根據拿破侖的命令，還宣布對帕維亞市政委員會的成員們判處死刑；這項凶狠的命令在執行上出現了延誤，最後才把判刑減輕了。不過，200個人質被押往法國，作為這個不幸的城市今後行為規矩的保證。波拿巴隨即對督政府說，這樣處理反叛者，對意大利各地人民說來，會是一種有益的教訓。
從某種意義上說，這是正確的。這使意大利人看透了法國方式方法的真相；而當意大利半島上的人們認識到他們的解放得付出多麼大的代價時，他們的心中充滿了痛苦的感情。但是，如果把倫巴第遭到劫掠一事的主要責任算在波拿巴的頭上，那是不公正的。他所采取的行動，無非是法國軍隊的習慣做法的一種發展；不過，這些敗壞風紀的措施，過去還沒有象這次解放和敲詐倫巴第的係統做法實行得這麼徹底罷了。波拿巴倒並不想為自己搶劫什麼。他所追逐的是權力，而不是錢財。財富可以用作達到掌握政治大權的一種手段——僅僅在這個意義上他才給予財富以一定的重視。但他總是設法使督政們和全部有影響的將領都深受他的恩惠。他給那5位所謂的法國統治者送去了100匹在倫巴第挑選來的最好的馬，以替換“現在還為諸公拉車的那些可憐的牲口”。
對他手下的將領，他采取了一種放任的態度；這種態度雖不主動，卻常常是明顯的。馬爾蒙將軍說，有一次拿破侖責備他不該謹小慎微地把授權他去索取的一筆款子全部都交了公。
馬爾蒙還說，“那時，在這類問題上，我們還保持了一種龍膽花似的潔身自好。”
但是，在平原的熱氣熏蒸的環境中，這種阿爾卑斯山的龍膽花很快就凋謝了。有的將領大發橫財，其中最突出的就是馬塞納將軍，他在搶劫財富方麵，猶如在打仗時一樣，總是衝鋒在前的。這位司令官雖然對將領們很寬大，但他在寫給督政府的報告中卻滿篇都在埋怨，說是一大幫法國地方官員、掮客和其他貪婪的文職人員靠著掠奪倫巴第來肥私中飽。他對部隊如此縱容，而對文職人員卻這樣嚴格，看來不能不使人得出這樣的結論：他已下定決心要同將領們和士兵們相依為命。他在行動上的厚此薄彼，往往達到了驚人的程度。有些文職人員被他關進了監獄，他還打算槍斃另外一批。但是，搶劫、肥私搞得最厲害的人，一般都同那些靠不義之財發跡的軍方財神爺交上了朋友；結果，他們隻付了一點罰款就逍遙法外了——就他們實際到手的財富而言，那點小小的罰款實在是太不相稱了。
巴馬公爵和摩德納公爵也都被他罰了款。由於巴馬公爵與西班牙波旁王朝有關係（當時督政府打算與該王朝保持友好關係），因此隻罰他交出200萬法郎和20件藝術珍品，這些珍品由法國特派員從公國的美術館中挑選。但是，曾經幫助過奧地利軍隊的摩德納公爵，贖罪的規範價就高達1000萬法郎，此外還得奉上他的公國的主要藝術珍品——20幅名畫。
正如拿破侖不加掩飾地向督政們報告的那樣，鑒於摩德納公爵既無要塞又無大炮，自然無法向他索取這兩樣東西羅！
拿破侖這時竭力要使他的士兵們擺脫這種搶劫財富的墮落行為的影響，號召他們不要忘了給予意大利人民以公民自由權的這個更崇高的任務。
在5月20日發布的一份公告中，他囑咐士兵們不要忘記：雖然迄今已做了不少事，但是更為偉大的任務尚有特完成；一定不要讓後代人責備他們，到了倫巴第就好像打到了他們的卡普亞了。羅馬還有待解放；應當讓這座千載流芳的古城重返青春，並再現出布魯都斯、西皮奧等古代名人的美行。
他還說，解放了羅馬以後，法國就會給歐洲以光榮的和平；那時，這支為自由而戰的大軍的每一個戰士重返家園時，同胞們就會誇獎說：“瞧，他就是意大利方麵軍的一員！”拿破侖用這一席動人心弦的話，把人們對軍功的追求同自由的熱愛交織在一起了；也正是這種對軍功的追求，到頭來將會扼殺法蘭西的共和體製。
現在，這支從前時常為饑餓而困擾的窮困潦倒的軍隊已經煥然一新，他們已從這位年輕的統帥那裏獲得了前所未有的信心、榮譽和財富。他們對自己在他所統帥的軍隊中服役而感到由衷地自豪，他們將他看成勝利、榮譽和財富的化身。
而此時的米蘭，已結束了它那癡迷的狂歡，意誌薄弱而又熱情奔放的意大利人終於感受到了凱撒那剛毅、勇敢的另一麵內容：凶猛、殘暴而令人生畏。