對數據的采集和傳輸，主要是將各個分析儀器上所輸出的訊號進行轉化，然後采集到現場控機或者是內置貯存器內部，按照相關的設計要求對數據進行處理，並自動生成各種報表，然後發送到遠程的數據管理重視，同時，在自動監測係統中的所有狀態的參數以及報警記錄也能夠同時傳輸到遠程的數據管理重心，並且便於中心了解到整個監測係統的工作狀態。
2 地表水水質自動檢測係統存在的問題及思考
2.1項目分析方麵
自動監測係統目前還是受到了自動分析儀器的種種限製，並不能順利的對地表水中的所有項目進行分析，因此，在自動監測係統建設的初期，就要對分析項目進行相應的選擇。在對水質自動檢測係統進行建設中，主要分為以下幾種情況：
1）對生活型汙水、農田退水等方麵的汙染，這類汙染主要是以有機汙染為主，因此在進行項目建設的時候，應該選擇適宜的監測技術；
2）對工業方麵的汙染，在對水質自動監測設備進行安裝和建設之前，要對水質的石油類、化學需氧量、五參數、高錳酸鹽指數、硝酸鹽氮等進行詳細的分析，然後再對選擇日常監測所需要的項目。
2.2分析方法方麵
在對分析儀器進行選擇的時候應該要盡量的符合國家的標準要求，但是，在實際的運行當中，卻不能僅僅依靠理論，同時還要結合自動監測的自身特點。有些實際中必須實施的監測項目，其分析的方法還沒有列入到國家的標準方法中，但是隻要這些在線的監測儀器的測量範圍、線性度、重現性、絕緣阻抗以及電壓穩定性等相關指標能夠滿足項目分析的需要，同時分析的結果又能夠與國家的標準方法保持良好的一致性和可比性。
2.3係統的成套性和完整性方麵
在水質自動監測係統的建設過程中，一定要突出其“係統性”。而係統的成套性則就是指分析儀器的繼承以及與之相適應和匹配的配套係統。係統的完成行則主要是指分析儀器以及與其相配套的輔助設備在功能上具有完全性和完備性。係統的成套性和完整性之間是沒有較為嚴格的界限的，它們彼此之間是相互依存的，共同形成了水質自動監測中的“係統性”。但是在實際的工作中，有些監測站完全將這兩種特性分離開來，從而造成了無法順利完成工作的局麵，所以在實際工作中，一定要充分考慮係統的各個方麵的作用和特性，要考慮各個功能之間是否具有完整性，隻有這樣，才能夠保證預處理單元滿足係統分析單元的要求，進而也涉及到了係統的成套性。
2.4地表水水質自動監測係統管理方麵
對自動監測係統的管理主要分為了現場維護和遠程管理兩個方麵。遠程管理主要是指非現場的管理方式，在其它地方或地區，通過與現場工作係統進行通訊連接，對樣品的分析進行日程的安排和製訂，對現場的實時數據以及報警記錄等詳細內容進行查看，對分析結果進行處理，同時還要對圖形等進行分析。在實際工作中，很多監測站往往忽略了遠程控製的重要性，僅僅注重現場維護，缺乏對監測站宏觀情況的把握，監測站應該起到應起的作用，要大大的依靠環境監測中心站的強有力的技術力量，對監測站進行長期的維護費用的投入，保證水質自動監測係統正常的運行，起到監測站應起的作用。
3 關於加強地表水水質自動監測的思考
3.1點位的選擇
在進行國家級網點的選擇的時候，國家主要是從國家宏觀的角度出發考慮，要明確所選地水質要能夠在全國的地表水水質方麵具有宏觀的代表性，同時還應該側重於所選網點所在省的水質以及對汙染情況的控製效果。以淮河為例，首先，國家應該在豫皖交界處的王家壩進行水質自動監測係統的建設是非常明智的，對入境的水質進行監測是十分正確的。但是對於安徽省來說，在淮河上所建設的水質自動監測係統，不僅僅要力爭說明入境水質的基本狀況，同時對點位的選擇上，更應該要立足於淮河幹流上各個城市飲用水水源的預報和預警作用，所以，國家在淮河上進行其他站點的選擇時也應該要包含以上的功能；其次，單位的選擇還要立足於如何能夠促進點位所在省份的經濟發展，在“十一五”期間，淮河領域的安徽省，經濟的發展處於結構調整的關鍵時期，其旅遊在第三產業的發展中也占有較大的比重。所以，在對水質自動監測係統進行建設的過程中，首先應該要考慮網點的選擇和建設，這將直接影響一個省份、區域的經濟發展，對其進行經濟結構調整也具有十分重要的作用和意義。