朱元璋並不理他，馬夫人上前道：“不過一塊小玉墜，且不是什麼名貴物品，用得著上軍法嗎？”
朱元璋立即大怒道：“你們這些婦人，統統退下，什麼是軍法？軍法就是要嚴格執行，以明紀律，玉墜雖小，事情卻大。我們一再強調不可私自藏物，百姓的歸還百姓，我們不是強盜，我們是為百姓打仗，守護百姓的。拿百姓的東西算什麼，這和強盜又有什麼區別！”
朱元璋立即轉過身去，仿佛不忍看徐達，大聲喝道：“拉下去，軍法處置！”
眾人驚呆了，士兵也不敢動徐達，徐達表情絕望地望了望大家，似乎真是要永別了。隻見徐達夫人當即目瞪口呆，暈了過去。
李善長和湯和此時站了出來，千說萬勸。再三求情，好說歹說，朱元璋才鬆了口，讓徐達以功贖罪，給徐達鬆了綁。當著眾人的麵，徐達立下諾言，此城不攻下不歸。而朱元璋也借機對在場的將士道：“此次出兵，關係重大，若要留下徐將軍的性命，你等且要賣力攻城。攻城事小，占城事大，你等切不可擅自搶掠財物，切忌燒房殺人，一旦違反軍令，不可將功折罪。”
經曆這樣一個波折，徐達所帶的將士們勇猛殺敵，軍紀嚴明。
鎮江元守將定定見義軍攻勢如此猛烈，率兵力拒，但敵不過徐達一萬精兵，戰死鎮江。而徐達攻破鎮江時，嚴整軍紀，再三強調不許擾民，將士們每到一城都被如此要求，且出發前經曆了徐達險些喪命的事情，都遵守軍令，善待百姓。剛剛經曆戰爭的鎮江，竟然像是未曾經過戰爭，百姓安安靜靜，照常生活，原來徐達已經在城內四處張貼告示，告慰居民義軍的軍紀，請百姓不必驚慌，說他們是來保護人民的。鎮江的百姓，早就聽說朱元璋的軍隊進駐應天的時候，不殺不傷百姓，不搶不奪百姓物資，紀律嚴明，如今親身經曆，感慨萬千，軍民相處和諧。
而徐達由於攻打鎮江而升任統軍元帥。他在安撫地方百姓、督促他們進行農業耕作的同時，仍然攻下了金壇、丹陽等地，鞏固了這個位居最東邊的前沿陣地，以防張士誠的西侵。
朱元璋覺得鎮江離應天如此近，安頓了鎮江也就為守衛應天作了鋪墊，親往鎮江安民。到了鎮江後，朱元璋先拜謁孔夫子廟，以顯示自己尊儒愛民，行仁義，同時在鎮江召集軍民，宣告愛民、護民的思想，且重用鎮江的儒士，讓這些讀書人勸告當地百姓擁護士兵，勤懇務農，發展經濟。朱元璋親行鎮江，不僅穩定了軍心，更重要的是穩定了百姓的心，徐達因為此次立下大功而被免除軍法。
同年7月，朱元璋在應天自稱吳國公，設立了自己的行政機構及軍事管理機構江南行樞密院，任命徐達為同僉樞密院事。徐達身為江南行樞密院同僉、鎮江統軍之帥，在抵禦了張士誠的多次進攻後，乘勝進圍常州。
但是，常州守敵死守城池，不肯出降，加上城內兵糧充足，徐達等攻打不下。朱元璋為示公允，即依軍法降了徐達及其屬下一級官職，並寫信責備徐達說：“虐降致叛，勞師無功，此吾所以責將軍，其勉思以補前過。否則必罰無赦！”徐達由於久攻常州不得不但要受到朱元璋的指責，而且還要應付張士誠軍的一次次反撲。但徐達沉著指揮部隊作戰，並沒因受這些困擾而有所貽誤，使張軍的企圖難以得逞。同時，在城外三十裏外駐紮的常遇春、廖永安、胡大海等率部前來增援，內外呼應，張軍大敗，生擒敵將張德。殘敵潰逃奔入城內。見常州危急，張士誠便派了手下悍將呂珍夜間潛入城內，加強防守能力。徐達督軍輪番猛攻，呂珍眼看士氣低落，支撐不了，便棄常州而逃。到至正十七年（1357年）3月，終於勝利地打完了長達半年之久的常州攻堅戰。朱元璋在常州設立長春樞密院，由徐達擔任僉樞密院事，湯和擔任樞密院同僉，統兵鎮守該城。
接著，徐達乘勝進攻寧國，俘獲十萬餘降兵，戰馬二千匹，然後又出師宜興、常熟、江陰馬馱沙（今江蘇靖江）等地，朱元璋盡據了宜興的靖江一線地區。
經過兩年多的征戰，朱元璋已經逐漸穩固了以應天為中心的江南政權，大體控製了今江蘇、安徽南部和浙江西北部地區。