二十六日，奉蔡公委任為雲南都督府軍政部總參事官，凡雲南政府民國以來各種法規，皆蔡公命餘起草，公隨筆改綴所訂定。元年五月，密保餘為雲南財政司長，所有雲南現行之財政計劃、銀行製度及關於財政上、金融上之諸項法規，皆餘秉公命詳細規定。雲南之財政雖窮而不亂者，皆公所賜。並屢囑餘曰：雲南自前清以來，本係受協省份，現在中央財政不能顧及各省，雲南亟宜自謀，務使收支適合，不可專向中央乞憐。乃下令裁減軍政各界薪餉，自都督以下每月過六十元者，均隻準支六十元；六十元以下者，均酌量裁減；各項軍費、政費亦皆至於減無可減，節無可節。是以元、二年以來，不惟中央未曾協濟雲南，雲南反協濟中央數十萬元，而雲南政事當行者亦均行之，並未停滯。蔡公在滇都督任內兩年，除每月之六十元薪俸外，並未支用公費。其公館之食用費每日限用小洋二角，其律己之嚴，可見一斑矣。至於治軍之嚴，尤所罕見。雲南自辛亥重陽首義以後，從未添招新兵，迨援川、援黔歸來，皆令其退伍，紀律謹嚴，未曾有一亂暴之事。曾有一兵戲放手槍一響，即罰判徒刑二年。故餘在滇前後三年，未嚐聞過槍聲。尤可怪者，蔡公都督任內，全省土匪為之絕跡。雖其威望足以服人之心，亦士卒用命，軍隊之配布鹹宜有以致之。
雲南其時既已安已治矣，公乃旁及於國中之大局。始則命餘在雲南組織統一共和黨，旋由黨眾舉公為總理，而餘與孫君敏齋副之，全省風靡，雲南之統一共和黨遂為中央及各省同黨所倚重。其後，公見國內黨爭激烈，軍人任意幹涉政治，乃首倡軍人不入黨之論。適值統一共和黨有合並五黨為國民黨之舉，公遂脫離黨派關係。並謂餘曰：予讀法蘭西革命史，自拿破侖時代起至第三共和國成立止，其間法國憲法更變者計十九次，其重大之原因，皆因未有憲法，即先有黨。其憲法皆由當時得勢之黨派所造成，及其黨勢一衰，而其所造之憲法，遂亦因而失其效力。甲仆乙起，循環不已，故良好之憲法終不能產出。及普法戰爭之後，法國全國一致，成立今日之憲法，而共和國家亦因之鞏固。可見，政黨者乃運用及維持憲法之物，憲法不可由政黨所造而成之。今我國國基亦未固，憲法未立，而黨爭之激烈如此，吾輩切不助其焰，而揚其波。
公又默察袁世凱之行動，終非可望其為愛國救亡之人，乃內則集合滇省軍政各界要人秘密開會，定計組織建國團。首由公演說，略謂：我輩革命，原有數重：其第一重，推倒滿清，恢複舊物，可謂已達目的。其第二重，滿清雖倒，而官僚勢力尚盤踞如故，帝製難免不再發生，加之暴民亂政，亦不可不防。其第三重，經過之後，國家斷不能謂之成立。何則？國家者對於世界要有獨立不羈之實力及資格，在國際上與最強國列於平等之地位，乃得稱為完全之國家。今我財政上、經濟上、行政上、司法上、軍事上無一不受外人之壓迫及挾製，故第三重非達到國家獨立不羈之目的不可。餘本此意，已與桂、蜀、黔等省都督聯絡，暗中組織建國團，以建立強固共和國家為主旨。乃公決派田君宗湞赴長江各省聯絡軍界，派餘赴京為滇省財政代表聯絡政界。癸醜之役，公以餘為京、滬間軍事偵察員，密電往來，日以數起。克強先生據南京時，公即聯桂、黔、蜀實力援助，公之意蓋欲假名戡亂，由滇出兵，經湖南出武昌，屯師武漢，再行迫令袁世凱退位。[8]後南京失敗，公聞之痛哭者累日，而袁之忌公亦以此時起。
及其來京也，雖與袁虛與委蛇，亦欲在北方占一軍事上勢力，以期達所謂第二重、第三重革命之目的。籌安會起之第二日，公即將其太夫人、夫人及如夫人在京所生之一子，派張君瑞嵩送回寶慶，而京寓隻留如夫人一人，早已準備時時可走矣。數日後，召餘密商，首問餘曰：君之對於籌安會之觀察如何？有人邀君否？我將來對於此事當取若何之態度為妥？餘對以該會尚無人邀餘，餘亦決不參入。以餘觀之，外交上萬難辦到，現在歐戰時代，日本將有左右世界之機會，袁自前清北洋大臣以後，即與日本大生惡感，日本之排袁，幾同舉國一致。袁帝製自為，日本決不承認，日本不承認，即當援助民黨，而帝製必不能成。其結果，袁不為路易十六世，即為拿破侖第三世。公一笑曰：與外國開戰之事，斷不至有，拿破侖第三世或不能學也。餘繼言將軍對於此事暫宜取沉默態度，置之不理，隨後觀察形勢，以定行止。公曰：然！並囑餘與上海民黨暗通消息，得其真相報告之。
迨五國提出勸告，公又召餘密商曰：予觀袁實在立腳不住，上海民黨情形若何？有信來否？餘對以有人來坐探將軍意見，以定進行之道。