在這些女子當中，如果論資格地位，囊囊太後排在第一位，她不僅出身蒙古郡王之家，而且是林丹汗的“正宮娘娘”。那麼，讓誰來娶尊貴的囊囊太後呢？
當然隻能是地位最高的皇太極。皇太極開始時也是推辭此事。但在眾貝勒的堅持接納之下，皇太極隻好答應了，將其迎入城內隆重迎娶。
由於娜木鍾地位尊貴，故在公元1636年，即清崇德元年冊封後妃時，被封為西宮麟趾宮貴妃，而比她早一年歸嫁皇太極的竇土門福晉，因地位不及娜木鍾，被封為次東宮衍慶宮淑妃，而早在公元1625年就已嫁給皇太極的原西宮妃布木布泰，則退居為次西宮，封永福宮莊妃。
蒙古的科爾沁部歸附後金最早。科爾沁部左翼首領、明安貝勒之兄莽古思於公元1614年將女兒送與皇太極為妻，這就是皇太極的中宮皇後孝端文皇後，也稱為哲哲皇後。滿蒙聯姻，進一步促進了其政治上的穩定關係。1629年，皇太極起兵征明，科爾沁部二十三位貝勒率領部眾追隨，為擊敗明軍立下了赫赫戰功。
1625年，科爾沁貝勒宰桑之子吳克善送呈妹妹布木布泰與皇太極為妃，即後來在曆史上大名鼎鼎的莊妃。宰桑貝勒是莽古思之子、中宮皇後的兄弟，因此莊妃是皇太極中宮皇後的親侄女。莊妃是順治皇帝福臨的生母，她一生經曆清初三朝，正是由亂到治的關鍵曆史時期。她全力輔佐皇帝，對調和清宮內部矛盾和鬥爭，穩定清初社會秩序，為促進國家的統一作出了重大貢獻。後世稱之為“清代國母”。
1634年，吳克善又送一妹至沈陽與皇太極為妃，這次送來的是莊妃的胞姐海蘭珠，被皇太極納為宸妃。至此，莽古思一門姑姑侄女三人同嫁一夫皇太極。
宸妃海蘭珠是皇太極的最愛，他以《詩經》中象征愛情的詩句：“關關雎鳩，在河之洲，窈窕淑女，君子好逑”，將宸妃居住的寢宮命名為“關雎宮”。宸妃的地位在五宮中位居第二，僅次於其姑母孝端皇後。但天妒紅顏，宸妃海蘭珠在三十三歲就病故了。皇太極為此悲慟欲絕，寢食俱廢，乃至昏死過去，經緊急搶救，才漸漸蘇醒過來。皇太極為宸妃舉行了隆重的喪禮，賜諡號為敏惠恭和元妃，這是清代妃子諡號中字數最多的。
自從失去宸妃，皇太極朝夕悲痛，飲食頓減，身體每況愈下，還常常“言語無緒”。後來，諸王大臣請他去到蒲河射獵，借以消愁解悶。不想，路過宸妃墓，觸景傷情，又引得他大哭一場。宸妃死後不到兩年，皇太極也命歸九泉了。皇太極對宸妃這種真情篤意，在曆朝皇帝中都是少見的。
滿清政權初期，儒家的那一套尚未完全占領其執政者的頭腦。在皇太極的後妃中，一個已經為他生過兩個女兒的側妃——蒙古紮魯特部代青貝勒之女博爾濟吉特氏卻被皇太極命令改嫁他人，嫁給了葉赫部的德爾格爾台吉之子南褚為妻。史載：“汗之第三福晉紮魯特部巴雅爾圖代青之女因不合汗意，給了葉赫部的德爾格爾台吉之子南褚。”皇太極作為一代帝王，卻做出令自己的妾妃改嫁的事情，令人匪夷所思，這在中國的封建帝王中是罕見的。