我國的克隆羊“陽陽”
由於動物體細胞克隆可以複製出的數量巨大的優良個體，因此動物克隆技術可以首先應用於畜牧業育種上。
通常在動物育種中所采用的方法主要是雜交育種，即把兩個具有不同優良性狀的雌雄個體進行交配，然後在後代中去選擇人們所需要的個體。要獲得一個優良品種，往往需要幾年甚至幾十年的時間，而且必須不斷地進行育種。如果采用動物個體克隆技術，就可以大量複製出人類所需要的優良個體，還可以大大縮短育種時間和節省大量的人力、物力。克隆技術的完善為轉基因動物的繁殖開辟了一條通道，應用克隆技術可以將轉基因綿羊大量繁殖，從而可在降低成本的同時大幅度提高產量，可見克隆技術在這方麵的應用前途無量。
體細胞克隆牛“康康”和“雙雙”
利用個體克隆技術，可以建立起穩定的動物模型，這將有利於揭示基因結構和功能間的關係，揭示生命的本質。動物克隆技術還有可能用於延緩珍稀瀕危動物的滅絕。研究結果表明有的動物的器官與人的器官十分類似，科研人員正在設法用動物的器官來進行人的器官移植，利用動物克隆技術獲得足夠量的動物器官用於人類器官移植。由於大多數哺乳動物類的胚胎發育過程非常相似，應用治療性克隆技術，還會促進畜牧業、動物業、製藥業等方麵的蓬勃發展。
目前，組織器官製造領域是全球高科技競爭最激烈的領域之一，各種再生或實驗室培養的骨頭、軟骨、血管、皮膚以及胚胎神經組織都正在人體上試驗。肝髒、胰腺、心髒、耳朵以及手指也正在實驗室中成形，個體克隆技術用於生物醫學方麵，將會產生巨大的經濟效益。