隨後，囂張的邪教叛軍一麵用鐵索懸木墜崖窯外，一麵在崖窯下邊堆放柴草，縱火燃燒。一時煙焰熏逼崖窯，崖窯內老幼男女均被熏死。在一天之內，叛軍連破四崖窯，熏死糜爛百餘人，其狀慘不忍睹。
帝國九州省，在幕府的暗中支持下，邪教分子趁帝國內部發生暴亂之時，發動武裝叛亂。
叛軍首先進攻山梨縣，不想山梨縣城牆堅厚，抵抗頑強。叛軍攻了兩天，死傷數千人，決定向西撤去。兩天之後，叛軍進入伊娜境內。州城內守備司令劉琳、副司令員田雄二率守備部隊兩千人堅決防守，各個集體農莊“出力練團，設法捍禦城防”。
依娜城堡用鋼筋混凝土建造，城內防守嚴密，叛軍依舊無法進攻，遂兵分兩路，進攻南北各地堡寨、以及村莊。所過之處焚燒掠奪一空。南路叛軍進至中川村的雞鳴寺與生產建設兵團戰士遭遇，雙方展開激戰，邪教叛軍失敗，死傷慘重。
北路叛軍進占辰野町等地。百姓紛紛並村入寨，上崖窯躲避。有的藏匿在溝塹、山洞裏。
邪教叛軍找到內線，讓內線通知百姓，“承諾找回百姓，互不相害。”
辰野町百姓進村後，立刻慘遭叛軍傷害，隻有極少數幾人逃脫。一時屍枕藉壘，血流漫道。
華夏帝國皇帝周垣聽說辰野町慘案之後，大為震怒，命令琉球島總督宋獻策派兵進入九州省平叛，同時，帝國南新羅省野戰軍，乘坐東海艦隊的軍艦，渡海作戰。
四月，邪教叛軍竄至下呂城一帶。叛軍首領犬養次郎率領軍隊攻打小秀山的清涼寺。
清涼寺三疊依山鑿築，易守難攻。集體農莊的戰士據崖窯抵抗，叛軍連攻五日未克，擄殺附近鄉民，將柴草堆放岩洞下，以辣椒蓋上麵，縱火焚燒，很多人忍受不住，不得不向外逃。
眼看清涼寺就要被攻克，戰士們的家屬婦女們不願落入叛軍手裏，紛紛投崖自盡。
駐守在加賀的帝國野戰部隊78軍512獨立團，經過大冶縣和郡上鎮，直撲小秀山。
邪教叛軍唯恐遭到包圍，擄掠一番之後，匆忙離去。兩天之後，與長野縣的叛軍會合。一萬兩千多名叛軍欲攻長野縣城新城堡。
長野縣的奸細藍原雄一向叛軍提供情報：“昨天派人偵察長野縣虛實，城無堞，營無兵，惟生產建設的民兵400多人，如果強攻，城可得。”
邪教叛軍派出一百多名驢騎兵為先鋒，直奔長野縣城誘戰。縣城內守軍連長酒井見敵兵不多，遂帶民兵出城迎戰。不料叛軍竟然詐敗撤退，民兵們窮追不舍。追至黑龍溝，邪教叛軍伏兵四起，喊殺振穀，民兵大敗，死傷慘重，酒井不堪屈辱剖腹自殺。
叛軍乘勢圍攻縣城，用火燒城門，集中火力猛攻。半天之後，長野縣城被敵人攻陷。
此刻，城內亂作一團。很多武士、民兵、官員多戰死。城內婦女們飲毒藥、懸梁自盡者數百人。士民商人在交出財物之後，全部被砍了頭。
512獨立團連夜行軍至長野縣城之後，立刻投入戰鬥。
叛軍做短暫的抵抗之後，帶著戰利品棄城逃走。
512獨立團與九州生產建設兵團戰士，在立科町聯合圍截叛軍，將15000名叛軍全部處死。
立科町硝煙還沒有散盡，另一股邪教叛軍圍攻北海道的旭川。