誇父身死的消息被他的一個朋友，大巫後羿知道了，於是前去找大金烏報仇，哪裏知道，大金烏根本就不將後羿放在眼裏，十大金烏竟然肆意的嘲笑後羿，終於惹怒了後羿，後羿使用他手中的神器，也就是後人所稱的射日神弓和射日神箭，擊殺了眾多的金烏，終於，眾多金烏隻剩下了一個最小的金烏，後羿原本想將小金烏也給殺了，但是想到自己如果這麼做的話，恐怕整個洪荒大地將會陷入永久的黑暗，於是放過了小金烏。
小金烏逃到了天庭了，向帝俊哭訴了自己的九個哥哥是如何的被後羿所殺的經過。帝俊聽了之後，震怒之下，帶著無數妖族前往巫族之地。
當時，我巫族的十二個最強大的存在十二祖巫，看到來勢洶洶的妖皇帝俊和東皇太一，怒喝道：‘帝俊，你我兩族，互不侵犯，今日何故來我巫族！？’
帝俊暴怒道：‘交出後羿，否則本尊今日血洗巫族！’
十二祖巫聽到帝俊的話，頓時大怒，於是，巫妖大戰便是由此爆發！這一戰打的是天昏地暗，日月無光！無數的巫妖二族，死在了這次的大戰之中。當時我巫族之中的祖巫，玄冥和後土兩位娘娘不忍無數生靈的魂飛魄散，於是以自身的無上法力，演化六道輪回，建立了地府冥界！
決戰前夕，祖巫共工和祝融，不知道什麼原因，竟然在不周山大戰，隨後，祝融竟然被共工殺死，共工不知道什麼原因，竟然在祝融死後，向著不周山撞去，共工身死，然而，不周山卻是斷了！不周山乃是撐天的柱子，這麼一斷，天頓時出現了一個窟窿，於是女媧補天……
戰爭愈演愈烈，最後，殘餘的八大祖巫和妖皇帝俊，東皇太一展開了激戰，妖皇帝俊擺出了周天星鬥大陣，對付巫族，而原本十二都天神煞大陣，隻有十二祖巫齊聚，方才可以擺出，如今四個祖巫不在，大陣便是難以啟動，最後，妖皇帝俊、東皇太一、八大祖巫竟然全部同歸於盡！
從此，巫妖兩族便是退出了洪荒的曆史舞台，這一戰，洪荒大陸被打碎成了無數的碎片。此時，鴻鈞看到天地的破碎，於是和眾位弟子，合力將洪荒大地分為仙界和世俗界，從此，普通人便是住在世俗界，仙人們便是住在了仙界。這便是三界的由來。
巫妖大戰之後，巫族元氣大傷，於是便是隱藏在世俗界之中，修養生息，等待著能夠重新稱霸天地。然而，在此後的太古、遠古、中古三個時代之中，巫族雖然出現了諸如刑天的大巫，使得巫族有著崛起的可能，然而當時人族氣運旺盛，巫族根本無法與其抗爭……”