時間仿佛停滯了幾秒，好在妙蛙種子聰明，最後也明白了修亞的意思，把右前爪搭在修亞的手掌上，對其開心的叫道。
“種子！種子！你就我的訓練師了！”
修亞看著活潑開朗的妙蛙種子，心中突然湧起一陣莫名的波動，一股喜悅的情緒隨著波動傳來，正當修亞想要細細體會時，那陣波動又迅速的消失不見。
回過神來，修亞望著妙蛙種子那期待神情，便順著對方的想法說道：“妙蛙種子，我的精靈就決定是你了！”
妙蛙種子聽到修亞的回答，也開心的叫道：“種子！種子！”
見到修亞與妙蛙種子互相認可對方後，大木博士也欣慰的笑了笑：“精靈與人類的和諧相處，果然值得我研究一輩子啊。”
“把妙蛙種子收進精靈球吧，我現在要把精靈球上的安全鎖給解除一下，然後再給你登記精靈訓練師的資料”
見時間不早，等一下還有研究要做，大木博士便讓修亞登記一下精靈訓練師的資料，然後再給修亞一份新手禮包，好繼續昨天的研究課題。
修亞見狀，隻好與妙蛙種子解釋，妙蛙種子也很通情達理，主動進入精靈球中。
修亞登記完精靈訓練師的資料後，便從大木博士那領取到了所謂的新手禮包。
神奇寶貝圖鑒+1，精靈球+5，妙蛙種子專屬初級能量方塊+100，妙蛙種子專屬中級能量方塊+20
清晨九點十分。
修亞等大木博士把精靈球的安全鎖解除後，便拿著妙蛙種子的精靈球走出了大木精靈研究所。
“遇到夥伴的喜悅，想要保護我，希望一直在一起。”
大木精靈研究所前，修亞看著手中的精靈球，回想起之前感受到的情緒，不經陷入一陣沉思。
“羈絆的力量嗎？也許與小智的那隻甲賀忍蛙一樣，是人與精靈間靈魂共鳴。”
修亞不斷著思考，但也無法得出真正的答應，於是便把妙蛙種子從精靈球中放出。
一道紅光閃過，妙蛙種子好奇的打量著四周，當看到修亞的身影後，便開心的向修亞跑去。
修亞一把抱起跑過來的妙蛙種子，摸了摸妙蛙種子頭，認真的對妙蛙種子道：“也許是命中注定的邂逅吧，我們會一直在一起的！”
妙蛙種子仿佛明白了修亞的意思，把頭往修亞的懷裏靠了靠，開心的叫道：“種子！種子！”
與此同時，修亞的腦海中也想起了一道稚嫩的女聲：“主人！我會保護好你的！”