為配合智利軍隊在帕科查港登陸，1869年，太平軍在陳永碌的指揮下和秘、玻聯軍再次在莫克瓜激戰。他們仍然采用誘敵深入的作戰方式，將敵軍誘入伏擊圈。此役雖未獲勝，但是，卻給敵人以非常深刻的印象，用玻利維亞軍一位軍官的話說：“這些頭帶褐色圍巾的人群，在射程之外搖旗呐喊著，等到我們靠近時又不見了，他們打仗時動靜很大，鑼鼓喧天，很多印第安雇傭兵驚慌失措，紛紛逃跑，誰也阻止不了。”這就是驚心戰，也是太平軍較為慣用的一種作戰方式。因為太平軍的軍事行動給秘、玻聯軍帶來很大的牽製，壓根無暇應對帕科查港戰事，以致智利軍順利登陸，傷亡輕微。
到了第二次莫克瓜戰役時，太平軍終於和智利軍並肩作戰了，當時身為中將的西拉皮佐會見了陳永碌，在得知翁德容已於兩個月之前病死的消息後，就授予陳永碌上校軍銜，並參觀了他所率領的軍隊，經其授意，陳永碌將其所在部隊三角旗上的太平二字，換成了智利國徽。
在莫克瓜戰役中，太平軍不畏犧牲，奮勇殺敵，秘、玻聯軍被打得很慘，這使得當時指揮秘、玻聯軍的司令官快要發瘋了，戰場上到處躺著秘、玻聯軍的屍體。太平軍共有400人傷亡，他們奪取了4門大炮、15麵軍旗、大量的輜重與200餘匹戰馬。戰後，西拉皮佐授予陳永碌智利國會勳章，並對陣亡的太平軍家屬進行撫恤。緊接著太平軍又配合智利軍隊打響了塔克納與阿裏兩次戰役，徹底打敗了玻、秘聯軍。自此以後，智利軍隊占領了太平洋沿岸全部的硝石產地，玻利維亞在連番打擊之下已經失去了繼續戰爭的能力。
戰爭結束之後，智利政府兌現了自己的承諾，將伊基克贈予太平軍餘部，成立了自治鎮。但智利政府要求太平軍繼續幫助智利攻打秘魯，然而，太平軍並不願在異國當炮灰，他們沒有接受這一建議，而是甘願融入當地社會。
據考證，在今天的伊基克，有1/4的當地人身上有著華人的血統，仍然保持著濃鬱的中華傳統飲食文化，也深受中國文化的影響，當地語言把中餐館叫“其發”（廣東話吃飯），混沌被稱為“完蛋”(浙江話混沌)，就是模仿漢語的發音。
1881年1月17日，智利軍隊攻占秘魯首都利馬。1883年10月20日，秘魯與智利在利馬北部安孔城簽訂條約，太平洋戰爭結束。依安孔條約規定，秘魯屈辱地將塔拉帕卡省割讓給智利，並將塔克納和阿裏卡兩地區交予智利管轄10年。而玻利維亞則先後於1884年和1904年與智利簽訂瓦爾帕萊索協定和“和平友好條約”，從而徹底喪失了安第斯山脈與太平洋沿岸之間的全部領土，變成了一個內陸國，嚴重地影響了其經濟的發展。