淨現值法具有廣泛的適用性，在理論上也比其他方法更完善。淨現值法應用的主要問題是如何確定貼現率，一種辦法是根據資金成本來確定，另一種辦法是根據企業要求的最低資金利潤率來確定。前一種辦法，由於計算資金成本比較困難，故限製了其應用範圍；後一種辦法根據資金的機會成本，即一般情況下可以獲得的報酬來確定，比較容易解決。
2.現值指數法
這種方法使用現值指數作為評價方案的指標。所謂現值指數，是未來現金流入現值與現金流出現值的比率，亦稱現值比率、獲利指數、貼現後收益―成本比率等。
計算現值指數的公式：
現值指數=∑nk=0Ik（1+i）k-∑nk=0Ok（1+i）k
A、B兩項投資機會的現值指數大於1，說明其收益超過成本，即投資報酬率超過預定的貼現率。C項投資機會的現值指數小於1，說明其報酬率沒有達到預定的貼現率。如果現值指數為1，說明貼現後現金流入等於現金流出，投資的報酬率與預定的貼現率相同。
現值指數法的主要優點是，可以進行獨立投資機會獲利能力的比較。在前例中，A方案的淨現值是1669元，B方案的淨現值是1557元。如果這兩個方案之間是互斥的，當然A方案較好。如果兩者是獨立的，哪一個應優先給予考慮，可以根據現值指數來選擇。B方案現值指數為1.17，大於A方案的1.08，所以B優於A。現值指數可以看成是1元原始投資可望獲得的現值淨收益，因此，可以作為評價方案的一個指標。它是一個相對數指標，反映投資的效率；而淨現值指標是絕對數指標，反映投資的效益。
3.內含報酬率法
內含報酬率法是根據方案本身內含報酬率來評價方案優劣的一種方法。所謂內含報酬率，是指能夠使未來現金流入量現值等於未來現金流出量現值的貼現率，或者說是使投資方案淨現值為零的貼現率。
淨現值法和現值指數法雖然考慮了時間價值，可以說明投資方案高於或低於某一特定的投資報酬率，但沒有揭示方案本身可以達到的具體的報酬率是多少。內含報酬率是根據方案的現金流量計算的，是方案本身的投資報酬率。
內含報酬率的計算，通常需要“逐步測試法”。首先估計一個貼現率，用它來計算方案的淨現值；如果淨現值為正數，說明方案本身的報酬率超過估計的貼現率，應提高貼現率後進一步測試；如果淨現值為負數，說明方案本身的報酬率低於估計的貼現率，應降低貼現率後進一步測試。經過多次測試，尋找出使淨現值接近於零的貼現率，即為方案本身的內含報酬率。
根據前例的資料，已知A方案的淨現值為正數，說明它的投資報酬率大於10%，因此，應提高貼現率進一步測試。假設以18%為貼現率進行測試，其結果淨現值為負499元。下一步降低到16%重新測試，結果淨現值為9元，已接近於零，可以認為A方案的內含報酬率是16%。
如果對測試結果的精確度不滿意，可以使用內插法來改善。
內含報酬率（A）=16%+（2%×99+499）=16.04%
內含報酬率（B）=16%+（2%×33822+338）=17.88%
年份現金淨流量貼現率=18%貼現率=16%貼現係數現值貼現係數現值0（9000）1（9000）1（9000）112000.84710160.8621034260000.71843080.7434458360000.60936540.6413846淨現值（22）338C方案各期現金流入量相等，符合年金形式，內含報酬率可直接利用年金現值表來確定，不需要進行逐步測試。
設現金流入的現值與原始投資相等：
原始投資=每年現金流入量×年金現值係數
12000=4600×（p/A，i，3）
（p/A，i，3）=2.609
查閱“年金現值係數表”，尋找n=3時係數2.609所指的利率。查表結果，與2.609接近的現值係數2.624和2.577分別指向7%和8%。用內插法確定C方案的內含報酬率為7.32%。
內含報酬率（C）=7%+（1%×2.624-2.6092.624-2.577）
=7%+0.32%
=7.32%
計算出各方案的內含報酬率以後，可以根據企業的資金成本或要求的最低投資報酬率對方案進行取舍。假設資金成本是10%，那麼A、B兩個方案都可以接受，而C方案則應放棄。
內含報酬率是方案本身的收益能力，反映其內在的獲利水平。如果以內含報酬率作為貸款利率，通過借款來投資本項目，那麼，還本付息後將一無所獲。這一原理可以通過C方案的數據來證明。