混沌之初，在飄渺荒蕪的空間內，一個人的出現造就一個時代的開始，隻見那人手中拿著把巨斧，長吼一聲！一聲巨響過後，混沌的世界開始消失，所有輕浮的物質不斷上升，重的物質則不斷下降，那巨人突然巨大化，加速了世界的生成。
不知過了多久，那巨人倒下了，身體開始消失，隨之出現的是天上的日、月、星、雲，地上出現了山川河流、百草樹木、飛禽走獸，大地一片生機勃勃，隨之出現了三道清氣，分別由那巨人的精、氣、神，幻化出三個元神，三個元神經過無數個月的修煉，不斷吸取天地精的日月精華，終於修煉成了人形，分別是元始、靈寶、道德，三位飛仙者分別點化了蛇、龍、牛，後來蛇、龍、牛，分別化成了女媧、伏羲、神農，然後開始了女媧造人、伏羲造物、神農傳醫，經過三個人的努力，天下出現了一片繁榮，人們都或者美好的生活，而女媧、伏羲、神農，也成了人們心中的神，而點化他們的三位飛仙者元始、靈寶、道德，被封為玉清元始天尊、上清靈寶天尊、太清道德天尊，三位天尊早已經飛仙入境不問世俗，由女媧、伏羲、神農管理天下，而女媧、伏羲修煉得到成仙，神農卻想留在人間繼續傳道救世。
又不知過了多久，天邊一聲雷轟，天空出現了一個大窟窿，大量的魔物入侵禍害人間，人間頓時生靈塗炭，女媧為解救蒼生修煉五彩神石補天，伏羲為穩定天地，一化為四，分出四個元神，分別為東方東極青華大帝，西方太極天皇大帝，南方南極長生大帝，北方北極中天紫微大帝，這封號都是後人賦予的，穩定四極之後，女媧開始了漫長的補天，為避免魔物騷擾，四極之帝幻化出四隻靈物，分別為青龍、白虎、朱雀、玄武，守護女媧，而神農四處救助被魔物傷害的人，大地早已經屍橫遍野，到處都是破壞，山川河流樹木無一幸免，大地仿佛是末日般的慘像，神農深感責任重大，他幾乎沒有休息，拖著疲憊的身體四處奔波，身體越來越吃不消，好幾次的病倒，依然堅持住，而三清早已不管世俗，但留下了一句話給神農，“一切緣起緣滅，這注定是一劫，也是你們三人的一劫，一切皆成定果”。神農想起那時三位天尊反對自己和伏羲下界幫助人，難道是自己引起的因，但現在不是想這些的時候，神農回到神界找到三位天尊，表明自己願意為天下作出犧牲，懇求三位天尊出手，天尊依然給了神農一句話，“你跟盤古大神都是自然之力，都是生命的創造者，至於怎麼創造就靠你自己的悟性了”。
神農反反複複想天尊說的兩句話，自己心裏已經有底了，他已經做好充分的準備。
神農用了太清道德天尊賜給他的鼎，每天煉製藥物，七七四十九天後，女媧補天成功了，但受到了反噬，從此變成半人半蛇的狀態，無法恢複。而伏羲元神消耗太多，無法收回四極之帝，自己也失控了，變回一條龍，控製不了體內元神作亂，一分為九，出現了九條龍，但都不像龍，分別是囚牛、睚眥、嘲風、狻猊、霸下、狴犴、饕餮、趴蝮、貔貅，女媧看著九條龍在亂鬥，弄得人間更加大亂，這無疑是雪上加霜，那九條龍好像分為兩派，一派是代表正義的，一派是代表邪惡的，正義的代表為:囚牛、狻猊、趴蝮、貔貅、狴犴。邪惡的代表為:饕餮、睚眥、嘲風、霸下。女媧早已經用盡法力了，根本無法阻止他們，這時四極之帝出現了，幫助囚牛那邊，把饕餮、睚眥、嘲風、霸下鎮壓在四極之處，而狴犴、狻猊、趴蝮、貔貅分別讓四極之帝點化飛仙，而囚牛卻喜歡自由自在的生活，隱居在世間，他的一首《鎮魔曲》，洗淨了人間的魔物，使魔物變為人間的飛禽走獸，從此銷聲匿跡，後來傳說有美妙的音樂響起就有囚牛的出現，至於女媧補完天後就消失不見了，而四極之帝在天地四極布下結界，並用四隻靈物分別守衛四極之地。
人間的魔物變成飛禽走獸後已經安定下來了，但要解決的是被魔物破壞的人間，由於到處是魔氣，植物幾乎枯萎了，昔日的生機早已不在，神農的鼎已經煉製了上百種草藥。
神農皺緊眉頭說:“鼎裏的藥已經煉製好了，就差一味藥，就是我！我準備殉身於鼎裏，你們也不必勸我了，你們都是我最出色的徒弟，都已經得到我的真傳，我也沒什麼牽掛了，我死後將鼎帶到山上最高的地方，不準跟人說我是殉身於鼎，說我是嚐試藥物被毒死了，說屍身已經被葬在山上，一定要按照我說的那樣。”