猶豫了一下，沒有選擇吃下解藥，她過去的人生太壓抑了，現在好不容易有了重新開始的機會，她和姐姐也從組織的視角裏消失了，那就讓宮野誌保這個人徹底死去吧！以後她隻會是灰原哀了。
而另一邊，華夏的一個小縣城裏，一座自建的小別墅完工了，花園裏裏有兩隻毛色雪白的貓撒著歡，樓門口一男一女靠在躺椅上看著兩隻小貓。
“遠，你為什麼要辭職來這裏定居呢？想躲避組織的人追殺，應該有更好的選擇才對吧？”越水七槻用半生不熟的華夏語問道。
“因為很久很久以前，我在夢裏就夢到過這個城市，在夢裏這裏就是的家鄉，我一開始以為這隻是一個夢，沒想到這個地方居然真的存在。”
“夢裏的家鄉？難怪你對這裏這麼熟悉，這也太神奇了吧？”
增山遠笑了笑沒有說話。
這座城市何止是他夢裏的家鄉，前世他可是在這裏生活了二十多年的。
除了他去上大學的那個城市以外，這裏就是他最熟悉的地方了。
而眼前這棟小別墅，也是根據增山遠前世的記憶裏的樣子修建的，說是別墅其實更像是農家自建的小二樓。
看著眼前的這一切，增山遠有種不真實的感覺，仿佛他沒有穿越過，也沒有經曆這麼多的事情，但身邊躺著的少女卻告訴他，這一切都是真實的。
“遠，你以後都不打算回島國了嗎？”越水七槻問道。
“當然不是了，我可不是那種不負責任的人，等過段時間我會回去解決組織的事情。”
“過段時間？要過多久？”越水七槻問道。
“不會太久的，現在有公安和fbi在圍剿組織，讓他們先替我們打打頭陣。”
......
隨著柯南變回了工藤新一，柯學世界的時間重新開始流動了起來。
這天早上，少年偵探團和灰原哀一起從毛利偵探事務所前路過。
“遠哥哥的店關門這麼久了，還會不會開啊！”光彥看著增山遠的店感歎道。
“誰知道呢！那家夥說出去度假了，沒想到走了這麼久都沒有回來。”灰原哀沒好氣的說道。
“光彥，增山先生以後肯定會回來的，比起增山先生來，我更想柯南，他和父母一起離開了島國，轉學去了國外，這麼長時間了他都沒有給我們寫過信，不知道他過得好不好。”步美語氣哀傷的說道。
“步美，我們現在已經是二年級了，等我們升到高中的時候，柯南要是還沒有回來的話，我們修學旅行的時候就去他在的城市找他好了。”元太說道。
“那還要好多年啊！”
“過去這麼多年柯南說不定就先回來了呢！”光彥跟著說道。
步美聞言覺得很有道理，臉上重新露出了笑容。
四個孩子走後，工藤新一和小蘭才從一邊出來。
“都怪你，步美要傷心很久了。”小蘭對工藤新一說道。
“我也沒辦法啊！也不是我想變小的。”
“總之這件事就是你的責任。”
“誰說的？這件事不應該是組織的責任嗎？就算不是組織，也應該是藥物研發者灰原的責任吧？”
“誰讓你好奇心那麼重，你當時要是不追出去的話，就不會被喂下那種藥物了。”
兩人一邊吵著一邊走向了學校，對工藤新一來說，柯南隻是他人生的一段經曆，他從始至終都是工藤新一。
不知不覺一年過去了，剛剛高考結束的小蘭拉著工藤新一幫忙打掃著增山遠的店裏。
“蘭，為什麼要我打掃這家店？”工藤新一抱怨道。
“因為我之前答應增山先生了啊！”
“那是你答應的啊！又不是我。”
“你的意思是，我幫忙打掃，你就在一邊站著看著？”小蘭沒好氣問道。
工藤新一脖子一縮不敢說話了。
就這樣兩人賣力打掃了一下午，打掃幹淨後，工藤新一癱坐在地上說道：“累死了，增山先生也太會使喚人了，下次見到他我一定要讓他......”
“讓我怎麼樣？”
一個熟悉的聲音從門口傳來，小蘭和工藤新一不約而同的朝門外看去。
兩天後，歇業一年多的貓咖重新開業了，和以前一樣這間店的老板經常不在，不知道在忙些什麼。