顧憲成乃是世俗大儒，論修為比之戚繼光都高出一籌，若不是他出手，如何能一舉殺死這上百位奸黨？
葉青冥入京之後不久，顧憲成便也跟來了，但他深知奸黨中高手如雲，首惡人物如魏忠賢等人更絕非易與之輩，所以顧憲成便沒急於露麵，而是隱身於暗處，查探奸黨動向，並充當戚、葉等人後援，以防萬一，但不知為何，大明京城之內鬧得天翻地覆，奸黨中的一流高手卻始終未曾現身，因此顧憲成也一直沒出手，直到戚、葉等人安然離去，他才徹底放下心，本想緊跟著離去，可此時奸黨不絕湧來，已將那城牆缺口圍了起來，他隻得出手殺戮一番，掃清道路，方才得以離去。
按理說，葉青冥等人在京城大開殺戒，奸黨中的首惡人物早就應該出頭幹預，但這些強者自始至終都沒露麵，這自然不是無緣無故的，當初是文臣、宦官、外戚等派係聯手，才將武將派係覆滅的，但今夜葉青冥所殺的錦衣衛、太監、捕快之流，大都隸屬於宦官派係，因為他們的職司就是維護京城治安，所以發現有刺客殺人，他們非出麵不可，但文臣、外戚等派係另有職司，根本不願插手，反而準備坐山觀虎鬥，收取漁人之利！
對於這種局麵，那些手握大權的老太監們自然看得很清楚，而且他們都心知肚明，一兩個刺客鬧事根本無關大局，最重要的是不能讓政敵抓住把柄！
在那些老太監想來，刺客敢在京城鬧事，絕對是有所依仗的，若是派麾下高手出麵擒拿，很有可能拚個兩敗俱傷，等於是削弱己方的實力，但若對刺客不聞不問，那將來在朝堂之上又無法交代，因此便派麾下不得誌的小嘍囉去抓捕刺客，若是一戰成功，自然皆大歡喜，若是刺客厲害，把這些小嘍囉盡數殺了，那也根本無關緊要，畢竟天下趨炎附勢之輩多不勝數，隻要自己手握大權，永不失勢，那麼願意投靠效力的狗奴才自然源源湧來！
與此相對的，文臣、外戚等派係也早就得知有刺客在城中鬧事，均知此事可大可小，更可加以利用，所以當夜刺客殺人的時候他們不聞不問，但到了第二天早晨，六科給事中卻一齊彈劾東廠、錦衣衛懈怠瀆職，辦事不利，有刺客潛入京城殺人，居然事先未能察覺，事後又未能抓捕，可謂無能之極，如此辜負朝廷社稷，罪當不赦！
六部九卿更聯名上奏，直指閹逆禍國殃民，敗壞朝政，擅殺功臣大將，致使京師城防形同虛設，更怯懦畏死，縱容刺客行凶，應當立刻將東廠、西廠、錦衣衛的首腦淩遲處死！
這一番彈劾，半真半假，有些事是實情，有些事卻純屬誣告，但詞鋒犀利，咄咄逼人，更先下手為強，將不少太監、錦衣衛下了大獄，嚴刑拷打，逼問同謀，大有把宦官派係一網打盡之勢！
那些手握重權的老太監曆盡宦海沉浮，也絕不是省油的燈，這些文臣借題發揮，乃是他們意料中之事，所以立刻開始了反擊，東廠、錦衣衛傾巢而出，四處抓捕朝廷命官，誣指刺客是他們派來的，意欲顛覆大明王朝，這是株連九族的大罪，顯而易見，宦官派係不僅要把政敵往死裏整，更要斬草除根！
大明京城鋤奸一役前後，所有的事情似乎都在反常，武將舍生忘死，為國為民，卻遭到陷害，葉青冥與此事無關，卻甘冒奇險複仇，奸黨明知刺客殺人，卻消極怠戰，事後又相互指責，大肆攻擊，這一切的一切，看似是不合理的，但卻實實在在的發生了，因為這一切事件的背後，隱藏了兩個字：“人性！”
人性有善，所以有人戰死沙場，報效祖國，所以有人挺身而出，伸冤除惡，但人性亦有惡，所以有人陷害忠良，爭權奪利，更有人放任事態惡化，借機陷害同伴！
人性分善惡，便有是非之分，由此演化世間種種恩怨仇殺、悲歡離合……
葉青冥入京除奸，誅惡無數，固然大快人心，令天下正直之士為之振奮，但對於世俗政權的腐朽並無多大改善，大明王朝內部各大派係借此事為由，又開始了新一輪的內鬥，自相傾軋之下，終於死傷無數，朝野內外，怨聲載道，民不聊生，但事已如此，誰也無法改變。
葉青冥生性豁達，眼見天下大勢不可挽回，也不再耿耿於懷，與汪曉瀾一同隱居於東林書院，日夜潛修，靜等五年之後，誅殺崔允、許淨宗，以報當年國仇家恨，但誰也沒有料到，葉青冥這一次閉關修煉，卻又引發了一場大亂。