2050年6月3日，天空烏雲密布，世界上空都天雷滾滾，人們都出外麵看這百年難得一遇的奇景。
突然天空開始出現裂紋，不久之後“嘭”一聲天空出現了一個漩渦。一道聲音傳遍了世界各地。
“人類們，新時代將要來臨，口袋妖怪將要現世，歡迎來到我的遊戲世界，啊哈哈哈哈。”一個中年男人的聲音傳遍了大江南北。
人們開始昏昏欲睡，不久世界上的人類都沉沉睡去，在沉睡期間，天上降下數到光柱，將在大街上的人們都送回家裏。在每個人的太陽穴上，都出現一個像電影裏的虛擬眼鏡。而這一切的主使者到底是誰無人知曉。
而故事將在，吉林高官春市的一處小村莊開始。
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“啊！”秦子玉坐起來揉揉腦袋，根本就不知道發生了什麼，突然一道聲音傳到秦子玉的腦海裏。“訓練師，歡迎來到口袋妖怪的世界，我是空木博士，請打開你太陽穴上的虛擬眼鏡。”空木博士說道，秦子玉都愣了，你碰到這事誰不愣啊，
慢慢的秦子玉接受了這個現實，畢竟秦子玉是一個口袋妖怪的鐵粉，雖然隻有17歲。
秦子玉伸手點擊太陽穴上的虛擬眼鏡，虛擬眼鏡彈出一個透明的藍色鏡片，右眼裏出現了了五個精靈球，秦子玉有挑選精靈的經驗，把五個精靈球依次開了一遍，第一個是傑尼龜，第二個是小火龍，第三個是木守宮，第四個是小貓怪，第五個是利歐路。
秦子玉想了想，小貓怪絕對不行，小貓怪的最終進來是凱瑟貓，根本沒什麼好技能。木守宮，最終進化是蜥蜴王，技能倒也可以但秦子玉不想選這個。最後思來想去，最終決定小火龍，小火龍最終進化噴火龍，能學會噴射火焰，這是個很強大的技能，最主要的就是他能飛啊，你想想坐在龍上在天空中敖翔。咳咳，扯遠了。
當秦子玉選定小火龍後，秦子玉的手中憑空多出一個精靈球，左眼虛擬眼鏡掃過精靈球，虛擬眼鏡上出現這個球的信息，
精靈球（裏麵裝著小火龍）
主人：秦子玉
“咦！還有識別功能，神奇。”秦子玉心裏這般想到，他按動左手的精靈球中心的按鈕，喊出了他作為口袋妖怪鐵粉一直都想喊出的話，“出來吧，小火龍！”把精靈球拋向空地上，嘭一下，精靈球打開，小火龍從精靈球裏越了出來，秦子玉激動的把小火龍抱了起來。他終於見到活的了。
小火龍不解的歪著腦袋，這模樣甚至可愛，秦子玉把小火龍放了下來，並領著小火龍走出了自己的臥室，來到客廳，發現爸爸媽媽都坐在沙發上，一臉茫然。秦子玉上前推了推爸爸和媽媽，他們這才反應過來，“兒子，這是真的嗎，”媽媽問道。。
秦子玉高興的回答“當然是真的了，你看。”秦子玉把身後的小火龍抱到了前麵，“你們看，可愛吧。”媽媽歎了口氣說“哎！看來是真的，那空木博士說的，我們已經知道了。我們跟口袋妖怪無緣了，隻有14到18的小孩才能擁有精靈。”“嗯，我怎麼不知道，是因為我是老玩家的緣故。”
“算了，不想了。找曲洪達去，看他選的是什麼”