愛洛伊絲是阿伯拉爾在巴黎主教大教堂的同事富爾貝爾的外甥女，才貌雙全，從小父母雙亡，由舅舅富爾貝爾撫養長大。在富爾貝爾的栽培下，愛洛伊絲自幼受到良好教育，十六歲時已是全法國有名的才女，她精通數門語言，閱讀了大量書籍，學識水平即使在當世的男子中也非常罕見。富爾貝爾一心想要讓他的外甥女成為一位傑出的學者，為此，他邀請阿伯拉爾擔任愛洛伊絲的家庭教師，教授愛洛伊絲神學和哲學。富爾貝爾很清楚，在巴黎，隻有阿伯拉爾能勝任愛洛伊絲的老師。
在《我的苦難史》中，阿伯拉爾記述了第一次見到愛洛伊絲的印象：“這位姑娘容貌可人，才學超群。女人罕有文才，所以她格外地討人喜歡。”他還說：“我相信這位姑娘和我特別容易溝通，因為我知道她懂得和熱愛文學。分離之時，我們可以相會於書信之中；在書信裏，我們可以說許多，說得比見麵時更大膽，並且總是會有交談的快樂。”阿伯拉爾在初次見麵時就被愛洛伊絲的美貌和智慧深深吸引了，原本要“極端的節欲”和“細心而堅決地克製縱欲”的他突然被情魔征服了。而在愛洛伊絲心裏，阿伯拉爾的名字早已如雷貫耳，對知識的渴望，讓她早就想一睹這位青年學生們心目中的偶像的風采。當聽說阿伯拉爾將成為自己的家庭教師時，愛洛伊絲怎能不感到微微驚恐和異常興奮？
一個是當時首屈一指、聲明遠播、才華橫溢、英俊瀟灑的神學家，一個是年輕貌美、單純熱情、情竇初開、對愛情充滿憧憬的少女，兩顆心很快碰撞在一起。阿伯拉爾與愛洛伊絲相愛了。阿伯拉爾在《我的苦難史》中這樣寫道：“我們先是朝夕相處，繼而心意相通。在講課的偽裝下，我們完全投身愛河……書卷雖然打開，我們之間傾訴得更多的是溫柔話語而不是經書的詮釋；交換的更多的是親吻而不是教導。我的雙手不常翻動書頁，卻總是在她的臉龐流連；我們的眼睛不常閱讀書本，卻總是凝視對方。為了避免猜疑，我有時輕輕將她責罰，但這種責罰不是惱怒而是出於愛憐。在此以前，我們從未品嚐過這種歡樂……”兩人愛得近乎瘋狂。激情使他們變得大意起來。終於，他們的戀情被富爾貝爾發現，他暴怒地將阿伯拉爾趕走，並勒令他不許再見愛洛伊絲。但是，分離反而增近了兩人的感情，阻隔反而使愛火燃燒得更旺。他們頻繁地在隱秘的地方幽會，直到愛洛伊絲有了身孕。
可想而知，在基督教信仰基於統治地位的中世紀，如此之情愛是不可能被社會容許的，更何況當事人還是一位著名的神學家、一位前途無量的教士。為了不至損害愛洛伊絲的聲譽，阿伯拉爾一方麵偷偷將愛洛伊絲送到自己的老家，委托妹妹照顧，另一方麵，他又親自去見富爾貝爾，要求他保守這個秘密，並希望他同意將外甥女嫁給自己。富爾貝爾見局勢已無法挽回，便同意了。阿伯拉爾立即著手準備迎娶愛洛伊絲。然而，愛洛伊絲卻不同意與他結婚。愛洛伊絲不願意婚姻的種種羈絆給阿伯拉爾的事業帶來影響，不願意因此葬送阿伯拉爾的前程。愛洛伊絲勸解阿伯拉爾：“你不可能同樣細心的關心你的妻子和你的神學。講課和女仆，典籍和搖籃，書本和撚線杆，羽毛筆和紡錘，你如何能使這一切協調一致？一個需要在神學的默想中沉思的人，怎能忍受嬰兒的啼哭、搖籃曲和男女仆役嘈雜喧鬧的幹擾呢？”
然而，經過一番引經據典的討論，阿伯拉爾還是說服了愛洛伊絲，使她答應結婚。隻是，為了不影響阿伯拉爾的事業，他們決定以秘密的方式締結婚姻，不對外公布。為了保守婚姻的秘密，他們在婚後分居，阿伯拉爾仍然住在自己的單身宿舍裏，愛洛伊絲則回到舅舅富爾貝爾家中居住。他們總是要想辦法見麵。富爾貝爾是一個心胸狹隘的人，他並沒有真正原諒阿伯拉爾。終於，他違背承諾公開了兩人的婚事，還到處散播流言，是阿伯拉爾引誘了愛洛伊絲。愛洛伊絲為此痛苦不堪，堅決予以否認，還為此和富爾貝爾大吵了幾次。
為了保護愛洛伊絲，讓她能夠遠離硝煙，阿伯拉爾將愛洛伊絲秘密送到了巴黎附近的阿讓特伊女修道院，而那裏也成為了兩人幽會的新場所。阿伯拉爾的這一舉動，更加激怒了富爾貝爾。發現愛洛伊絲失蹤後，富爾貝爾怒不可遏。他想，如果不對此做出反應，就會在別人麵前抬不起頭來。盛怒之下，富爾貝爾策劃了一次慘絕人寰的報複行動。他雇了幾個人，潛入阿伯拉爾臥室，不由分說，毆打和閹割了阿伯拉爾。
此事發生在1118年。此時阿伯拉爾不到四十歲，愛洛依絲則不滿十八歲。愛洛伊絲在與阿伯拉爾結婚時曾含淚說：“我們倆都會被毀掉的。”她的話開始應驗了。
四
不久，人人都知道阿伯拉爾遭到了閹割。阿伯拉爾清楚地知道自己已經被毀了。在此之前，總的說來，他的人生和事業還是比較順利的。而在此之後，身體上的創傷倒是其次，這一變故對阿伯拉爾心靈上的打擊更大。想到《聖經》中把閹人描寫成“惡於上帝，禁入教堂，猶如肮髒發臭之怪物”，阿伯拉爾感到他的好名聲不複存在，而且“這驚人的故事將流傳全世界”，自己將成為笑柄。因為不再是一個健全的人，阿伯拉爾在教會中的仕途也算是徹底結束了，而失去教會的庇護，日後也使他一再受到迫害，甚至以罪人的身份離開人世。
這場大禍之後，十八個月的甜蜜生活瞬間成為過去，這對相愛的戀人被迫分手。阿伯拉爾萬念俱灰，躲到了聖丹尼修道院，立誓做起了修士。阿伯拉爾慢慢恢複了內心的平靜，他開始沉浸在哲學的世界裏，重新找回了生存的動力，或者說恢複了鬥士的本性，再一次成為著名的演說家和教師。學生們從四麵八方趕到他的隱居地，聽他講課。阿伯拉爾的主要著作如《論上帝的三位一體和一體性》、《基督教神學》、《神學導論》、《是與否》、《認識你自己》等，都是在這次變故之後完成的。借著這些著作，阿伯拉爾發表了一些驚世駭俗的言論，使正統教會人士深感不滿。
在1121年召開的索鬆主教會議上，《論上帝的三位一體和一體性》被教會譴責為否認上帝獨立人格的撒伯裏烏主義，還不允許阿伯拉爾為自己辯護，因為教會認為阿伯拉爾在論辯的能力上是無人能及的。阿伯拉爾被迫將自己的書付之一炬，而且還被判監禁一年。不久以後，阿伯拉爾又被聖丹尼修道院的僧侶群起圍攻，不得不離開聖丹尼修道院。走投無路之時，阿伯拉爾在塞納河畔諾讓的一小塊領地上，用蘆葦和稻草修建了一座小教堂作為祈禱之所。一些忠於他的學生和仰慕他才學的人追隨而來。阿伯拉爾免費向他們講授哲學，而學生們為了報答他，幫助他開墾原野，用木材和石頭造了一座新教堂，命名為“聖靈修道院”。阿伯拉爾在聖靈修道院度過了非常愉快的一段時光。他對這些熱心學生的演講被保存下來並被編成兩本書。書中有許多對異教思想的讚美，這又激起了來自教會的批評，為他招致了新的敵人，尤其是引來了教會權勢人物、克萊沃修道院院長貝納德的嫉妒和敵視。
為了平息這些批評，他離開諾讓，去布列塔尼擔任吉爾達修道院院長。來到吉爾達之後，他試圖改變這裏的一些陋習，而“卑鄙不馴服”的教士們憤恨這個肮髒發臭之怪物的改革，兩次試圖毒殺他，阿伯拉爾兩次都幸運地躲開了死神。教會不喜歡背離正統的人，就把阿伯拉爾貶到一個更加偏遠的修道院，免得他再惹事端。