陳拓的命令一下達到第二軍，不少人都鬆了一口氣，就拿阮成峰來說，他最怕的就是陳拓拿第二軍殺雞儆猴，這個圓滑的軍師其實早已經看到了中華軍內部的一些小九九，在他看來，中華軍名義上的統帥陳拓其實在軍中的威望並不高，遠沒有達到一呼百應的程度，可是真正控製中華軍的是一個集團，一個一手由陳拓扶持起來的集團。一個由督帥、政務部（楊過）、總參謀部（王安等）三方組成的集團。這個集團分工極其明確，阮成峰不知道為什麼陳拓在本可以一手掌控中華軍的情況下，要搞出這種互相牽製的集團，他雖然控製著情報司和軍隊的調度，但總參謀部卻有監督和裁判之權，而且名義上各軍中影響力頗大的各級參謀也隸屬於總參謀部，更讓阮成峰費解的是，前不久，陳拓居然將一個很重要的後勤部劃給了參謀部“統籌”這一方麵意味著楊奉的直接上司名義上由陳拓變成了總參謀部，另一方麵在大宋邊境的萬裏征手上的龐大力量也將直接聽命於總參謀部，這可是中華軍的命脈啊。
阮成峰不喜歡總參謀部的那幾個老家夥，在陳拓進入天工院的這半年裏，總參謀部的幾個老家夥隔月就要派憲兵到各軍走一遭，他這個堂堂的一軍軍師竟然在眾目睽睽之下因為沒有起早操，被罰跑20裏。不過話說回來，這些老頭也就隻能在哪擺弄那些條條款款了，中華軍軍隊現在的實際掌控者除了陳拓便是方道齡了，說起來，這次接到的處分命令已經是阮成峰時隔半年才接到的第一封有陳拓署名的命令，以前都是方道齡的名字。
這一次陳拓“偷偷”利用手中總參謀長的權利，私自發布了對第二軍的處罰命令，對於總參謀部的幾位老參謀來說，打擊是巨大的。總參謀部一共有八位參謀，都是陳拓從四處請來的熟讀兵書之士，其中竟有四人來自大宋，兩人來自大理的會川郡，一人是建昌郡的名士，還有一人赫然是楊攀的老仆楊和（楊和的轉變後文將做解釋）。而這八個人的名義首領是總參謀長陳拓，實際上的首領確實王安，前麵提到過王安此人，他本是河南登封人，字子遊，自小熟讀兵書以“恢複國家”為己任，然而數十次大考，均名落孫山，最後一次本取得些功名，卻因姓名與當朝宰輔王安石重名需避諱，憤而離京，在京城外麵被陳振攔住，推薦到了中華軍中。王安為人正直不阿，陳拓也正是看重了這一點，才讓他出任總參謀部首席參謀的。這不，剛聽到對第二軍的處罰命令已經發出，王安就覺得這處罰不足以明軍紀，故而找到了其他七位參謀，穿好軍裝，一齊“殺到”天工院來。
一路上氣勢洶洶，天工院的衛兵沒人敢攔，此時陳拓正在天工院的藥石院看他們最新研製出來的高爆炸效果的火藥，這種火藥已經非常接近陳拓概念中的黑火藥了，不僅爆炸威力大，而且安全性大大提高，自從上次的“忠義銅炮”因為安全因素被放棄裝備火器營之後，一直讓陳拓耿耿於懷，光靠現在的火槍，火器營在戰場上根本沒有破壞力，也離他心目中的火器部隊差好多。這次這種高性能的黑火藥被研製出來，真的讓陳拓非常高興。正準備讓工匠們拿一袋到器械院去填充炮彈，試試新的忠義大炮的威力，一抬頭，竟然看到怒氣衝衝的王安和其他七位表情也很不忿的參謀。
“王參謀和幾位參謀，什麼風把你們吹來了？”說著，陳拓拍了拍些許還粘在手上的火藥粉，笑著走過去，拉起王安就往門外走，“這裏太嗆人，我們去廳堂說話。”
王安也不說話，看了其他參謀一眼，跟著陳拓就來到天工院中一個專供接待客人的簡陋廳堂中。陳拓吩咐人給幾位參謀看座，自己也拿了把竹椅坐在了旁邊。
陳拓笑著看看這幾位年紀都不小的老參謀，一個個仿佛受了委屈的小孩，除了王安和楊和，都不願意看著陳拓。而楊和這次也算是被裹挾而來，對於此次對第二軍的處罰，於公於私，他都覺得陳拓處理的可圈可點，更何況他也不想在這事上讓自己從前的少主有難堪。王安卻恰恰相反，在他看來，這事如果不處理好，不僅使得他們幾個人辛辛苦苦維護的軍紀成為一紙空文，更讓他當初不遠千裏來到中華軍實現他的治軍之路成為空想。剛來時，他看陳拓舍得放權，以為這是一個可是施展抱負的地方，但是一旦這次向陳拓妥協，那麼總參謀部將名存實亡。與其如此，不如打包回鄉，授業解悶。
陳拓既然已經知道這些人的來意，也做好了心理準備，隻不是對上王安的眼神，心理竟不免有些慌亂，臉上的笑也越來越不自然，以至於有些心虛起來。當初確實是自己將這八個本已賦閑在家的兵法家請出來的，不管是軟磨還是硬泡，他們總算將身家性命托付給了中華軍。而且陳拓成立這參謀部的也是處於三方麵的考慮，一來，他想讓中華軍成為一支紀律嚴明的鐵軍，但如果說靠他一個人依賴命令去鉗製官兵，不僅精力上花不過來，這樣的紀律也不牢靠，如果像有些人一樣，弄一個所謂八項注意之類的，有些太形式化了，沒有實際意義，隻有建立一個專門的機構，有一個專門的製度才能讓軍紀成為一個鐵律，因此他給了參謀部賞罰的權力，給了參謀們帶著憲兵考核全軍的權力，甚至給了參謀部後勤調配的權力。二來，他想讓參謀部成為一個控製他個人野心的機構，陳拓深知以自己的實力，是能夠絕對控製中華軍的，而且經過幾次勝利和現在大好的形勢，陳拓也越來越感覺到自己的欲望在膨脹，他害怕，因為這樣一來，一個獨裁的陳拓或許會創造一番偉大的功績，但改變不了中華民族幾千年來的一個大弊病，也許千年後，還會有那個在烈日下起早貪黑工作卻隻能拿微薄工資的陳拓，那他穿越回來還有什麼意義？他要的是徹底改變這一切，他要向中華民族的每一個人慢慢地灌輸平等、自由、公平、博愛的理念。這個理念當然要從中華軍開始做起，所以他躲進天工院，一麵與工匠們研究各種技術，一麵消磨自己日益膨脹的欲望。所以總參謀部的成立一方麵也是為了製衡自己。三來，總參謀的參謀都是文化知識比較高的一群人，他們一麵處理著自己職權範圍內的軍務，一麵還要負責為各軍培養各級參謀。這些參謀在學習了兵法、經史子集之後，還有一門必修課，作為結業的一門課，講解者正是陳拓，那就是《平等自由學》。本來陳拓想編一個教材的，後來發現自己沒有精力去專門編寫，而且口述起來更加方便，每個月都會有十幾個參謀來聽陳拓講課。也算是一種政治教育吧，他希望他的這些學生將來能整理一些東西來，不能什麼事情都讓陳拓做了吧。