上古，混沌一片，天地初開，清氣上升為天，形成九華天眾，化身諸神，濁氣下沉，變化諸魔，隱身九幽魔窟。諸魔覬覦神州，意圖將神州納入魔族地域。為了防止魔族搶占神州大地，眾神搶先派遣女媧下凡造人。女媧以土為身，以水為血，塑造人形，並以大能為人類開啟神智，隨後人類出現，繁衍生息，以軒轅氏為首，足跡遍布神州，漸為神州之主。魔族自然不能眼睜睜的看著神州被眾神占領，便急忙派出以蚩尤為首的一幹魔眾，意圖染指人間，一時，血染神州，屍橫遍野。
人類自然不甘滅亡，以軒轅氏為首的人們奮起抵抗，無奈人類僅為凡身，又怎麼能是上古大魔的對手，人類節節敗退，麵臨淪亡邊境。終於，諸神見憐，賜予人類使用上古清氣，史稱靈氣，教授人類以凡身感悟天道，以靈氣為引，變化諸多神通，並親自為人類打造神劍，以抗眾魔。伏羲大神更是親派自己的女兒九玥仙子下凡，親自教導人類以謀略攻敵。人類習得神通和謀略之後，終於與魔族有了一較之力，並憑著神劍威能，力敵諸魔，最終，軒轅黃帝與蚩尤決戰在汜水邊上，大戰三天三夜，力斬蚩尤首級，還天下以太平，但人類同時也傷亡慘重，軒轅黃帝身負重創，不久於人世，身體與神劍飽受魔氣侵擾，岌岌可危。為了防止神劍入魔，軒轅黃帝懇請伏羲、女媧神祗將神劍鎮壓在九華山下，隨後自絕於汜水邊上。由此，人類宣告踏入了修真年代，軒轅氏被後人尊稱為人皇，手中神劍為軒轅劍，自此，神魔紀年終結，人類步入了軒轅紀年。
軒轅宣曆七十三年，經過長時間的休養生息，人們已經遺忘了昔日大戰留下的創傷，忘卻了神魔時代神魔爭鬥人類付出的慘痛代價，心生驕奢，妄自尊大。隨著人類的發展壯大，神州門派錯雜，各路英雄紛起。加上此時魔族已被鎮壓九幽，神族回歸九華天，不再過問神州事由，人類逐漸坐實了神州霸主的地位，逐漸膨脹的野心再也控製不住。終於在平穩的二十年之後，人間紛爭再起，人們不再安逸於平穩地生活，開始了互相征伐，終於在一次當世正邪兩大門派的鬥爭中，天宗掌門與幽魂穀主兩大絕世高手的驚世一戰中，錯手將九華山一角崩塌。頓時暗雲蔽日，鬼哭陣陣。棟棟魔影中走出一名赤裸妖異男子，白發紅眸，渾身邪紋陣陣，身無片縷，僅手持一把暗黑古劍，渾身散發破滅的氣息。天宗掌門及幽魂穀主驚疑不定，不約而同地發出最強一擊向妖異男子攻去，拿定主意想要將妖異男子擊殺，然而妖異男子視若無睹，一劍出，幽影遍野，萬魂俱滅。天宗掌門當場被格殺，幽魂穀主暗翼老人重傷，魔氣浸體，生不如死，再也不知其下落。
隨後，神州各派均麵臨著當世最大的殺劫，短短三個月時間，神州東郡七十二派皆沉淪魔道。然而最可怕的不是那名九華山走出的妖異男子，而是該男子手中的魔劍。被魔劍擊傷之人，均被魔氣入體，實力稍弱的被魔性泯滅神智，淪為魔人，成為隻知殺戮的怪物。實力強大的也被魔氣侵擾，生不如死，渾身實力十不存一，隨後逐漸被魔氣消磨神智，最終都逃離不了淪為妖異男子的爪牙的命運。