修建一座集教學、辦公、研究為一體的獸醫館，“以最新之黌舍，承起最新之學術”，這在盛彤笙心中占有極大的分量。為此，他與同仁慘淡經營，曆盡艱辛。
在小西湖選定校址後，就要開始繁忙的基建任務，必須選一個清廉、精幹的人來主持。這時，盛彤笙想到了西北農學院的同事常英瑜。1947年1月，一紙書信飛到位於陝西銅川的省綿羊改良場，常英瑜當時在該場任場長兼技正，一看是昔日的係主任邀請他參加籌建國立獸醫學院，二話沒說，帶上妻子和三個小孩，坐上大卡車，一路顛簸到蘭州，被盛彤笙聘為副教授兼總務長，主持獸醫館的基建和院內事務。此後，他和任教務長的朱宣人一起，成為盛彤笙的重要助手和創建獸醫學院的元老，在時局艱難之際，分擔了院長的許多工作和憂愁，在學院創建上立下了汗馬功勞。盛彤笙曾經回憶說：
“幸虧聘得一位好的總務長常英瑜先生，他是我在西北農學院的老同事，常駐蘭州，辦理收購校址，建築校舍，製備家具等事宜，我則來往於蘭州與南京之間，主要是向教育部爭取經費，向聯合國救濟總署領取並運回援助的設備，特別是羅致師資。”
常英瑜，遼寧人，生於1910年，1933年畢業於東北大學畜牧係，曾在國立武漢大學、國立西北農學院任助教、講師，1943年調至陝西省綿羊改良場。盛彤笙在西北農學院任教時，對他的清廉、精明和實幹精神留下了深刻的印象。在基建任務如期完成後，常英瑜又馬不停蹄地陪同盛彤笙到上海招聘教師，拉運滯留在成都、重慶等地的儀器設備。1952年盛彤笙調任西北局畜牧部副部長時，又將常英瑜要到部裏任獸醫處處長，1954年常英瑜調任國家農業部畜牧局高級畜牧師，工作任勞任怨，從不計較個人得失。盛彤笙去北京開會，多次到家中看望常英瑜，曾動情地說，你辛辛苦苦工作了一輩子，連個職稱都沒有解決，有愧！有愧！常英瑜生前任農業部副總畜牧師，2006年8月去世，享年96歲。
當時修建獸醫館困難很多，最讓盛彤笙心急火燎的事當屬經費，財政部原定給開辦費為20億元，遲至第二年3月第一批經費才撥下來，等錢拿到手，法幣貶值，物價飛漲，買一袋水泥的錢隻能買一斤水泥。中標修建的建築公司“顧慮賠累，逡巡不前”，也就是考慮可能賺不到錢，遲遲不敢接這件活，直至1947年7月間方才開工。很多建築材料的進貨，靠賒賬和借貸。因為經費短缺，盛彤笙逼得走投無路，隻好利用他與社會上層人士的關係，寫信給新疆、寧夏、青海的駐軍，甚至西北行轅主任張治中將軍求援，提出幫助部隊舉辦獸醫培訓班，來爭取經費和材料。
一度，獸醫館的修建因資金而中斷，盛彤笙心中十分窩火。他覺得學校本來在一無所有的情況下就要招生，已經是很難的事情，現在修建因經費問題時停時建，實在難以再幹下去，加之高原反應，身體不適，遂向教育部長朱家驊提出辭呈。校內的師生得知這一消息後，人心惶惶，聯名緊急致電朱家驊：“學院舉債累累，院務幾將停頓，盛院長以學者任院政，已感委曲，甚至近則為此經費支絀，艱巨掣肘，似擬醞釀高蹈，本院員生群情惶惑，果迫而出之，實際勢必院務停頓，大眾解體，員生教學均將直接受損，國家興學初衷勢將違背”，請求挽留盛彤笙。後來朱家驊親自寫信好言安撫，請行政院並親自致函財政部，力促經費盡快撥出，才化解了這場危機。