天地混沌如雞子，盤古生其中。萬八千歲，天地開辟，陽清為天，陰濁為地。盤古在其中，一日九變，神於天，聖於地。天日高一丈，地日厚一丈，盤古日長一丈。如此萬八千歲，天數極高，地數極深，盤古極長。後乃有三皇。數起於一，立於三，成於五，盛於七，處於九，故天去地九萬裏。
盤古以盤古幡劈開混沌，以太極圖定地火風水，分清濁乾坤，開辟洪荒世界，演變六道輪回，生生不息。盤古無力支撐開天地力量而薨，元神分化三清是為太上老君、元始天尊、通天教主。那身體精血大部分便化為十二祖巫，還有一小部分流轉於六道輪回之中。那六道輪回的盤古精血隨那些人類，妖族的輪回，附著於魂魄之上，再出生來，便有天生神通，是為大巫。
十二祖巫無元神，然天生肉身強橫無匹，吞噬天地，操縱風水雷電，填海移山、改天換地。
當十二祖巫一個不差聚集在一起使用十二都天神魔大陣的時候，可凝聚出盤古真身，開天辟地，毀天滅地，聖人之下鮮有其匹。
十二祖巫其一狀如黃囊，赤如丹火，六足四翼，渾敦無麵目；是為帝江，掌空間速度。
其二青若翠竹，鳥身人麵，足乘兩龍；是為句芒，掌木。
其三人麵虎身，身披金鱗，胛生雙翼，左耳穿蛇，足乘兩龍；是為蓐收，掌金。
其四蟒頭人身，身披黑鱗，腳踏黑龍，手纏青蟒；是為共工，掌水。
其五獸頭人身，身披紅鱗，耳穿火蛇，腳踏火龍；是為祝融，掌火。
其六八首人麵，虎身十尾；是為天吳，掌風。
其七嘴裏銜蛇，手中握蛇。虎頭人身，四蹄足，長手肘；是為強良，掌雷。
其八人麵鳥身，耳掛青蛇，手拿紅蛇；是為龠茲，掌電。
其九人麵蛇身，全身赤紅；是為燭九陰，掌時間。
其十人麵獸身，雙耳似犬，耳掛青蛇；是為奢比屍，掌天氣。
其十一人身蛇尾，背後七手，胸前雙手，雙手握騰蛇；是為後土，掌土。
其十二乃一猙獰巨獸，全身生有骨刺。是為玄冥，掌雨、殺戮。
若幹年後，人間界中，祖巫好戰，共工與祝融不知何故在不周山大戰，雙雙身殞，其間共工怒觸不周山，天柱斷，頓時天塌地陷，天火從天而降，天河倒灌，女媧補天，所用的五彩石碎片落於洪荒之中。巫族剩餘十祖巫：帝江、句芒、蓐收、燭九陰、強良、奢比屍、天吳、弇茲、玄冥、後土。
東皇十子犯過天條，十日齊出遊曆太古洪荒大地，生靈塗炭。隨後由於東皇責罰過輕，大巫誇父不滿，行逐日之事，東皇十子殺誇父。
大巫誇父被殺後，大巫大羿大怒，舉部落之力，加以巫族各種秘術，造箭射殺九隻金烏。
大羿射殺九隻金烏後，又被眾多妖神殺死。雙方矛盾日益激化，爆發巫妖大戰。
妖族有東皇太一執掌混沌鍾、帝俊、羲和、望舒、妖師鯤鵬，以及眾多太古洪荒十二妖神：商羊、陸吾、計蒙、英招、白澤、窮奇、甪端、欽原、鬼車、畢方、九嬰、重明鳥，憑借周天星鬥大陣守護天庭
剩餘十大祖巫、大巫九鳳和另一位強橫古大巫一同，運轉十二都天神煞大陣，對抗妖族擺下的周天星鬥大陣，以陣破陣。由於十二祖巫沒有聚齊，無法凝聚出接近於天道聖人肉身出手的威力，而東皇太一又執掌東皇鍾混沌鍾，帝俊執掌屠巫劍，巫妖雙方鬥了個旗鼓相當。眾大巫也與眾妖族眾人捉對廝殺。
最終，雙方發死力，雙雙破敗，眾祖巫合身自爆，與東皇太一、帝俊等人同歸於盡。其中，妖師鯤鵬偷取河圖、洛書，逃之夭夭。
經此一戰，太一、帝俊與祖巫俱身損，妖神、大巫死傷無數。剩餘殘存者有的隱退躲藏，有的散落洪荒星辰之中迷失方向。許多巫族殘存者退隱幽冥地府，妖族殘存者退守北俱蘆洲。巫妖兩族由此勢弱。兩族同歸於盡，自此沒落，人教大興。
曆經千年再無巫、妖傳說，是否巫妖就此滅絕，抑或另作他圖？