在整個改編過程中，難度最大的當屬人數眾多、編製繁雜的原台灣陸軍部隊，經過總參謀部與原台灣陸軍參謀部的聯合研究，最終原台灣陸軍被改編為第6集團軍和第8集團軍兩個集團軍司令部。其中第6集團軍為機動作戰部隊司令部，下轄改編後的第200摩步旅，第269摩步旅，第564裝甲旅，第66陸戰旅，第601空騎旅，第862傘兵旅，是澎湖軍區乃至中國軍隊麵向西太平洋地區的快速反應部隊。第8集團軍為支援作戰司令部，下轄第298摩步旅，第373機步旅，第586裝甲旅，第129步兵旅，第158步兵旅，第195步兵旅，第8炮兵旅，主要負責台灣本島的防禦作戰和支援第6集團軍的作戰。
原台灣陸軍保留下來的13個旅都是按照滿員旅的狀態進行編製的，鑒於原台灣陸軍缺乏先進的主戰坦克，在改編的時候，中國人民解放軍總裝備部特意調集了200輛的96A主戰坦克送到了澎湖軍區，用於裝備澎湖軍區三個摩步旅的裝甲營。而原台灣陸軍裝備的武器每個型號都挑出了一部分送到了總裝備部的武器試驗場進行試驗，對於大陸軍隊來說這是一個極其難得的研究西方先進武器裝備的機會，同時也是一個了解中國軍隊最為強大的對手的機會。
原台灣空軍下轄的6個戰鬥機聯隊和1個指揮部被改編為了六個戰鬥機聯隊，其中第5戰鬥機聯隊將被劃歸到華南空軍的戰鬥序列之中，第7戰鬥機聯隊將被劃歸到華北空軍，第2戰鬥機聯隊劃歸到中原空軍；剩餘的第1、3、4戰鬥機聯隊和第4獨立偵察機中隊、第20電子戰中隊組建為澎湖空軍的第52航空師。原台灣空軍的第101空運大隊將直屬於澎湖空軍司令部。第52航空師將與部署在澎湖和福建的第14航空師和第29航空師一起支撐起台灣上空的防空網。
原台灣海軍的變動最小，隻是打亂了之前的編製，使得變革之後澎湖艦隊更加適合應對周邊地區的突發情況。同時為了加強澎湖艦隊的戰鬥力，原東海艦隊抽調了一個039A常規潛艇中隊、一個056輕型護衛艦中隊和一個022導彈艇大隊加強到了澎湖艦隊。
“張師長，改編之後的中國軍隊還是稱為中國人民解放軍嗎？還是其他的稱謂？兩岸已經統一，解放軍這個稱謂是否會更改。”一名“海虎”特戰大隊的上尉開口問道。
張進勇大校注意到12名“海虎”特戰隊員的臉色都比較複雜，興奮中帶著一絲的失落。張進勇大校能夠理解他們的感受，台灣軍隊是繼承的中國國民革命軍的老底子，他們的戰史同樣值得驕傲，在八年抗戰中，他們的前輩們同樣為中華民族的獨立流盡了最後一滴血。現在這支部隊被改編了，為了祖國的統一大業，他們放棄了輝煌了數十的番號，與曾經的對手合並成了同一支部隊，共同支撐起共和國的安全保護傘。
“大陸與台灣統一了，但我們解放軍的任務並沒有結束。”張進勇大校嚴肅地說道，他指著西北方向，“那裏的藏南，北方的外蒙古，還有阻攔著中國艦隊進入太平洋的琉球群島！”
在場的所有官兵都被張進勇大校的話語所吸引，12名“海虎”特戰隊員更是目不轉睛地盯著張進勇大校，張進勇大校的手指指著東北方向豪氣萬丈，“這些地方都還處於他國的占領之下，等待著我們前去解放！”
在場的12名“海虎”特戰隊員為之一震，他們莊嚴地佩戴好最新的臂章，向著身後飄揚的五星紅旗和八一軍旗莊重地敬著軍禮。
就在這時，一陣低沉悠長的汽笛聲從遠處傳來，所有的官兵們聞聲望去，就在美濟礁的泄湖口處，兩艘體型龐大的戰艦正在引導船的指引下緩緩地駛進美濟礁中間的泄湖內。
菲律賓布拉幹省省會馬洛洛斯市，這座距離菲律賓首都僅60公裏的城市此刻卻聚集著大量的日本自衛隊官兵，根據日本菲律賓簽署的密約，這座城市將作為日本在菲駐軍的總指揮部。來自日本陸海空自衛隊的大量軍官、後勤人員和日本陸上自衛隊的第13機械化步兵旅團正部署在這座城市。