後來，在西南地區，徐霞客又多次仔細考察過石灰岩地貌，曾先後探訪過101個岩洞。在他的筆記裏，詳盡地記述了溶蝕對這裏地貌所起的不可抗拒的巨大作用。溶蝕，不僅能造成孤立突兀的奇峰和圓形的窪地，還能形成狀如門洞的“天橋”以及岩洞中奇妙絕倫的石鍾乳、石筍。對石灰岩地貌做如此廣泛深入的考察和詳細記錄，徐霞客是世界第一人，比歐洲最早描述和考察石灰岩地貌的愛士培爾早100多年；而比歐洲最早對石灰岩地貌進行係統分類的羅曼更是早了200多年。可以毫不誇張地說，徐霞客是世界上研究石灰岩地形地貌的偉大先驅者。
徐霞客從22歲開始旅行考察，在30多年漫長的歲月中，棄家別舍，耗盡積蓄，常年櫛風沐雨，風餐露宿，曆盡了千難萬險。他曾失足掉進急流之中，險些喪命；他曾三次絕糧，不得不空腹而行；他曾兩度遇盜，財物被搶劫一空……但是，任何艱難險阻，都不曾動搖過他考察祖國山川的堅強意誌。直到1640年，他臥病不起，才被人用轎抬回家鄉。第二年，就離開了人世。
徐霞客一生行程數萬裏，把汗水撒在了大半個中國的土地上。他的心血，凝成一部不朽的巨著——《徐霞客遊記》。這部遊記，是徐霞客30餘年旅行考察的真實記錄。他不僅用優美的文字生動、準確、詳盡地記載了祖國豐富的自然資源和地理景觀，而且對一些自然地理現象作出了許多超越前人的科學論斷和解釋，揭示出不少合乎科學的自然規律，具有極高的科學價值，為後人的研究提供了極其珍貴的資料，被人稱為“古今遊記第一”。英國科學史專家李約瑟也讚歎說：“他的遊記讀來並不像是17世紀的學者所寫的東西，倒像是一部20世紀的野外勘察記錄。”
令人遺憾的是，這部遊記未能在徐霞客在世時編訂成冊。後來，由於清兵南下，徐霞客的兒子及大部分親人都不幸遇難，遊記手稿在戰亂中遺失了。直到135年之後，他的後人多方尋求，終於找到手稿殘本，經過校訂，刊刻問世。全書凡20卷，40萬字，僅為原著的1/6。
言行導航
徐霞客在刻苦攻讀的過程中，發現以前的地理書籍，多半講疆域沿革、風土人情一類的事，對山川自然風貌總是含糊其辭，一筆帶過。可見，這些著書人大都是閉門造車，互相抄襲，很少親自外出考察。所以他暗下決心，定要踏遍華夏山河，實地考察。正是這種意誌，才使他成為世界上研究石灰岩地形地貌的偉大先驅者。後人應該學習他不畏艱難險阻的堅強意誌。