隨後的事情就很簡單了，這十幾年來，牛玉生夥同村主任，一共貪汙了近2000萬元，涉及村裏的所有幹部，隻是有輕有重。林水根考慮了一下，先對牛玉生和村主任實施抓捕定案，其他的村幹部，隻要認罪態度較好，能把貪汙分贓的資金退還的，一律既往不咎。牛頭村的七八個村幹部，一看村支書都被抓起來了，哪裏還敢反抗，隨即想鎮檢查組投案自首，2天之內，就退還了全部的分贓，林水根就代表鎮委，對他們不予起訴。
但是死罪可饒活罪要承擔，這七八個村幹部，全部被拿下。林水根親自主持牛頭村的重新選舉，整個牛頭村是歡呼雀躍，新的村委領導班子，也很快建立起來。林水根完成了對牛頭村的治理，對於其他三村也沒放鬆，早就派人把其他三個村的村委賬目全部控製，其他三個村的村支書和主任，也被全部拿下，悉數進了監獄。整個棋山鎮的44個村，村民全部震驚了。
看來這次，鎮裏是要動真格的了。於是乎，各村裏的村民，也被調動起來，紛紛來到鎮裏舉報自己村裏的村幹部的貪汙情況，林水根是安排了全鎮的幹部，積極接待，全鎮44個村，全部都進行重新選舉，這次不是黨員選舉，而是全村選舉，全部由鎮幹部監督之下進行。全鎮的44個村無一例外。
全部更換了新的領導班子，至於對原先的村幹部，隻要認罪態度較好，並能退還貪汙資金的，一律免於起訴，但對於情節特別惡劣的村幹部，則是嚴肅懲治，最後，棋山鎮的44個村，有30個村的原支書和主任，態度還是良好的，還有10個村的村主任，很是強硬，他們都認為林水根不敢犯眾怒，都抱著法不責眾的心態。林水根就從市裏調集紀委幹部，對這些人進行徹查，加上開始的4個村，一共是14個村，28個村幹部，全部送進了監獄。到了此時，這些人才明白，林水根是天不怕地不怕。
這些人再想坦白從寬，已經是晚了，隻能在監獄裏度過自己的餘生了。
棋山鎮44個村全部換上了新的領導班子，所有的村裏都有了活力一般。
林水根趁熱打鐵，就召開了全鎮的村支書和村主任會議，主要的是三條。
第一：每一個村委，都要建立監督機製，誰要違反亂紀，決不輕饒。
第二：財務要公開透明，所有的汙染補貼，要全部給村民，村委不留一分。
第三：每一個村都要建立自己的企業，不管是集體企業，還是私人企業。
這三條，隻要有一個完不成的，就自動辭職，鎮委就不再另行通知了。
這44個村的幹部，都感到了自己肩上的沉重，都紛紛詢問林水根，村裏要發展是可以的，可是也不是很容易，這要牽扯到資金，項目等問題。
林水根就向大家保證，需要資金的可以提出來，鎮裏幫忙貸款，但是，項目確實自己找出路，鎮裏是政府，不是保姆，每一個村幹部都要自己去想，想不出來的，就讓賢給別人，省的鎮裏再進行第二次選舉。
這樣一來，所有的村幹部，都感到了希望，沒有一個村說自己不行。
幾天以後，棋山鎮的財政所長笑嘻嘻的來到了林水根辦公室。
“林記，44個村的幹部退賠資金就是8個億啊，這個錢怎麼處理？”
林水根笑笑：“老李，你是老財政了，你說怎麼處理？”李樹明笑笑，說道：“林記，這錢嘛，應該是取之於民，用之於民，可是，鎮裏也太窮了，是不是截留一部分？”林水根嘿嘿一笑：“截留？那就不用了，這筆錢要是發下去，豈不是給新的村幹部，製造貪汙的誘因？全部留下，作為鎮裏的發展基金，將來，鎮裏也需要大量的資金，要為全鎮的建設，做好準備”。李樹明一聽就明白了，林記真是一個不按套路出牌的幹部。