叛軍全部兵力，發起反擊，不過實力與明軍相差太大。
雖計劃出奇不意，但是士卒實力不夠，無法徹底執校
南城的十餘萬人，沒有徹底牽製住明軍主力，而攻擊趙銘大營的精兵，也沒能擊潰趙銘的本陣。
趙銘拿起鐵棒，一度準備親自拚殺，不過叛軍最終沒有達到逼迫趙銘親自動手的地步。
看著趙銘援軍殺來，朱以海心灰意冷，匆忙撤回城中，而明軍則趁著奪城，李成棟趁機從太平門殺入，第一個攻入了南京。
朱以海逃進皇城，身邊的兵馬，一哄而散，隻餘數十名心腹，擁著朱以海進入皇宮。
這時，皇宮內，到處都是抱著包袱，慌忙奔走的太監和宮女，一副王朝滅亡的末日場景。
朱以海一把抓住一名逃跑的太監，赤紅著眼，厲聲喝問，“皇帝呢？”
太監驚恐道：“陛下～陛下好像去了後庭乾清宮。”
朱以海將太監推倒在地上，提著寶劍，便往後庭而去。
不多時，一行人來到乾清宮，殿內同樣一片狼藉。
“陛下，出來！”朱以海提劍怒吼，整個人已經陷入癲狂。
大軍戰敗，朱明宗室將遭受清洗，趙銘身前以無障礙，朱家江山已經完了。
朱以海決定帶著朱由榔一起去死，不能讓趙雜毛，將朱由榔玩弄於股掌之間，使得朱家成為笑柄。
再者，在朱以海看來，趙銘以大明忠臣自居，扶立朱由榔，肯定是想玩王莽、曹丕那套，搞禪讓的把戲。
雖朱以海敗了，但是他不能讓趙銘如意，必須帶著朱由榔一起死，讓趙銘背負，逼死國君的惡名，怎麼洗都洗不幹淨。
“陛下！”朱以海提劍大喊，空曠的大殿，卻沒有回應，隻有他的聲音回蕩。
這讓朱以海心頭暴怒，厲聲嘶吼，“朱由榔，你給孤滾出來。”
空殿內依舊沒有聲音，更不見朱由榔的蹤跡，這位皇帝，早發揮自己的才能，不知道躲哪兒去了。
朱以海在乾清宮找了一遍，不見朱由榔的身影，又聽見城中喧嘩，知道趙銘的人馬已經進城。
悲憤之下，朱以海一行又來到供奉大明曆代先皇的奉先殿，而後命人召集朱姓宗室來到大殿。
不過，宗室們早已爭先逃命，最後隻有朱以海的家人，還有十多名宗室前來。
這時，喧嘩聲已經從內郭，蔓延到皇城，大股的明軍衝入皇宮。
朱以海遂即令人封閉殿門，披頭散發，跪在靈位前，叩首大哭，“太祖皇帝，大明列祖列宗，不孝子孫，未能守住家業，令賊臣竊取神器，無顏見祖宗於地下啊！”
朱以海雙目啼血，悲痛至極，在大殿中，狀若瘋癲。
這時，李成棟率領大軍，首先進入皇城，他揮刀怒指，殺氣騰騰，朗聲大喝，“搜，抓住朱以海，本將重重有賞。”
士卒跑步入城，卻忽然見奉殿方向，燃起熊熊大火，滾滾濃煙，衝而起。
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