二十年後，司馬睿正式退隱永樂山莊，太子司馬啟繼承皇位，開啟天龍聖武皇朝，司馬睿被尊為聖武祖皇帝，司馬啟是初代新皇。在此期間，大將軍、盧太傅、太尉、任天豪等人相繼去世，朝廷中魏希等人依然主持大局，而新的一代人才紛紛崛起。
隨著天龍的複興，司馬一族的子嗣也興盛了起來。司馬睿繼位四年，皇後逸馨生下太子司馬啟，啟兒在逸馨和司徒玄的教導下，各方麵能力非常優秀。十四年，司馬啟由朝臣選定為太子，二十四年，司馬啟二十歲，正式繼位，開啟天龍聖武皇朝時代。
宜妃程霜生長女司馬薇，二十年嫁盧恒次子。麗妃任傲雪生長子司馬原，次女司馬寧，司馬原接任北境軍統領職位，司馬寧嫁盧謙長子，和司馬薇一起嫁入了盧家。淑妃南宮淩生一女，相隨淩兒一生未嫁。
慧妃司徒靜生一女，嫁一個普通遊學者，遊跡山林鄉野間。黎妃殷黎生一女，繼承殷黎的醫學，創建黎軒閣，施救天下有病無法投醫的困難者。柔妃皇甫柔生一女，嫁給魏希之子，吳希生一女，嫁給石田之子。
湘妃沐湘生一皇子，和謝俊女兒聯姻。軒妃司馬芊芊生一皇子，過繼司馬南，繼任軒王。南蠻公主花阿蠻生一皇子，回去繼承了夜叉之王。北雪公主納蘭飄雪生一皇子，回去繼承了北原之王。西月公主烏扈彌月生一皇子，成為新的西域之王。
嵐妃孟幽蘭生一皇子，娶了章承幼女。香貴人香荷生女兒司馬蓮，嫁給了一個普通富戶家庭。十二妃中，華妃華宸和明妃雪月都無出，其他貴人們都有一子或一女。三十六貴人後，司馬睿再未選過秀女，然後民間傳說，聖武皇帝司馬睿在民間還有私生子女。
沐湘的女親衛，叨叨和茆茆，一個生了皇子，一個生了公主，分別和呂原之女、高崇之子結合，暗中成立護龍山莊守衛組織，世代守護永樂山莊。烏扈彌月的侍女，艾婭、艾莎、艾妮、艾娜，納蘭飄雪的侍女，知書、知琴、知禮、知畫，她們的子女全都回去成了貴族。
南蠻女王生下一對雙胞胎修羅兄妹，在女王的熏陶下，兄妹非常相愛，但在司馬睿的勸阻下，沒有打破禁忌結合在一起，而是利用雪狐女和哥哥生下後代。花阿蠻的雪狐女，阿紫、阿紅、阿青、阿藍、阿綠各有子女，通過下一代的通婚，新的修羅一族開啟了。
史載，天龍九九八年，司馬睿繼位，天龍一千年，宦官總管高靖謀逆被誅，司馬睿開始親政。不久，軒王司馬南叛亂，司馬睿被迫逃離中都，前往北都立足，和司馬南相抗。
司馬睿繼位三年，率北軍開始反攻，並且奪回天下大勢，重回中都。不久，大軍平定東都，軒王司馬南俯首。此時，東島沐家來犯，司馬睿率軍守禦，成功擊敗沐家大軍。接著，司馬睿率軍跨海出擊，征服了沐家。
秋季，南蠻來犯，南境軍統領楚浪遭到擊敗，軍師司徒玄和龍耀將軍先行前去抵擋。不久，司馬睿親征，突破歎息林，開始征服南蠻。大軍連戰連勝，南蠻夜叉之王高爾戈誠服，迎接司馬睿前去見南蠻女王，並向天龍表示臣服。
南蠻歸來，司馬睿發出罪己詔，昭告天下，並守靈三日。接著，在三輔大臣的主持下，司馬睿的冊封大典在中都舉行，董逸馨選為皇後，其他有十一妃，還有三十六貴人。