此戰中，第三軍傷亡兩萬餘人，所有280毫米攻城炮被炸毀，損失了所有炮彈。而且士兵們對指揮官的不滿達到頂點，無心再戰，也無力再戰。
恩基的守軍也是傷亡慘重，第101步兵軍傷亡三千人，協助防守203高地的民兵傷亡一萬人，北方的敵後遊擊隊傷亡三千人。
勝的如此慘烈，恩基心裏異常沉重。
恩基下令繼續擴充民兵隊伍，利用繳獲了敵人的兩萬支三八式步槍，以及兩百萬發子彈，20個步兵小隊很快建立起來。補充了這場戰鬥的巨大消耗。
於是，第三軍原地休整，兒玉回到滿洲軍司令部彙報情況。
乃木將203高地改名為爾靈山，並建造了一座高大的炮彈形紀念碑。
他感慨戰事慘烈，作詩一首：
爾靈山險豈難攀，
男子功名期克難。
鐵血覆山山形改，
萬人齊仰爾靈山。
至於下一步的行動，乃木心裏沒底，於是回國向大本營述職。
在大海上，乃木回想起這次慘烈的大戰，陷入極度悲痛。
抵達倭國之後，乃木看到前來迎接他的陸軍參謀總長山縣大將以及大量平民，說了一句話：“吾乃殺乃兄乃父之乃木是也！”
然後，人群中痛哭一片。
於是，他作詩一首：
皇師百萬征強虜，
野戰功城屍做山。
愧我何顏見父老，
試問今日幾人還。
乃木來到皇宮，開始向天皇述職。
乃木軍司令官：“微臣乃木，在一切匱乏的情況下，臨危受命擔任第三軍司令官，前往執行旅順攻略戰。在兩次正麵總攻擊失敗後，轉而集中兵力全力進攻203高地。”
“然而，在四個月的時間裏，敵人寡不敵眾依然堅持奮戰，給我軍造成空前的巨大傷亡，倒在敵人刀劍以及槍林彈雨下的士兵們，臨死前高呼著天皇班塞而欣然長眠。有了這麼多忠勇愛國、視死如歸的武士，尚且造成如此大的傷亡，對此臣感到終生遺憾。”乃木單膝跪地，大哭了起來。
在場的官員們無不悲痛萬分，皇後用手絹輕輕抹著眼淚。
天皇也不禁悚然動容，派遣那麼信任的幹將去尚且如此吃力，如果換做別的將軍肯定一敗塗地。
天皇走上前去，拍著乃木的後背表示勉勵：“乃木，你可知這次的對手是誰？”
乃木：“微臣一開始隻知道是個乳臭未幹的毛頭小子，高幹子弟，後來才知道不是如此。”
天皇：“在大戰進行中，朕已經派特工查明了他的身份。知己知彼，百戰不殆。”
“此人名叫恩基，雖然隻是個少將，但卻是個軍長，可見其家庭背景與能力確實不一般。他是滿洲軍區副司令員安努大將之子，極為擅長防禦作戰，頭腦靈活，見多識廣，擅於發掘新式武器投入作戰，比其他那些井底之蛙要強很多。”
乃木：“此次作戰中，第三軍領教了他的尖刺鐵絲網、鐵蒺藜、重機槍、連發步槍、雷擊炮、遊擊隊等奇技淫巧，敗給這樣不循常規的狡詐對手，臣沒什麼好說的了。如果是兩軍在平地上交鋒，臣有必勝的信心，可這仗打得窩囊啊！臣有勁使不出來。雖然第三軍打敗了，但臣不服！”