於是陰謀開始了，它們開始扶植不同的代理人，成立各種教派，然後以信仰的名義開始了各種規模宏偉的戰爭，或者強迫人類修建浩大的工程。而為了方便管理，一些信奉古神的人類被古神所改造，成為蛾人、蝠人、狼人、暗族、水族等擁有不同形態和強大力量的生命。
的那讓古神們沒有想到的是，在這個過程中雖然如他們所願造成了大量人類的死亡，可是人類自身卻擁有極強的生育力，因此剩下的人類，不僅頑強地生存者，而且還因為戰爭和各種工程施工過程中解決無數難題進一步增強了智慧和凝聚力。
古神開始慌張了，就在此時，一些神秘的未知生命體，也開始降臨這個世界。
這個世界的發展，讓未知生命體驚訝，而人類背後即是統治者又是貪婪的食物鏈頂端的古神，也引起了這些未知生命體的注意，兩種巔峰文明的對撞開始了，從最開始各自扶植不同的人類部落作戰，並將自身的力量或武器分別賜予這些部落中的英雄。
這些未知的生命，同樣被當時的人類視為真正的神靈，因此被稱呼為真神。真神根據古神製造出來的蛾人或暗族等的弱點，在人類中挑選了合適的信徒，然後賦予各種力量，這些信徒因為要參與的是對抗古神的戰爭，因此被稱為“戮神者”。
古神培植的神徒和真神支持的戮神者稱為人類中第一批擁有各種神通和力量的先民，他們擁有的力量卻在某個層麵上是互通的，後來被集體稱為“巫族”。
這場漫長的戰爭從黃帝時代前夕持續了數百年，真神的一些技術被傳授給人類，人類從真神那裏學會從石頭中提煉出金屬，也學會了對於當時的先民智慧來說還十分深奧的“河圖”等高深數學知識，並最終被一個名“伏羲”的人類聖人發展出後來的太極八卦。
到最後古神和真神之間似乎雙方打出了真火，開始直接對抗，於是在壁畫之中，肖炘傑他們看見了無數疑似導彈、激光甚至核彈等先進武器朝體型龐大的古神進攻，這場戰役的地點畫了一副草圖，這副草圖雖然不過是寥寥的幾筆勾勒出來，但是極為精確，就像是在天空之中航拍的一樣，最終戰場被指向了古印度。而根據沈教授對旁邊的符文注釋的翻譯，他們艱難地在其中看到了兩個族民：俱盧與般度。而這兩個名字，都是古印度史詩《摩訶婆羅多》描寫的神戰中的種族。
在一種異常的沉悶之中，他們繼續朝前走去，此時因為神靈之間直接的參戰，兩極的冰川被發出巨大熱量的終極武器消溶，而這也正是古神所刻意引導的。
於是滅世的大洪水產生，時代已經從黃帝時代過渡到了堯舜時期。鯀被人間的帝王授命治水，在此之前他偷竊了真神一項極為重要的成果：息壤。
在壁畫中對息壤的描述，卻並非是他們曾看到的黃色粉末般的東西，而是一蓬似乎有生命的綠色苔蘚，這一點引起了沈萬年的極大興趣。
不過在幾千年前居然有綠色的壁畫顏料被完好無損地保存下來，大家反而不感到奇怪。這大禹地宮本就是一處神奇的所在，那些古神的屍體能曆經千年不腐，很顯然這裏就像是古埃及金字塔的某些地方一樣擁有延緩時間的功能。在古埃及金字塔內如果將食物放置在一些特定的位置，也會曆經數年不腐，而一些本來普通的刀具，更是能變得更加鋒利。
“息壤，這才是真正的息壤，我明白息壤為何會不停生長的秘密了！”沈教授激動地大叫起來。
“用綠色的苔蘚來代表息壤，很明顯息壤並非是一種神奇的泥土，而是一種……生物，確切地說，是被真神改造過的微生物的聚合體，這種生物遇水後就會自動吸收周圍的空氣和養分，大量分裂繁殖，前麵的生物在分裂到一定次數後會徹底死亡並瞬間固化下來，形成石頭一樣的東西……你是想說這個麼，沈教授？”肖炘傑問道。
“對，我猜測它們的生長方向，其實是可以通過能量供應和分裂次數來控製，如果可能的話，甚至能實現定製好需要他們生長分裂的最終的樣子，然後等待建築最終成型就是了。這並是什麼法寶，而是生物學和基因學的巔峰傑作！真神的文明，是和我們現在的文明相通的科技文明，也正因為如此，才會在壁畫中出現導彈、激光這些看似科幻的東西！”沈萬年的情緒依然有些抑製不住的激動，一口氣說完，已經兩眼開始放光了。
“接著往下看吧，或許還有更多的驚訝。”肖炘傑搖搖頭，這個老頭一旦發現敢興趣的東西就會變得執拗無比，誰也勸不住，還是正事要緊。
再往下的壁畫大家其實就比較熟悉了，後來鯀治水失敗被天帝處死，壁畫中的天帝，乘坐在巨大的飛行戰車上，看不出本來麵目。而這戰車的外形在肖炘傑他們看來，無疑就是一艘小型的飛行器，這也從另一個側麵證明了真神是屬於科技文明無疑。