天地初開，巫妖二族獨霸天人兩界。兩族各自守護著自己的領地，千萬年間相安無事，然而妖族終究不滿天界一隅之地，終於有一天，東皇太一背著妖帝帝夋設計挑撥巫族十二祖巫中祝融與共工大戰。
二位祖巫無一不有通天徹地之能，共工一怒之下撞向不周仙山！不周仙山本為擎天之柱，一朝傾頹，天界四角缺一，災難陡生。
女媧娘娘不忍萬靈受災，取七彩神石補天。
事後，女媧娘娘為懲罰共工過錯，斷了共工仙根，化作飛灰，飄蕩徘徊於天地之間。
巫族十二祖巫去其一，巫妖二族之間的平衡被打破，妖族最忌憚的祖巫大陣難以支持。東皇太一趁機攜開天至寶東皇鍾及射日弓下界，率千萬妖兵征討巫族。
三清與巫族本為盤古一宗，奉鴻鈞之命援助巫族。
妖族牽一發而動全身，當帝夋發覺時，已然為時過晚。射日弓被奪，三清將其交給門人羿，羿挽弓搭箭，怒射九日。帝夋怒而下界。
羲和常羲二位妖後為報殺子之仇，蠱惑龍鳳二族降臨人間，殘殺凡人。
女媧娘娘見自己的孩子們受災，終究不忍，以開天至寶女媧石囚龍族於天界囚龍湖，押鳳凰一族於魔界棲鳳山。
妖族損失兩大最強戰力自然兵敗如山倒，然而巫族也已傷及根本。帝江，強良，奢比屍，天吳，弇茲，玄冥全皆戰死，後土娘娘感念巫族罪惡已深，自願化身六道輪回，永世化為冥界之綱。
至此，巫族隻剩下了金之祖巫蓐收，木之祖巫句芒，火之祖巫祝融，時間祖巫燭九陰。妖族也被打散，帝夋不知被鎮壓在了何處，羲和回到了太陽上，常羲則回到了月亮上靜修。東皇太一也不知躲到了何處去。
天地間一片荒蕪。
趁此大好時機，鴻鈞命三清行教化萬靈之責，廣納門徒，成另一盛世。
洪荒畢，遠古始！
另外，為防止巫二族崛起，關燭九陰於北方極寒之地，由神獸玄武看押；關祝融於南方極熱之地，由神獸朱雀看押；關蓐收於西方極暗之地，由神獸白虎看押；而句芒則被關於東方無邊之境，由青龍看押。
對於妖族，三清則將其趕出天界，由太清道德天尊太上老君兜率宮門童張氏化為玉皇大帝，娶原妖後羲和為王母娘娘，駕臨淩霄寶殿，掌管三界諸事。
為彰顯人族胸襟，三清還封妖族勾陳為北方勾陳大帝，巫族後土為大地之神。
另使妖族叛徒金翅大鵬及朱厭分別看守龍鳳二族。
至此又過了萬年，玉皇大帝不滿天庭諸神皆為三清門人弟子，輕視玉皇，不服管束，看似由玉皇統領，實則聽命於三清，天庭幾近淪為三清囊中之物。
玉皇張氏上書鴻鈞，終有一日鴻鈞降下一道法旨及神寶封神榜，下令於三千世界之中的地球行封神之事！
封神一戰，太清道德天尊於玉清元始天尊勾結，陷害上清靈寶天尊，致使截教自萬仙來朝的局麵一落千丈，千千萬萬門人弟子隻剩下了金靈聖母一人，餘下的，死的死，叛的叛，幾乎全入了封神榜，三清決裂！
封神之後，封神榜受無上功德，化作開天至寶！
天庭諸神，無一不受封神榜掌控，隻得聽命於玉皇大帝和王母娘娘。
鴻鈞另為玉皇大帝打造開天功德至寶昊天鏡，助其一同神人魔三界及三千世界大半。
至此，玉皇大帝才算是真正掌控了天庭。一人之令，莫敢不從！
天庭一統，三界也回到了正常的軌跡上，三千世界盡皆太平無事！
遠古終，上古始！
然而好景不長，這一日，三千世界被籠罩於一片黑光之中，然而天庭之上緩緩升起一顆寶珠，吸納三千世界之靈氣，寶珠愈來愈亮，然而世界之中的靈氣卻接近枯竭，無數植物靈獸因靈氣枯竭而亡。
就連修士也死傷了大半！忽然，這顆寶珠“嘭”地一聲，破碎成了萬千碎片，飛向三千世界，天庭也蕩然無存！
於天外天閉關的鴻鈞也心頭一動，忙掐指計算，然而，他那霧氣氤氳的臉上波光微動，毫無感情地說道：“有趣，這究竟是個盛世？還是個亂世？”
忽地，鴻鈞手中動作一滯，喃喃著說：“成，則君臨天下，淩駕萬靈之上；敗，則灰飛煙滅，不入輪回！變數！！！有趣，有趣，有趣！”
鴻鈞自己也未發現，自己竟說了三個“有趣”！