海外的一個孤島上，鳥語花香的原始森林，一個身影修長的女子漫步在其中。女子身穿一件黑色緊身衣包裹著誘.人的身材，下.身一條同色係的緊身長褲勾勒出纖細的長腿，一條鑲著鑽石的暗紋皮帶定在胯間，腳下一雙黑色高跟短靴，長發染成漸變的棕色用長繩紮在腦後，精致的麵容被一個大大的墨鏡遮住。很難想像這樣時尚類似於模特的女子會出現在這裏，12厘米的高跟鞋從容的在沒有道路的森林裏走著……女子站定在一個毫不起眼的圓形石板上，緊接著是石板轉動的聲音，眨眼間，那女子便沒.入地下，地麵上的石板合起，絲毫看不出痕跡。
電梯下降到12層停下，女子走出，高跟鞋踩著地麵的聲音響起在這個明亮的走廊裏，走向一麵銀色的牆，瞳孔瞄準，滴滴！兩聲後，身份確認！牆麵從中間向兩邊縮入，出現了一個僅容一人的通道，女子走進去，身後的牆再次閉合。眼前是一個百人會議室，而整個會議室卻隻坐著不到20個人。女子進.入後沒有停頓，直接走向左前方第一個位置，坐下後才拿下戴了許久的墨鏡。看著首座上那位不鹹不淡的說道：“任務完成了，我可以放假了吧？”
這是一個建立在海底的神秘組織，它具體有多大很難估計，這裏的整片海域都是這個組織的地盤，而那座孤島隻是這裏的入口之一而已。女子自有記憶以來就在這個組織裏，每天都安排著超乎常人的訓練，她不但要學20個國家的語言，還有各種天文地理，甚至包括各種偏門學科。而然最重要的是每天都必修並且重複的一項，學習怎樣殺人！是的，她是一個殺手，這個組織的王牌殺手！她沒有名字，隻有一個讓人聞風喪膽的代號：黑蓮！
13年前，黑蓮在15歲的時候已經把所以組織安排的內容都學會了，15年習慣性的學習讓她有著超乎常人的記憶力，幾乎看到的東西就會自動形成高清的畫麵永久的存入她的腦海中。
當年15歲的黑蓮是組織內部SS級畢業生中唯一的一個女性，那時她隻是代號SS0391，標誌著她是自組織成立以來第391個SS級畢業的新人。而黑蓮這個稱號，隻是之後一次殺完人後閑著無聊隨手畫下了一朵黑色的蓮花而來的。
當時15歲的她就要走出這個海底，去執行她殺手生涯的第一個任務。
呆在暗無天日的地方整整15年，每天麵對的都是和自己一樣的孤兒和超額量的訓練，無論是誰，都會對外麵的世界抱有一種激動和期待！
拿著組織給的高科技通訊器，無論多麼可怕的事都遇到過卻任然存留一絲純真的黑蓮來到了大陸上，遠離海岸和訓練，呼吸著新鮮的空氣，帶著大大的笑容，好奇的走在大街上。
嘀嘀嘀！通訊器響起。
代號SS0391，任務：明天早上7點之前到xxx莊園。
第二天到達目的地之後，黑蓮被蒙了眼睛帶上一輛車，下車之後她就被推入進一個森林裏。這時候任務來了：在一周內殺死所有的人，唯一留下來的人完成任務。之後的時間裏，黑蓮遇到了之前和她一起畢業的那些SS級新人，所有的SS新人都會在這裏進行一場廝殺，隻存活一個！
麵對和自己同甘共苦一起生活了十幾年的同伴們，黑蓮壓下心底深深的憤怒和悲哀，隱藏在角落裏依靠獵殺動物過了5天。最後2天時間，通訊器提示，還剩下最後5人，並且共享了所有人的地理位置。綠點是自己，4個紅點分部在不同的地方。
遇到這樣的情況黑蓮心裏極度驚訝，100個SS級畢業新人隻剩下了5個？！就在這時通訊係再次響起：代號SS0391，至今1人未殺，如果最後存活的人從未殺死過一人，依舊任務失敗，組織會進行抹殺！這樣的訊息同時也被其他4人收到。
SS0367：“喲！那女人竟然一個人都沒殺呢，我可要好好找到你！”
SS0345舔了舔嘴唇，綻放一個嗜血的笑容，毫不猶豫的向標有SS0391的地方移動。
1天後，黑蓮幹掉了2人，她雖然是100人中唯一的女性，但她的手段卻也同樣和其他人一樣優秀。
還剩最後2人了，黑蓮坐在一棵樹上，看著向自己快速而來的紅點，那是SS0399，是所有人中厲害的一人，黑蓮最不願意和他碰麵，如今他直奔自己而來，看來不可避免要決一死戰了！
兩人的見麵，一句廢話都沒有，直接上手攻擊！招招致命！各種格鬥技巧被運用的淋漓盡致！良久，兩人都氣喘籲籲的看著對方，保持著最佳的攻擊距離。果然SS0399太厲害了嗎，黑蓮已經沒有一戰之力了，眼前已經變得昏暗，要在這裏死掉了嗎？