第二日一早，楊廣便下詔，將遼東新平之地設置為遼東郡，至於原遼東郡則改名為玄菟郡。設遼州總管府，統轄遼東郡、玄菟郡、燕郡三郡軍事。
楊廣沒有留下李景鎮守遼東，在他看來，雖然李景資曆更高，但也容易在遼東割據。而且將李景留在遼東，等到黃明遠回來之後，反而容易與黃明遠爭權。
楊廣以黃明禎為檢校右禦衛大將軍，遼州總管，鎮守遼東之地，表示了對黃明遠的充分信任。而黃明禎年輕，威望不足，也很難在遼東進行割據。
楊廣又以觀王楊德雄三子通事舍人楊續為燕郡太守，以崔弘升的五弟左監門郎將崔弘壽為玄菟郡太守，遷達奚暠為遼東郡太守。楊續、崔弘壽三人不是皇親國戚，就是功勳之後，如此安排既保證了三郡的政令通達，又使得三人因為身份，不可能叛亂。
又設副總管一名，以楊廣昔日舊將史祥擔任。
史祥昔日是楊廣心腹，隻是後來為楊廣所厭惡，隻擔任左驍衛將軍，比隋文帝時還低。及遼東之役，史祥奉命出蹋頓道，不利而還，由是除名為民。這一次若不是走通了虞世基的路子，還不能複職。
不過遼東之兵，盡是黃明遠所統帥，史祥在黃明禎這裏，也就隻剩下一個資格老了。
遼州總管府特設與幽州同級，因此置四名虎賁郎將。黃明遠倒是不藏私，以黃明溥、李進、劉黑闥、高聶四人任之，除了堂弟黃明溥，都是他豐州的舊部。現在利益爭奪已經到了刺刀見紅的時候，也顧不得其它了，遼東要保持穩定，勢必要控製全部軍隊。
對於北麵的胡人，楊廣雖然並不在意，但還是聽從了黃明遠的建議。黃明遠信誓旦旦，這種時候，自然得聽。
因此以薛世雄調任代州總管，李景兼任平州總管，鄭言慶繼續擔任豐州總管，王仁恭繼續擔任朔州總管，鄧暠則繼續擔任營州總管。
其餘隨黃明遠征討遼東之人，也各有獎賞。雖然楊廣很想賴了此事，但黃明遠卻言，若要平叛，還需要各軍奮勇爭先，此時切不可給楊玄感拉攏諸將軍之機。
楊廣隻得同意。
五月十三日，黃明禎也趕到了遼東城。
他率四萬主力奉命東進木底城，已經破之，兵鋒直指國內城。後來黃明遠急信，黃明禎這才趕緊撤回了木底城。
黃明禎所部一路東進，直到木底城下。木底城守軍根本沒有防備薑以式敗的這麼快，且城中兵力也沒有多少，因此不備之下，被黃明禎所趁，搶占了城池。
占領木底城之後，黃明禎乃繼續向東，劍指國內城。
國內城是高句麗遷都平壤之前的都城，為都城四百多年。其與高句麗第一個都城紇升骨城、尉那岩城，相互依托，共同組成高句麗的國內城防線。
這裏也是高句麗首相淵太祚的老巢，淵太祚在此統禦高句麗的北方部落，並與高元分庭抗禮。
此時從木底城通往國內城的道路有兩條，一條是北道，地形平闊；一條是南道，地勢險要狹窄。此時隋軍人馬、裝備眾多，眾人都想走北道。