最後，摩洛哥素丹阿卜杜爾?馬利克一世手舉彎刀，指揮軍隊將葡萄牙人包圍在馬哈讚河附近的阿爾卡塞爾?吉比爾，
塞巴斯蒂昂率領的葡萄牙軍隊且戰且退，在橫渡馬哈讚河時，癲癇發作，不幸溺死，終年24歲。但是很可惜，葡萄牙人沒有找到國王的屍體，於是他們想當然的認為，塞巴斯蒂昂一世失蹤了，是因為無臉見江東父老而去到南美。總而言之，塞巴斯蒂昂一世永遠活在葡萄牙人民心中。
不過，塞巴斯蒂昂走得很安然，因為他的對手，阿卜杜拉?馬利克一世因陰魂索命，在第二天也死掉了，向偉大的真主報道去也。
鷸蚌相爭漁翁得利，摩洛哥被廢的素丹穆罕默德?穆泰瓦基勒成了最後的贏家，那一天，他揮揮手送別葡萄牙軍隊，“送戰友，踏征程，默默無語兩眼淚，耳邊響起駝鈴聲，路漫漫，霧蒙蒙，革命生涯長分手，一樣分別兩樣情。”
塞巴斯蒂昂一世的失蹤，很快被演繹成葡萄牙愛國者眼中的傳奇，他成為“沉睡的國王”，總會在葡萄牙最危急的關頭出現，像英國的阿瑟王、德國的腓特烈一世一樣。
雖然葡萄牙國王塞巴斯蒂昂一世死了，但是，他與西班牙公主的婚約還是有效的。於是表哥、西班牙國王腓力二世決定送西班牙公主、王位繼承人女公爵卡塔琳娜一世來到葡萄牙，“這就是你們的新女王。”
塞巴斯蒂昂一世的叔爺爺、沒有子嗣的紅衣主教恩裏克準備還俗繼承王位，但是，腓力二世決定不予承認，同年11月，腓力二世決定派阿爾瓦公爵帶領軍隊開進葡萄牙，很快攻陷裏斯本。
葡萄牙議會在大刀和長矛的逼迫下，有條件的承認西班牙國王腓力二世兼任葡萄牙國王，稱費利佩一世。而卡塔琳娜一世則代表國王行使權力。
葡萄牙議會提出的條件是，葡萄牙維持由一獨立政府管治，不受西班牙政府管轄。葡萄牙王國及其海外領地不得被國王擅自收編為西班牙領土或行省，維持葡萄牙語的國語地位。腓力二世表示同意。
西班牙吞並葡萄牙的同時，也繼承了葡萄牙的海外殖民地。現在，西班牙成為16世紀末期世界上最強大的國家。而那時的明帝國，還沉浸在天朝上國的舊夢之中，絲毫沒有意識到這個世界已經不同以前！
此刻西班牙，在外人看來強大和富有，但是這一切隻維持在表麵。因為西班牙的財政已經步履艱難，頻臨破產。消費主義的流行，讓西班牙工業發展極度緩慢，而對外的戰爭，幾乎將國庫耗盡。同時，英國海盜船在英國皇室和議會的支持下，合法的，打劫西班牙，從美洲運回的載有所急需要黃金、白銀的貨船。
腓力三世在1598年登上西班牙帝國的皇位，西班牙的疆域包括西班牙本土、葡萄牙、比利時、荷蘭，意大利中部和南部整個連成片的土地，以及從北美洲加利福尼亞到南美洲合恩角的美洲領土以及中國的呂宋群島。
腓力三世同中國的天啟皇帝差不多，兩人都一樣懶惰成性，唯一不同的是腓力三世最關心享樂，最寵愛的大臣萊爾馬公爵掌握經濟政治軍一切大權，腓力三世終生都受到這位朝臣的左右;而中國的天啟皇帝，最關心的則是木匠活做的好不好？軍國大事，則有一個大字不識的太監魏忠賢在處理。在利用職權斂財和任人唯親方麵，萊馬爾公爵和魏忠賢堪有一比。
萊馬爾公爵為了瓦解瓦解巴倫西亞貴族手中的權利，將50萬摩利斯哥人驅逐出境，而他們許多是西班牙最優秀的農夫和手藝人。這是一個極端自私自利的行為，他給本來就落後的西班牙農業當頭一擊。
西班牙所屬殖民地白銀產量的大幅度下降，農業秩序的極度混亂，官員貪汙盛行，與國外戰爭不斷，導致西班牙王國腓力四世統治期間，帝國處於政治和軍事崩潰的邊緣。
但是，西班牙帝國沒落原因，並不僅僅是因為軍事上的失敗。
西班牙帝國消費主義盛行，西屬美洲所出產白銀和黃金，絕大部分被西班牙貴族階層投在消費領域，並沒有在國內形成工業資本和商業資本，進而建設起強大的工業。