楊秀清正要拍板同意石達開請求，洪秀全突然發表不同意見，否定了石達開任北伐主帥的請求。
洪秀全有自己的想法。他知道石達開年輕有為，文武雙全，帶兵打仗很有一套，讓石達開擔任北伐主帥，打北京則更有把握。正因如此洪秀全對他產生了個人猜忌。
洪秀全看過很多曆史書籍，他記得西漢末年劉秀借綠林軍、赤眉軍力量發展自己的武裝，在王莽政權瓦解之際，劉秀借口單獨行動另樹一幟，後又消滅綠林軍、赤眉軍，建立起自己的東漢政權。石達開主動要求帶兵北伐，也確有劉秀虎入深山之嫌，不可不防。石達開的問題就是太年輕、太有才了。
洪秀全初次認識石達開就覺得他是個胸懷大誌，不甘人下之士，為了幹一番大業，他才投靠拜上帝會。對上帝教義他卻不怎麼附和。他隻不過是在這武裝鬥爭中，發揮自己的才幹、鍛煉自己的能力而已。誰又能證實他和上帝會是一條心呢？誰又能擔保他沒有奪取江山的野心呢？眼下滿清王朝已是腐朽透頂，不堪一擊了，搗毀妖穴並非難事，不必讓石達開去節外生枝。洪秀全心裏這麼想，嘴上又是一種說法：“朕不忍心讓達胞冒險北伐也！自永安封王以來，東西南北翼五王嘔心瀝血，辛苦倍嚐。可歎南王升天於全州；西王升天於長沙，而今隻剩下你我四位王爵了。既得金陵天下大定，達胞好好坐享清福吧！”
石達開恭敬道：“天王，小弟行動慣了，不耐閑散，您還是讓我帶兵打仗吧！”
洪秀全笑道：“達胞若要打仗，這天京四周自有你用武之地，不必冒險北伐了。”
楊秀清見洪秀全態度堅定，言之有理，也勸石達開道：“二兄將諸王留在天京也是好意。本軍師看來，北伐可由幾位丞相擔任主將。出廣西以來林鳳祥、李開芳、羅大綱、吉文元等帶兵有方，攻城略地無往不勝。取嶽州、攻武漢、打南京已顯神威。本軍師想讓這幾位虎將帶百戰精銳組成北伐軍，相信他們像以往那樣迅猛疾進搗毀妖穴。另可讓胡以晃主持西征，秦日綱繼續統領水師。”
洪秀全首先點頭讚許，韋昌輝跟著表示同意，石達開也隻好說聲：“小弟聽命。”
建都守城、北伐西征幾大事宜決定下來後，守城負責人韋昌輝想起一個具體問題，道：“向妖頭率兩萬妖兵一直尾隨我後，跟到金陵城下，現在駐紮東南頻繁騷擾。我兵雖多，大半是兩湖兩江新兄弟。部隊缺少中級將領，不知如何是好？”
楊秀清道：“此時我早已有所考慮。到嶽州時我軍尚不足十萬人，順長江一路東下，各界人士望風來投，現在已達百萬之眾。部隊擴大後提拔帶兵將領已成了一項迫切任務。人數太多，我們不可能熟悉每一個士兵的情況，提拔將領必須采取層層保舉之法。”
在場的人都同意層層保舉選拔將領。楊秀清接著又更詳細地說道：“凡保舉官員，必須查其平素曆練老成、精明靈變，然後傳該員前來親自勘驗，觀其言行舉止，進退趨蹌，果堪勝任再行保舉，稟奏回朝，勿得徇情濫保。”