由於宸妃的離世，皇太極飲食頓減。一次，他從中午一直昏迷到晚上，嚇得滿朝文武全都亂了手腳。此後的兩個多月中，他一直沉湎於悲痛中不能自拔，後經諸大臣力勸似有悔悟：“天之生朕，原為撫世安民，今乃過於悲悼，不能自持。天地祖宗知朕太過，以此示警。朕從今當善自排遣也。”因此，接受了大臣們請求，出去狩獵散心。
沒想到在返回途中，路過宸妃墓，皇太極下馬再次痛哭不已。宸妃的去世，極大地摧殘了皇太極的身心，從此，他一病再病，身體狀況急劇走上了下坡路。皇太極似乎對自己的身體狀況有所預感，在諸王及妻子兒女們奏請祭祀宸妃時，他感傷地說：“山峻則崩，木高則折，年富則衰，此乃天特貽朕以憂也。”
長期以往，過度沉思於悲傷與自責當中，公元1643年9月21日夜間九點至十一點，即崇德八年八月初九日（崇禎十六年）亥刻，大清帝國的開國皇帝、52歲的皇太極端坐在沈陽故宮清寧宮的南炕上，停止了呼吸。對此，《清實錄·太宗文皇帝實錄》上是這樣記載的：是夜，亥刻，上無疾，端坐而崩。
關於皇太極的死因有好幾種說法，咱們指借鑒其中一種說法，疾病而亡，我們中醫講；無病不死人。
那麼年紀五十出頭的皇太極為何會得病呢？那就是胖。
《清史稿·太宗本紀一》記載：“上儀表奇偉，聰睿絕倫，顏若渥丹寒而不慓。”根據這段文字，我們可以判斷皇太極身體一定很胖，瘦人肯定不會寒而不憟的。皇太極到了中年，身體越發胖起來（不光是皇上，就是普通人你看一到40歲開外真就發福，這是一種生理現象），更何況皇上吃的多好，一日三餐有魚蝦，美酒佳肴無有節製。
人一發胖各種疾病都上來了，胖人易患的大多是心血管病，還有三高症等。估計皇太極這些病一個也沒的跑，已有可能是血壓高以至腦內出血或心肌梗塞突然死亡，隻有這兩種疾病也是現代社會人們最常患的病，死亡率致殘率極高。所有皇太極肯定是患有上述兩種疾病是一種而亡，而不是先前說的無疾而終。
皇太極死後，被埋葬於昭陵。昭陵地處沈陽市北郊，又稱北陵，是清朝第二代皇帝皇太極與其孝端文皇後的陵，是清初關外帝王陵寢中獨具特色的一座。昭陵保護區占地麵積近48萬平方米，現存古建築38座（組），所有的建築以神道為中心軸線對稱分布，形成平麵布局規整、禮製設施齊備的皇陵規製。自南向北依次有下馬碑、華表、神橋、石牌坊、正紅門、石像生、神功聖德碑亭、方城、隆恩門及門樓、角樓、隆恩殿、東西配殿、二柱門與石台，明樓、月牙城、寶城、寶頂等建築。
至於現在被沒盜咱不好說。
“瑞親王大事不好，皇上駕崩了。”一位內侍臣偷偷跑到多爾袞的府上把皇上突然病故的消息告訴他。
多爾袞萬萬沒有想到皇太極能死的這麼快，這令他既興奮又擔心。興奮的是自己有機會可以坐大清國的皇上，擔心的是窺視王座不是自己一個人，而是好多人。這頭一個的就是大貝勒豪格。怎麼瞅這個豪格怎麼不地道，就是自己的絆腳石，更是自己的心腹大患。
很快有人通知他到皇宮聽宣，至於有什麼安排他也不知道。
來乾寧宮的人還真不少，有濟爾哈朗、豪格、代善等人。
其實這是代善主持召開的立新君議政大會，因為這裏他的資格最老也最高。
代善召集議政王會議，共同議立嗣君。在會議過程中，多鐸提出：“不立我，論年紀，應當立禮親王代善。”
代善說：“睿親王如果應允，當然是國家之福；否則，豪格是皇帝的長子，當承大統。至於我，年老體衰，難得勝任。”
多爾袞一看自己和豪格都不會得到一致擁護，於是，他提出一個折衷方案，即立皇太極第九子6歲的福臨為帝，由濟爾哈朗和他自己輔政。當諸王貝勒會議通過折衷方案後，代善立即召集所有文武大臣、王公貴族共立誓書，昭告天地。1643年（崇德八年）農曆八月二十五日，6歲的福臨正式舉行登基典禮，繼承了皇位，年號順治。