應龍師在得到黃帝的授權後，在南極基地遙控指揮軍事衛星瞄準亞特蘭蒂斯，準備打擊蚩尤國。後羿使用“女媧”號運載火箭運送到太空站上的十顆衛星，就是軍事衛星，是十個反物質武器，是女媧娘娘與黃帝全力打造的終極大殺器，不到萬不得已不會使用。形勢越來越危急，月球飛碟受損麵擴大，應龍師果斷按下反物質武器發射按鈕，同時啟動十顆軍事衛星反物質太空武器，轟擊亞特蘭蒂斯重要據點。應龍師與誇父同時率領空軍前往蚩尤國準備進行進一步的轟炸。
蚩尤國的能源中心被摧毀，整座城市失去能源供給。在如此巨大能量的轟擊下，亞特蘭蒂斯的火山也開始冒煙，有隨時噴發的跡象，蚩尤國好像是處於地震之中。蚩尤已經意識到黃帝是動了殺機，要把亞特蘭蒂斯從地球上抹去。自古勝者為王，敗者為寇，也沒有什麼怨言可講的。
亞特蘭蒂斯處於地動山搖之中，由於能源被截斷、毀壞，針對月球飛碟的遠程攻擊無法再繼續進行，在反物質武器的攻擊下，亞特蘭蒂斯的火山變得活躍起來，地震、火山爆發陸續發生，亞特蘭蒂斯開始出現沉入海底的跡象，看著漫天的火雨、濃煙、飛塵，蚩尤國的人民驚惶失措，許多人收拾行李後在大道上奔跑，一波又一波的人湧向機場、碼頭，一架架飛機、輪船離開亞特蘭蒂斯，有的飛往埃及，有的駛往北極，有的前往美洲，四散逃命……
風伯則帶領一支效忠於他的部隊與應龍師取得聯係，表達全軍投降之意，並向應龍師出示了女媧娘娘的密件，原來風伯就是多次給華夏天之九部提供情報的神秘人！一代戰神蚩尤與蚩尤國人族女王雨師則拒不投降，選擇了與亞特蘭蒂斯同沉海底。在亞特蘭蒂斯消失在茫茫大海之後，應龍師、海神禺京、誇父、風伯等眾人浩浩蕩蕩地返回華夏大陸，向黃帝複命。
已經白發蒼蒼的應龍師向黃帝複命之後，向黃帝請求卸甲歸田，做一位自由自在的漁樵，黃帝見應龍師已經厭倦了戰爭，挽留恐怕不容易，於是讓應龍師先去找個中意的山川領地好好休息一陣子，放鬆一下心情，卸甲歸田的事以後再說。
應龍師覓得一處山川，在那裏居住休憩，看著滾滾長江東逝水，浪花淘盡英雄。感歎是非成敗轉頭空。青山依舊在，幾度夕陽紅。這位白發漁樵則坐臥在江渚之上，慣看那秋月春風。
全球核戰的慘烈戰爭雖然已經結束，但是更大的災難卻正在一步一步地降臨……