但是六道仙人並不認可因陀羅的想法，並且死前將阿修羅選為繼承者。因陀羅無法接受這一點，並且在黑絕的挑唆下與弟弟阿修羅進行了漫長的戰鬥。
因陀羅死後，其查克拉並沒有消失，而是附身在後世的優秀忍者身上，已知的轉世者為宇智波斑和宇智波佐助，並且因陀羅還是宇智波一族的始祖
因陀羅是大筒木羽衣六道仙人的長子，與生俱來便繼承了仙人之眼——寫輪眼，掌控查克拉的力量和精神能量。
他從小就展現了很高的才能，因此被稱為天才。他最終自負的認定自己不需要他人的協助並選擇了獨居的生活方式，認為實現和平需要力量。
六道仙人從阿修羅的主張中察覺到和平的新的可能，於是六道仙人將阿修羅作為忍宗與世界和平夢想的繼承人並認為因陀羅會輔佐弟弟。
因陀羅因無法認同其父選擇阿修羅當繼承人，在黑絕的挑唆下將怒火轉向了父親以及弟弟。他否定了“忍宗”以及自己的才能，創造出將查克拉當做兵器的“忍術”，並以此向弟弟阿修羅挑戰。就這樣，開始了永不消散的戰火。
因陀羅死後，其查克拉附身轉世在後世的優秀忍者身上，繼續與阿修羅的轉生者們戰鬥。
宇智波斑為因陀羅在漫畫中出現的最早的因陀羅轉世者。
斑的能力出色，得到了長期關注因陀羅及其轉世者黑絕的肯定，所以他選定了斑作為複活輝夜姬計劃的一個棋子，並利用了斑和阿修羅轉世者千手柱間的矛盾，最後來實現月之眼計劃。
宇智波佐助為因陀羅的轉生者。在整部漫畫中也是和阿修羅轉世者漩渦鳴人相互有著深深的羈絆但又卻經常相殘殺。最終，終末之穀之戰結束，鳴人和佐助兩人互相理解，打破了二人兄弟宿命的輪回。從此二人兄弟的後代都不會有轉生者再出現。
阿修羅和因陀羅在情況相似的一個村子裏麵，這個村子依靠神樹的樹汁存活，沒有神樹他們就會麵臨死亡，阿修羅並沒有強製性的要求他們毀掉神樹，而是依靠自己的力量來挖井，最後眾人被阿修羅的堅持不懈感動，阿修羅把自己的查克拉給予給了他們，最終終於挖到了水源。
而因陀羅恰恰相反，因陀羅單憑自己過人的能力無條件給予了村民水源，從而順利毀掉神樹。但這最終卻導致日後村民為爭奪水源而走向滅亡。
最終羽衣認為阿修羅的處世為人方麵更適合成為繼承人，於是選擇阿修羅，本認為因陀羅會輔佐阿修羅管理忍宗，因陀羅因嫉妒心和不甘，開啟了萬花筒寫輪眼。
你可有辦法汲取漩渦鳴人和宇智波佐助的力量，而且對他們的生命沒有威脅？！”
千葉一臉平靜，以他現在的狀態，要考慮的不是之後所要承受的風險，而是如何汲取漩渦鳴人和宇智波佐助的轉世查克拉，以此來獲得寶貴的機會。
大蛇丸聞言臉露難色，保證鳴人和佐助的性命，他也沒有把握。
“那就把千代婆婆傳送過來！她的禁術·己生轉生可以將死人複活。跟外道·輪回天生之術一樣。而且都是用生命力，複活他人。不同的是，禁術·己生轉生隻能複活剛剛去世的屍體。而外道·輪回天生之術隻需要有屍體，哪怕是穢土轉生的屍體，都可以複活！”