屠殺結束後，西班牙人把阿塔瓦爾帕關進一個地下室嚴加看守。為防被印第安人救走，他們用鐵鏈鎖著他的脖子，把他捆了一夜。隨後又把他囚禁在一個長22英尺（6.7056米）、寬17英尺（5.1816米）、高超過8英尺（2.4384米）的房間裏。控製了帝國的皇帝，阿塔瓦爾帕的數萬大軍便不敢輕舉妄動了。皮薩羅為這個人質開出的贖身條件是：印加人必須用黃金填滿囚禁阿塔瓦爾帕的這個房間，並用白銀裝滿隔壁的兩個同樣大小的房間。這種史無前例的條件，無疑是人類曆史上最無恥的勒索。
為了獲得自由，印加國王同意了西班牙人的條件。阿塔瓦爾帕天真地認為，如果他把西班牙人想要的金銀付給他們，他們就會放了他，並離開他的帝國。得到國王的命令後，印加的臣民從各處源源不斷地將財寶送來。一件件美麗的藝術品被熔掉，鑄成金條和銀塊，堆向西班牙人的寶庫。
在被囚禁期間，阿塔瓦爾帕仍一直以囚徒的身份統治著印加帝國。最後，印加人終於用金銀堆滿了那三個房間，共達6噸黃金和12噸白銀。如獲至寶的西班牙人按軍銜級別瓜分了所有的財富，但是卻仍然沒有要釋放阿塔瓦爾帕的意思。就在這時，有傳言說阿塔瓦爾帕的一支軍隊準備前來營救他。為了杜絕後患，殘忍的皮薩羅決定結束這位印加國王的生命。
1533年7月，無恥的西班牙人竟以通敵罪審判了阿塔瓦爾帕，並判處他火刑。他們還宣布，為了讓阿塔瓦爾帕保存自己的靈魂，他們給他提供最後一個機會：如果他改信基督教，他們就用絞刑處死他。7月26日夜晚，被囚禁了9個月的阿塔瓦爾帕在卡哈馬卡廣場中心誦讀了基督教的經文，改教名為弗朗西斯科。隨後，他被就地處決。可悲的是，盡管他改信了基督教，西班牙人仍然焚燒了他的屍體。
皮薩羅處決了印加國王後，貪心不足的他又企圖獲取更多的黃金。隨後，他帶兵攻進了印加帝國的首都庫斯科。本來他滿心以為，那裏將有無數的黃金珍寶等著他們。然而盡管他們確實發現一些用黃金裝飾起來的廟宇和宮殿，並在庫斯科城近郊的一個洞穴裏，發現了一些黃金器皿和一些金子做成的螃蟹、蛇、鳥等珍貴的物品，但最終也沒有找到傳說中那麼多的黃金。後來，不甘失敗的皮薩羅又聽說，印加帝國的大量黃金在阿塔瓦爾帕國王遭到殺害後，被一部分印加人偷偷地運到印加帝國“聖地”的的喀喀湖中隱藏起來了。得知這個消息後，皮薩羅於1533年12月派部下前去的的喀喀湖探寶。但直到七八年後，皮薩羅至死也沒有能在湖上發現巨量黃金的下落。
隨後，無數來自歐洲的冒險家蜂擁而至，深入亞馬遜密林，試圖找到傳說中的黃金城和黃金湖。其中，有位叫凱薩達的西班牙人率領約716名探險隊員向黃金城進發，在付出550條性命的慘重代價後，終於在康迪那瑪爾加平原發現了黃金城和傳說中的黃金湖，找到了價值300萬美元的翡翠寶石，然而這僅是黃金城難以估價的財寶中的微小部分。幾百年來，對於印加黃金的貪婪從未絕跡。1911年，英國一家公司挖了一條地道，好不容易將黃金湖的湖水抽幹，但太陽很快地把厚厚的泥漿曬成幹硬的泥板，當英國人再從英國運來鑽探設備時，湖中再度充滿湖水，這次代價巨大的打撈行動也歸於失敗。直至1974年，哥倫比亞政府擔心湖中寶藏落入他人之手，出動軍隊來保護這個黃金湖，從此就再也沒有人能夠接近這批寶藏了。