其它自然科學技術一樣，應用於考古學研究的時候，最為顯著的特征之一是其定量分析的手段及在這基礎上所提供結論的客觀。
古代遺傳基因研究的目的就是要跨越時代的鴻溝，將現代生物和古代生物之間的缺環連接起來，作為一個重要的研究手段，古遺傳基因研究展示了它在考古學法醫學，古病理學等研究領域的應用價值。
考古一竄中可能保存古代基因材料又兩種，一類是生物材料，如人類的骨頭，牙齒和動植物遺骸，另一類是人類製作，加工或使用過的材料及其上所附的殘存物，如生活用品陶器內的殘留物，作為藝術品的岩畫之顏料，動物皮毛和石器上所附的殘留物等。
事實上，古基因的研究結果已經不斷地將動物馴化和農業耕種年代想更早的時間推移，結合其他考古資料和科技手段，研究文化之間的動態交流，對遺傳中這些古代東西提取和分析可以提供器物用途和製作手藝等方麵的信息。
目前關於現代人類的起源，有多地區梁旭進化多源書耦合非洲單一起源說，後麵那個我個人是不太覺得和你，但是它最重要的依據之一，便是用線粒體方法構建的夏娃說。
這就好像閘門中土西漢墓大侯夫人的解剖表明，死者在生時患有多種疾病，如全身動脈粥樣化症，冠狀動脈等心髒病和嚴重的多發膽石病。
由於沒有發現女屍上有久臥病榻所見的症狀，也沒有見到消耗症的狀況，據此推知，她很可能是由於膽石病的膽絞痛，引發心髒病發作，引起嚴重的心率歲亂而死了。
有趣的是，在她保存完好的消化道內還發現一百三十多顆甜瓜子，向來這位貴人是在瓜好季節大餐一頓之後一小時內死亡的。
除了這些病症外，還發現她有膽囊先天畸形，肺結核鈣化病灶，血吸蟲病，饒蟲和鐵線蟲感染，骨質增生等等。
其中血吸蟲病的發現很重要，因為這東西是流行在湖沼區域的一種疾病，不嚇死是不可能感染這種病的，她生活在城市裏，過著飯來張口，衣來伸手的寄生蟲生活，怎麼會感染上這種病呢？
她有可能出生與湖沼地區，後來雖然身居高位，但當年在湖沼地區感染的血吸蟲病仍然潛伏在她身體之中，並陪伴著她進入地宮。
附近發現的冰人也是這樣，它被發現後立即引起了人們的關注，並發生了一些故事，如一個女人根據照片，堅持聲稱冰人是她在哪山裏麵失蹤的父親，知道碳素測出年代距今五千三百年，這場鬧劇才結束。
之後知道冰人是的時候二十五到四十歲，他因為身患多種疾病而被惡劣的天氣擊垮，凍死了。
他的肺被來自野火的煙熏黑了，動脈的血管已經碎了，有一個腳趾頭被凍傷，八根肋骨已經折斷，還有不少地方有關節炎。
他的指甲條紋表明當時他受著嚴重的疾病折磨，這大約是他死亡前四到兩個月的事情，古代人骨的研究除了這些之外，還有血多方麵，如用同位素可進行食方麵分析，中土與鷹醬實驗室曾經就合作對殷墟商人這方麵進行了分析，他們從商人肋骨中提取了碳，氮的穩定同位素，並用質譜儀測定了他們的具體含量，在分別與小米，小麥等作物中這兩種元素含量進行對比後，得出了殷墟商人主食小米的結論。
他們還對一具殷商時期的新生兒骨頭進行了同樣的分析，發現其要明顯高於其他兒童，我猜測這與起遲了較多東西有關，同時他們也發現兒童獲得的營養一般都比大人要高，說明他們得到了更多的照顧，這些人骨來自家族墓地，因而具有達標。
他們還可以對人骨，牙齒進行切片，在顯微鏡下觀察其結構，算出死者的年齡，對古代骨骼進行微量元素分析，可推測食物的來源，恢複古代人的飲食生活。