太子治柔腸百轉，涕淚交流，嗚嗚咽咽哭個不停。李世民伸出一隻手，擱到他的肩上，語重心長地告誡說：“接管朝廷，治理天下，朕的體驗是，虛己求諫，則功業興隆。然而忠言逆耳，並不那麼順心遂意。一旦言路閉塞，任情恣性，必然走上窮途末路，導致國破家亡。”
“兒臣牢記在心，一定慎之又慎。”“任賢納諫，是成敗得失的關鍵，也是朕的最後遺言。”
李世民喉嚨管呼嚕呼嚕地響，極不舒服地扭歪了臉，示意大小楊妃抽出墊高的枕頭，把他放平躺下，令褚遂良草擬遺詔。默認遺詔後，李世民有氣無力地闔上了眼睛，像是睡著了一樣永遠地睡過去了——譽滿九州內外的明君、天可汗，走完了人生的曆程，走進了曆史。享年五十二歲。他的崛起，充滿了傳奇色彩，留下了許多美麗動人的故事和傳說，受到史家及民間的推崇、頌揚。蓋世英主，幾個世代難得出現一次。夏商周三朝，將近二千年，九十位君主，有明顯作為而被後世稱道的，不過六七人而已。李世民掃除隋末的災亂，行狀猶如商湯王、周武王；政治清明，君臣同心同德，百姓安居樂業，幾乎可以媲美周成王、周康王；雄才大略，開拓疆土，比漢武帝有過之而無不及；廣開才路，知人善任，從諫如流，尤其值得大書特書，簡直可算他的一項“專利”——在曆朝曆代的帝王中，再沒有第二人。雖然難免這樣那樣的不足和過失，但自西漢以來，功德兼備的皇帝，非他莫屬。
“嗚嗚，皇上駕崩啦！”聽到禦醫和內侍撕心裂肺般的哭喊聲，太子治驚駭得如五雷擊頂，抱住舅父長孫無忌的脖子失聲哀號，幾乎昏厥。長孫無忌拭去眼淚，敦請太子立即接管朝廷，安撫內外。太子悲傷得如萬箭鑽心，不能自持，止不住痛哭。長孫無忌眉峰一聳，正色道：
“皇上將宗廟社稷交付給殿下，殿下怎麼能跟常人一樣，隻會哭泣？”
褚遂良等替李治擦掉淚痕，扶著他坐下來。他們商議了一通，決計封鎖李世民薨逝的消息，秘不發喪。李世民的遺體用蘭湯洗抹幹淨，又照樣仰放在禦榻上。由李治和長孫無忌、褚遂良等大臣守靈。次日，長孫無忌等人請求太子先行返回首都長安。飛騎、精銳禁衛和保駕將軍，儼然臨陣一般全身披掛，護送車駕從太和穀翠微宮啟程。途中，又增加了持戟佩劍的六府將士四千名，排列成方陣，護衛太子。太子進入京師，大行皇帝的遺體依舊使用他的禦駕，鹵簿儀仗都跟平時一樣，緊隨其後進城，停放在兩儀殿。接著以李世民的名義頒發詔書，擢升太子左庶子於誌寧做侍中，少詹事張行成兼侍中，右庶子、檢校刑部尚書、兼吏部侍郎高季輔代理中書令。
二十九日，以太極宮正衙太極殿做殯館。殿內懸掛黃龍錦帳，外披白綾圍幔，梓宮停放在當中。靈前設置鋪著黃緞繡龍褥子的花梨木寶榻。寶榻前麵設花梨木供案，上置銀香鼎、燭台和花瓶。供案前排開三個花梨木香幾，中間的幾上放置著銀燭檠羊角燈，兩旁分設蓮花瓶案和諡冊寶印案，以及早、晚膳案和供果案。殿門外陳設儀仗器物，左側置金緞繡龍的引幡。安置畢，入殮，發喪——正式發布李世民駕崩的噩耗。宣讀遺詔：太子李治即皇帝位。軍國大事，不可停頓。朝廷日常事務，委托有關官署衙門處理。取消遠征遼東及規劃中的土木工程項目。
王公大臣身穿孝服，步入太極門，進殿瞻仰大行皇帝的遺容，隨同嗣皇帝李治行大殮禮。諸王在外地擔任都督、刺史的，允許前來奔喪。但濮王李泰例外。
四外各國和少數民族在朝做官的，以及前來朝廷進貢的國家和部落的首領或使節，好幾百人，聞聽天可汗山陵崩，心如刀絞的疼痛，難過得肝膽欲裂，哭得天愁地慘。他們依照各民族的風俗，有的剪去頭發，有的用刀劃破臉，有的劃開胸口，有的割裂耳朵，有的叩頭撞壁，碰得鼻青臉腫、嘴巴鼻孔流血，弄得地麵血跡斑斑。
六月一日，李治正式登極稱帝。大赦天下。敕命長孫無忌當太尉，檢校中書令，並掌管尚書、門下二省事。無忌固辭尚書省事，李治準許，仍命他以太尉身份兼任同中書門下三品。下詔擢升疊州都督李世勣作特進、檢校洛州刺史、兼洛陽宮留守。從前，李世民因是雙名，天下除了不準用相連的“世民”二字以外，不避諱個別使用“世”字或者“民”字。現在，開始更改忌犯先帝名諱的官名。李世勣首當其衝，改名為李勣，去掉了其中的“世”字。不久，又擢升李勣當開府儀同三司、同中書門下三品。後來又改命他作左仆射。