火星曆5300年，也就是地球曆兩億五千萬年，繁盛一時的火星文明已稱霸半個銀河係。但在與一個潘多拉文明的交戰中，遭到了毀滅性的打擊！隻因為他們誤殺了潘多拉文明的二公主。母星被擊毀，兩百億人口化為塵埃。文明等級隻差一級，火星人本以為潘多拉文明的科技水平遠遠落後於火星文明，可以將其征服，使其成為火星文明的附屬文明。令火星人沒有想到的是，敵人在正麵作戰的的艦隊隻是為了牽製火星艦隊的主力艦隊。而另一支艦隊則繞過戰場，偽裝成民用飛船，直奔火星文明的母星。並帶著一種毀滅性武器，可以摧毀一顆行星，這種武器就是離子炮。一發離子炮所產生的能量是太陽釋放一周能量的總和。產生的衝擊波會造成毀滅性的地震，並使板塊互相碰撞。經過了一周的長時間躍遷，潘多拉艦隊終於到達火星文明的母星係—太陽係。火星人在跨入星際時代後，忽視了對母星的防禦。他們認為，太陽係地處銀河係邊緣地帶，是不會被其它文明發現的！母星上有火星近一半以上的人口，不過大多數都搬到了近地軌道中的太空城內。火星上隻保留了基本的火星文明建築、火星文明遺跡、火星文明數據中心，還有部分兵工廠，用於生產保衛太空城的防禦性武器！在火星軍用天文觀測台內，觀測人員發現了異常情況，立即拉響警報。火星總參謀部內，參謀長尼克正召開緊急作戰會議！他用全息影像播放了在太空中所觀測到的異常情況。他說到:“這是一次大規模空間擾動，我懷疑是蟲洞出現的征兆。”其它將領紛紛吐槽:你大半夜把我們叫來就為了說這個，大家快散了吧！耽誤大家的時間！沒等這個將軍說完，一個士兵便跑到尼克麵前:“報告長官，發現人造蟲洞，敵軍來襲！”尼克立即下達作戰指令:全體軍隊進入一級戰備，防禦係統全麵開啟。立即派出十艘偵察艦到達蟲洞附近。十艘泰坦級偵察艦從火星某軍事基地起飛，不到十分鍾便到達目標地域。這是因為火星人已經掌握了躍遷引擎技術和曲率航行技術！偵察艦先釋放了一千個探測器，布置在蟲洞附近。但下一分鍾讓所有人傻眼了，一艘近十萬米的巨型飛船出現在火星偵察艦的附近，火星人頓時傻眼了。十萬米的巨型飛船，簡直無法相信自己的眼睛。潘多拉文明已經掌握了空間擴容技術。所以可以將十萬米的飛船放在一萬米的民用飛船內。隻能怪潘多拉文明的人隱藏太深了，如果讓火星人知道潘多拉星人有這麼大一艘戰艦，無論如何都不敢開戰。潘多拉艦隊首先切斷了火星人的通訊，隨後釋放幹擾器，切斷了火星偵察艦隊的通訊。隨後，戰艦直接碾壓過去。直徑一萬亳米口徑離子炮迅速充能，充能需要十分鍾時間，潘多拉艦隊先派出十艘重巡洋艦摧毀火星人的防禦設施！尼克這才意識到，火星文明可能遭受毀滅性打擊。他下令:發射十二艘火種飛船，飛船上有火星文明所有的科技資料和火星文明的發展史，還有一台工業母機。隨後，尼克下令發動自殺式攻擊，為火種飛船的離開爭取時間。由於潘多拉艦隊發射了空間幹擾彈，使得空間非常不穩定，使火星人無法使用躍遷引擎，隻能采用常規動力。經過一波又一波的自殺式攻擊，火星艦隊終於殺出一條血路，使火種飛船順利離開。不過，隻有四艘火種飛船成功離開。一分鍾後，尼克發布一條空間廣播:尊敬的火星人民，我們的母星即將遭到毀滅性打擊，請全體人民全部轉入地下掩體避難！七分鍾後，離子炮發射，火星文明毀滅，消失在了浩瀚星河中。
正麵戰場，在潘多拉星係的一顆殖民星附近。火星人看上了這顆星球上有火星人需要的稀缺資源:氦晶礦。這是一種具有儲存能量功能的晶體礦，本身就蘊含著巨大的能量。是製作能量炮必不可少的礦物質。火星人的艦隊雖然規模龐大，是潘多拉艦隊的三倍，但在潘多拉星人的頑強抵抗下，這顆殖民星久攻不下。星空中到處都是戰艦殘骸，不過大多數都是火星文明的。因為潘多拉人隱藏了自己的真正實力。火星人的戰艦一個接一個被打爆，連指揮官都傻眼了。他想:三天前潘多拉艦隊不是被火星艦隊咬著屁股打嗎？他頓時恍然大悟:原來隻是誘餌。剛開始，火星艦隊占上風。但隨著資源的消耗，戰局進入白熱化。雙方艦隊整整激戰了五天五夜，戰艦的殘骸到處都是。火星艦隊還有二十四艘戰艦，潘多拉艦隊還有十二艘戰艦。火星艦隊組織十四艘驅逐艦向潘多拉艦隊發動自殺式攻擊，終於消滅了潘多拉艦隊，占領了這顆殖民星。