隨著東南二門的打開，徐元吉和牛鳳梧率著大隊清軍蜂擁入城，他們見人就砍，一時間街邊巷裏到處都是倒下的屍骸。此時侯峒曾正在東門的城樓上，其子侯玄演和侯玄潔見城牆兩邊盡是清軍，城牆上的守城鄉兵在內外清軍的攻擊下不斷倒地，急忙對著父親呼道：“現今事已危殆，速請父親隨孩兒殺出重圍！”
侯峒曾奮力掙脫侯玄演，厲聲說道：“為父今日殉國乃天意也！你等速速殺出嘉定，代為父孝奉祖母，你等若不即去，為父這就跳下城牆，死在你等麵前！”
侯玄演和侯玄潔見父親如此這般，隻得率著殘兵，拚著死命向城下殺去，但剛到城下，即被大股清軍圍住，可憐侯氏兄弟和一班鄉兵全都死於非命。
看得自己的兩個兒子就在數十丈外倒地殉命，侯峒曾心如刀絞地大叫道：“蒼天無眼！我侯峒曾有死而已，奈何枉送一城百姓性命！”說罷，翻過箭垛，縱身從城牆上跳下。
鎮守西門的黃淳耀和黃淵耀見清軍從城內向著這邊如潮殺來，知道大勢已去，連忙躍馬向西林庵而去。兩人來到庵前下馬，黃淳耀見法師無等和一班僧人仍在大殿內事佛，乃入殿疾呼道：“清軍即刻就到，請方丈帶著眾人速速離開，我等兄弟在此與各位辭別了！”說罷找來紙筆，就在佛前香案上疾書——
遺臣黃淳耀於弘光元年七月初四自裁於西城僧舍。嗚呼！進不能宣力皇朝，退不能潔身自隱。讀書寡益，學道無成。耿耿不滅，此心而已！異日寇氛複靖，中華士庶再見天日，論其世者，當知予心。
待寫完時，見黃淵耀已自縊於梁上，遂結帶於梁，也上吊於其弟身邊。
駐守在嘉定城內的義師其他首領朱長、馬元調、龔用元、龔用廣等，或被殺，或自刎，或投水，皆在城破之時罹難。
接近晌午時分，嘉定城內各處的義軍已被各路清軍肅清，隻剩下驚恐萬狀的老幼婦孺。那李成棟進得城來，就隻奔縣衙大堂坐下，同時下令屠城。
李成棟的部下接到屠城令後，頓時蜂擁而出，到處亂竄，逢人就殺，見財就搶，若遇見姿色不錯的婦人就擄去奸淫，一時間，整個嘉定城內到處屍身狼藉，血流成河。
那孟文全見滿城百姓遭此塗炭，心下十分不忍，急忙策馬來到縣衙，剛要進門，就被牛鳳梧攔住道：“大帥曉得先生要來，令俺在此攔住先生。若先生進去，俺老牛會被大帥砍了腦殼，還望先生體諒。”說完，他拍了拍孟文全的肩膀，小聲道，“你可找元胤，那小子正在南門，可千萬不要說是俺老牛的主意。”
待孟文全找到元胤時，見元胤正率著熊慶和熊喜在那裏製止著兵士們的屠戮和掠搶，雖是起了些作用，但一些兵士們在離開了他們的視線後，又開始了暴行。
“我想見你父帥，可他不肯見我。孟某實在不忍看見百姓慘狀！”孟文全拉著元胤的手說道，“你可向你父帥傳話，若是不能即刻停止殺戮百姓，孟某當掛冠而去！”
“孟叔千萬不要錯怪了父帥。”元胤說著，揮手讓熊慶和熊喜等一班親兵退到了一邊，小聲對孟文全說道，“父帥原想破城之後，將侯峒曾、黃淳耀幾個賊首問斬之後就出榜安民。因為父帥認為，即便是二叔的死，也隻是幾個首惡之為。無奈昨日博洛貝勒令到，令父帥在城破後行揚州之事，否則軍法從事。父帥隻得下令屠城，同時令我暗中製止，能救多少是多少。”
“唉！孟某這點確是不知。”孟文全知道，嘉定的百姓是在劫難逃了。
“孟叔萬不可將此事說與他人。父帥曾叮囑小侄，此事隻能讓孟叔知曉，其他將領，即使是牛鳳梧和陳甲也不能告知，他們若是酒後亂說，就會惹出天大事端。”
“想不到大帥竟是如此苦心！”此時孟文全覺得倒是自己有些唐突了。
嘉定城被攻下數日後，清廷就傳下聖旨，將李成棟擢升為江南提督以示嘉許，其他有功將領也各有升遷和封賞，一時之間，李成棟的大營內，到處是喝酒慶賀的將士。
那牛鳳梧因為升為署理總兵官，也被一班部下拉去喝酒。酒肉正酣之際，突然有小校來報，說是駐防嘉定城內的姚成所率的人馬被一股明軍偷襲，死傷多人，李成棟為此非常震怒，令牛鳳梧速速帶隊前往城內剿滅這股明軍。
“他娘的，竟敢壞了老子的興致！”牛鳳梧聞得李成棟的將令，也不敢有絲毫怠慢，罵罵咧咧地將酒碗一推，站起身來，朝著瞪著眼睛發愣的那些部下吼道，“還不跟老子滾起個？快給老子點起人馬，殺往嘉定！若是因你等耽誤造成姚成有失，老子定然砍下你等的腦袋！”