為了振奮軍威，黃帝決定用軍鼓來鼓舞士氣。他打聽到東海中有一座流波山，山上住著一頭慢獸，叫“夔”，它吼叫的聲音就像打雷一樣。黃帝派人把夔捉來，把它的皮剝下來做鼓麵，聲音震天響。黃帝又派人將雷澤中的雷獸捉來，從它身上抽出一根最大的骨頭當鼓槌。傳說這夔牛鼓一敲，能震響五百裏，連敲幾下，能連震三千八百裏。黃帝又用牛皮做了八十麵鼓，使得軍威大振。
為了徹底打敗蚩尤，黃帝特意召來女兒女魃助戰。女魃是個旱神，專會收雲息雨。平時住在遙遠的昆侖山上。
黃帝布好陣容，再次跟蚩尤決戰。兩軍對陣，黃帝下令擂起戰鼓，那八十麵牛皮鼓和夔牛皮鼓一響，聲音震天動地。黃帝的兵聽到鼓聲勇氣倍增；蚩尤的兵聽見鼓聲喪魂失魄。蚩尤看見自己要敗，便和他的八十一個兄弟施起神威，凶悍勇猛地殺上前來。兩軍殺在一起，直殺得山搖地動，日抖星墜，難解難分。
黃帝見蚩尤確實不好對付，就令應龍噴水。應龍張開巨口，江河般的水流從上至下噴射而出，蚩尤沒有防備，被衝了個人仰馬翻。他也急令風伯雨師掀起狂風暴雨向黃帝陣中打去，隻見地麵上洪水暴漲，波浪滔天，情況很緊急。這時，女魃上陣了，她施起神施，刹那間從她身上放射出滾滾的熱浪，她走到哪裏，哪裏就風停雨消，烈日當頭。風伯和雨師無計可施，慌忙敗走了。黃帝率軍追上前去，大殺一陣，蚩尤大敗而逃。
蚩尤的頭跟銅鑄的一樣硬，以鐵石為飯，還能在空中飛行，在懸崖峭壁上如走平地，黃帝怎麼也捉不住他。追到冀州中部時，黃帝靈感突現，命人把夔牛皮鼓使勁連擂九下，這一下，蚩尤頓時魂喪魄散，不能行走，被黃帝捉住了。黃帝命人給蚩尤戴上枷栲，把他殺了。害怕他死後還作怪，便把他的身和首埋在了兩個地方。蚩尤死之後，他身上的枷栲才被取下來拋擲在荒山上，變成了一片楓樹林，那每一片楓葉，都是蚩尤枷栲上的斑斑血跡。
黃帝打敗蚩尤後，諸侯都尊奉他為天子，這就是軒轅（黃帝的名字）黃帝。軒轅黃帝帶領百姓，開墾農田，定居中原，奠定了華夏民族的根基。
【另附文獻】：
關於蚩尤與黃帝之戰，載籍所見，有三種說法：一說是黃帝勝炎帝之後，再勝蚩尤而鞏固帝位，黃帝與蚩尤之戰似為黃炎之戰爭的餘波；另一說是蚩尤驅逐赤帝（即炎帝），赤帝求訴於黃帝，二帝聯手殺蚩尤於中冀；三說是蚩尤作兵攻黃帝，兵敗被殺。
第一種說法如《史記·五帝本紀》載：“軒轅乃修德振兵，治五氣，藝五種，撫萬民，度四方，教熊羆貔貅貙虎，以與炎帝戰於阪泉之野。三戰然後得其誌。蚩尤作亂，不用帝命。是黃帝乃征師諸侯，與蚩尤戰於涿鹿之野，遂依附殺蚩尤”。太史公言黃帝名軒轅，國號有熊軒轅本意為車，應是指發明製作車的技術而得名的氏族及其首領的名稱，如發明製作農耕工具技術稱神農氏，發明製作捕撈工具技術而稱伏羲氏，發明鑽燧取火技術稱燧人氏然。有熊國號。當時的“國”，實為部落。熊、羆、貔、貅、貙、虎為六種獸名，應是有熊部落中六個氏族的名稱，或謂圖騰。阪泉，水名，在今北京市延慶縣。涿鹿，山名，在今河北涿鹿縣，與阪泉相距不遠。
第二種說法見於《逸周書·嚐麥解》：“蚩尤乃逐帝，爭於涿鹿之阿，九隅無遺，赤帝大懾。乃說於黃帝，執蚩尤，殺之於中冀”。廣平之地曰阿。爭戰發生在涿鹿山下的開闊地帶，隅指角落，“九”意指多，並不限於具體數目八加一。“九隅無遺”是說蚩尤驅逐赤帝（即炎帝）部落不留遺地。地冀指中原冀州。《爾雅·釋地》：“兩河間曰冀州”。郭璞注：“自東河至西河”。當時把黃河入海處稱為東河，河套向南流處稱西河。《周禮·職方》記：“正北曰並州”，今山西太原、河北正定保定皆屬之；“東北曰幽州”，今北京市屬之。上古冀州位於幽、並之南，地在今山西南部及河北西南部。傳說蚩尤被殺之處，在今山西運城解州。
第三種說法如《山海經·大荒北經》載：“蚩尤作兵伐黃帝。黃帝乃令應龍攻之冀州之野。應龍畜水。蚩尤請風伯雨師縱大風雨。黃帝乃下天女曰魃，雨止，遂殺蚩尤”。風伯雨師是農耕蚩尤部落專司氣象的巫師，後為農業氣象神，立有廟，歲時奉詞。《韓非子·十過》說：“昔者黃帝俁鬼神於泰山之上……蚩尤居前，風伯進掃，雨師灑道”。