聽到忽必烈不再稱自己為“英雄”而是改稱“長史”，蕭遙心中登時為之一振。他知道長史這個官職乃是負責統帥訓練當地漢軍所設，忽必烈如此稱呼自己，顯然是已欲委以重任。但蕭遙轉念一想，自己新投不久，既無功勞，又還沒有建立起自己的勢力，且領軍打仗、*練兵馬並非所長，雖是位高權重，但對於以後的發展卻全無益處，因此想了一下後說道：“王子殿下抬愛，小人感激不盡。可是無功不受祿，這‘蕭長史’三個字，小人是萬萬擔待不起的。”說完納頭便拜，既是謝恩，也有堅決不受之意。
忽必烈雖口稱“長史”，但封這個官職其實隻是臨時起意，隨口一說罷了，他心中想的隻是要將蕭遙收為幕僚，聽計納策，並非真的要蕭遙去為自己統帥兵馬，馳騁疆場。此時他見蕭遙堅決不受，倒也沒有再勉強，說道：“那此事稍後再議吧。蕭英雄，你說成大事者，擁有一套自己的班底和龐大的勢力是最根本的保障，不知此話怎講？”雖然極力掩飾，但言語中隱隱的急切之意卻還是被蕭遙給聽了出來。
言念至此，蕭遙知道時機成熟，於是再無隱瞞，當即直截了當地說道：“王子殿下若想成大事，必須先模仿秦朝官製，在中原找到一個根據地，建立屬於自己的朝廷，推行耕戰，納中原民力為己用，此乃第一步；然後行漢法，依漢例設立官職，完善法紀，募兵糧戶等諸般製度，並且不能像成吉思汗時期，木華黎和耶律楚材那般雖采用漢法，但是時置時廢，咱們須得成係統地堅持下去，此乃第二步。而這兩步一旦成形，以後的一切問題便都迎刃而解了。”
忽必烈其實心中早已有此想法，隻是一直沒有一個明確的思路和計劃，加之他先前為如何治理漠南漢地勞心勞神，是以從未付諸實施。此時蕭遙一言點破，忽必烈如夢初醒，心中那些原本飄忽不定的想法頓時形成了一個整體，越來越清晰地出現在了他的腦海之中。又思索了片刻後，忽必烈忽然開懷大笑道：“蕭兄弟所言甚是，咱們就這麼辦。”
由於宋軍攻打河南邊地，忽必烈請準蒙哥在河南設經略司，任命史天澤、楊惟中、趙璧為經略使。其時恰逢蒙哥分賞諸王，忽必烈得到京兆（長安）封地。他采納了蕭遙的建議後，一番思考之下，決定將自己的中原根據地設在長安，之後與蕭遙促膝而談，二人反複推敲琢磨，終於商定了改革的內容。
首先設置左右丞相，左丞相為蒙古人，居正位，漢人為右丞相，從屬於副。至於這漢人右丞相，忽必烈聽從了蕭遙的建議，決定重禮從長安城聘請聞名關中的鴻儒擔任，而這左右丞相，則是主要負責管理漠南漢地的地方官員考核和任用，選拔與監察官員，總領國家大政方針的議定。其次是國尉，基本由漢人出任，主要是在蕭遙的建議下，建立漢族軍隊後設置。這支漢族軍隊有別於金朝和西夏滅亡後投靠蒙古的漢人世侯軍閥，因其是完全從屬於忽必烈自己的軍隊，主要管理麾下何人領兵，發兵的問題決定。
然後是禦史大夫，由漢人出任，掌管蒙古繳獲自金朝和西夏的文書檔案和圖籍，以及監察手下官員，檢舉謀反與違法行徑的，此三者便合稱為“三公”。
至於九卿的劃分，蕭遙也全都提到，並逐一為忽必烈解釋述說。同時，他還將腦海中自己想出的一些治國理念融入其中。而不管忽必烈最終如何取舍，蕭遙一直苦苦追求和夢想的權利與地位，此時已不再像是以前那鏡花水月般的虛無縹緲了。