1月：
2日，越南王疏請會剿越南境河陽、興化、山西、宣光邊地諸匪，清廷指示劉長佑、馮子材議奏此事。
4日，法國軍隊進攻越南政府，攻破河內；“越匪”則攻擾北寧。越南向清廷求援，同治諭令瑞麟自欽州率軍出關，會同桂軍支援越南，剿平“越匪”。
12日，岑毓英奏請整頓吏治、營伍；並請撤消團勇，停收勇捐，自雲南開始。同治嘉許之。
13日，疏浚運河工程開工。
15日，成祿論斬。烏魯木齊提督成祿，誣民為盜，擊殺多人，被左宗棠彈劾。禦史吳可讀（甘肅皋蘭人，道光三十年進士），則請斬成祿，以謝甘民。但語過激烈，因以刺聽（探）朝政之過，降調。光緒元年，複起用為吏部主事。
31日，因磨勘（複核）順天舉人徐景春試卷荒謬，對考官尚全慶、都禦史胡家玉等，分別給予降黜處分。
2月：
8日，賞已故提督劉鬆山一等輕車都尉。
17日，停筵宴。
26日，湘軍攻剿古州，“苗亂”平定之。
28日，以法國軍隊進攻越南，越匪攻擾山西（越南地名），進逼中國雲南省境，清廷命岑毓英部署邊防；同日，明令禁止京師私鑄錢幣。
29日，同治奉兩宮太後謁西陵。
3月：
15日，法國、越南第二次西貢條約簽訂，該條約使越南成為法國之保護國。
27日，日本政府海軍官員竄至台灣，於琅橋、柴城地區進行“調查”。
4月：
4日，日本政府又任命陸軍中將西鄉從道為“台灣事務總督”，任命參議官大隈重信為“台灣事務局長”。並派兵三千，準備侵占台灣，以長崎為侵台基地。此時，美國政府則支持日本侵華惡行，以巨輪供日本政府運輸軍隊與軍用物資；並為日本訓練軍事人員。
19日，命寶望為協辦大學士。
22日，修浙江海寧石塘。
5月：
3日，上海民眾示威反對法國人在四明公所（寧波同鄉會會館）公墓內築路，示威民眾被槍殺七人，受傷十二人，引起公憤。法國租界暫停於四明公墓內築路。
14日，日本兵艦停泊廈門，清廷諭沈葆楨統兵輪前往，相機辦理；命李鴻章與秘魯公使會議華工事宜。
16日，日本政府發動了侵華戰爭。首於台灣琅橋登陸。登陸後，即分軍進犯竹社、楓港、石門、牡丹社等地，肆行燒殺搶掠，形同賊盜。當地民眾，則奮起反抗，於牡丹社、石門二處重創日本強盜。日本侵華軍被迫退守龜山，於此建立“總督府”，實行軍事強占。此一消息傳至大陸後，輿論嘩然，群情激憤。清政府則由總理衙門出麵，抗議日軍侵占台灣醜行；同時派兵加強台灣全麵防禦，反擊日軍。經半年時間對峙，日軍接連失利。於此狀態下，美國政府由支持日軍轉而拒絕支持，日本政府見無力搶奪台灣，即轉而進行外交訛詐，威逼清政府承認台灣是無主土地。本年8月，日本政府派駐華公使柳原前光和清政府談判。柳原竟指鹿為馬，否認清政府對台灣的主權，並謬稱台灣為無主野蠻之地。然後進行炮艦恫嚇，謊謂日軍侵占台灣，是奉詔懲辦，並揚言決不停止軍事行動。
9月10日，日本政府又派參議兼內務卿大久保利通為特使來華。大久保對總理衙門談話時，亦否認清政府對台灣擁有主權，並限定時間，逼清政府提出解決台灣問題之辦法，否則訴諸戰爭。總理衙門對此未予理會。大久保又要求清政府賠償軍費，作為退兵條件，但因索價過高，總理衙門予以拒絕。大久保又以斷絕兩國關係要挾。
10月25日，大久保令隨員先行離京返國，並通告英國公使知之。英國公使威妥瑪，恐中日斷交，發生戰事，危及英國在華利益，出麵“調停”，向清政府施壓，促清政府賠款，換取日本撤軍。在英法美三國公使偏袒日本之調停下，清政府隻得又拿出白銀五十萬兩，賠給日本政府。10月，清政府總理衙門總理大臣恭親王奕與日本內務卿大久保簽訂《北京專條》。該條約本文共三條：（一）清政府承認“台灣生番將日本國屬民妄為加害……日本國此次所辦，原為保民義舉（實是指鹿為馬），中國不得以為不是”。（二）對前次遇害難民（指琉球漁民）之家，中國定給撫恤銀兩。日本侵台時期所修建道、房中國留為自用，先行議定賠補銀兩。——此即五十萬兩白銀之賠款。（三）對台灣生番“清政府應妥為約束”，以保以後不再發生類似事件。《會議憑單》部分規定五十萬兩白銀，於12月20日，日本退兵時全部付清。