總部對門店的培訓服務一是基礎培訓，也就是新員工正式上崗前的培訓，要通過培訓為門店複製大批執行人員，保證門店的人力需求；二是提升培訓，要結合每個員工的成長潛力和藥店的發展需要，製定詳細的培訓計劃，為門店培養出獨具特色、在企業運營各領域能獨擋一麵的專業人才。
督導服務
門店一旦開始運作，許多運作問題將接踵而至。如果僅靠培訓部門定時定量的培訓課程，肯定會應接不暇。因此，總部才會設立一個市場督導部。顧名思義，督導就是監督和指導的意思。連鎖藥店的督導員，就是對各門店工作進行監督和指導的人。當然，隨著行業的不斷發展，督導這一名詞也被賦予了越來越多的含義。但有一點卻一直未變，那就是服務——要為門店的盈利竭盡全力提供服務。
目前國內連鎖藥店的督導機製並不完備，作用也不明顯。目前的狀況是：門店聽說督導要來，皆嚴陣以待，如臨大敵；督導每次去門店則是全副武裝，不抓出點毛病來誓不罷休。而整個公司的督導係統則是以依據條款扣分為目的，方法簡單粗暴，根本達不到提升門店運營的目的。督導員一定要記住，強大如沃爾瑪，其創業之初三大座右銘之一就是：“尊重每一個員工”；然後要問一問自己：今天，你是去督導檢查，還是去督導服務？
信息服務
信息服務功能是目前連鎖藥店所有終端門店急需而總部最缺失的部分。說其急需，是因為門店是總部運營策略的直接執行者，日常工作重複而枯燥，簡單而繁重，人員素質普遍偏低，沒有足夠的時間和能力進行信息的收集與分析，而門店又偏偏是市場競爭的一線陣地，在激烈的市場競爭中如果失去了信息優勢，也就必然失去企業生存的立足之本；說其缺失，是因為隨著連鎖門店規模的急劇擴張，企業人員數量的大量增加，日漸繁雜的運作問題及行政作業，使得總部從業人員焦頭爛額，如果再加上管理高層缺乏較宏觀長遠的視野，隻關注當前利潤的增加與市場占有率的提高，則此項功能往往成為令人遺憾的犧牲品。
建立專門的信息部門，搜集一些如經營環境的變化、經營相關資訊的整合、行業內國際發展趨勢、新觀念新技術及內部營運資訊整合、競爭對手發展趨勢等相關市場信息，明晰自身的優勢，找準對手的劣勢，結合門店運營的成功案例，由個性推演出共性，製定可推廣的運作模式，隨時隨地向各門店提供強有力的信息支持，才能保證門店在市場競爭中克敵製勝。
商品服務
一個企業的利潤，最終是通過商品的銷售來實現的。門店商品銷售是否能實現盈利，一是看門店的商品結構是否契合商圈內顧客的消費需求，二是看顧客需求的商品是否能保證充足供應。這就對連鎖藥店總部的商品服務提出了兩個要求：一是藥品采購的通道要順暢，采購回來的藥品要適合市場；二是對門店的配送能力能跟上藥品銷售的速度，總部對門店的實時銷售數據要做到了然於心，在二次配送的時候能根據門店的實際需求進行對口的品種配送。在第二點上，國內的連鎖藥店大都做得比較好，但在品種的采購上還存在不少問題，值得業界重點關注。
反複強調要做好總部的服務工作，是因為在未來市場競爭中，不會再是傳統方式的勝利，而是商業模式的勝利，是意識形態的勝利。誰擁有先進的商業模式，擁有先鋒的思維方式，誰才有可能成為未來市場競爭中的勝利者。
門店的SI體係（形象設計）包括店內布局與店外布局。店內布局又包括基本布局和美化布局，目的是為門店營造出最好的形象以招攬顧客。店外布局可以通過廣告傳播，塑造連鎖品牌形象，為顧客進入門店消除顧慮。